More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2357 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  75.85 
 
 		 765 aa  1184    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  62.47 
 
 		 808 aa  954    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  44.44 
 
 		 751 aa  648    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  100 
 
 		 752 aa  1498    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  57.01 
 
 		 763 aa  884    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  67.02 
 
 		 769 aa  1031    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  62.25 
 
 		 802 aa  933    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  57.59 
 
 		 752 aa  870    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  39.59 
 
 		 820 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  39.9 
 
 		 806 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  39.77 
 
 		 793 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  39.9 
 
 		 793 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  37.09 
 
 		 913 aa  497  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.07 
 
 		 895 aa  491  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.01 
 
 		 892 aa  488  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.08 
 
 		 848 aa  476  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  38.1 
 
 		 888 aa  463  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  35.7 
 
 		 893 aa  451  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.09 
 
 		 895 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  34.23 
 
 		 896 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  32.41 
 
 		 767 aa  395  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.82 
 
 		 920 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  33.11 
 
 		 760 aa  372  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  31.65 
 
 		 770 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.24 
 
 		 770 aa  365  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  32.69 
 
 		 765 aa  364  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  30.43 
 
 		 785 aa  364  3e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.86 
 
 		 769 aa  363  9e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  32.41 
 
 		 785 aa  362  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  31.93 
 
 		 784 aa  360  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.92 
 
 		 765 aa  360  7e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  31.09 
 
 		 758 aa  358  1.9999999999999998e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.47 
 
 		 769 aa  357  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  31.42 
 
 		 791 aa  357  5e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  31.64 
 
 		 768 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  31.64 
 
 		 769 aa  354  4e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  31.23 
 
 		 768 aa  354  4e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  31.85 
 
 		 790 aa  354  4e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  31.64 
 
 		 768 aa  353  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  31.23 
 
 		 769 aa  353  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  31.64 
 
 		 768 aa  353  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  31.23 
 
 		 769 aa  353  5e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  31.64 
 
 		 768 aa  353  5e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.1 
 
 		 769 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  30.1 
 
 		 777 aa  352  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  30.97 
 
 		 769 aa  352  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  30.97 
 
 		 769 aa  352  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.53 
 
 		 750 aa  351  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  30.56 
 
 		 769 aa  350  6e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  30.56 
 
 		 768 aa  350  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.56 
 
 		 769 aa  349  9e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.59 
 
 		 781 aa  348  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.09 
 
 		 768 aa  348  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  31.19 
 
 		 778 aa  345  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  30.19 
 
 		 763 aa  345  2e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  30.89 
 
 		 767 aa  345  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  30.5 
 
 		 786 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.07 
 
 		 784 aa  343  7e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1686  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.25 
 
 		 749 aa  343  9e-93  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.998639  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  30.38 
 
 		 786 aa  343  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  30.82 
 
 		 790 aa  342  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.97 
 
 		 784 aa  340  7e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1750  surface antigen (D15):surface antigen variable number  31.05 
 
 		 761 aa  340  8e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.330816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.22 
 
 		 770 aa  339  9e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  29.4 
 
 		 781 aa  339  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.4 
 
 		 781 aa  339  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.36 
 
 		 765 aa  337  5e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.9 
 
 		 799 aa  336  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.11 
 
 		 787 aa  336  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  29.9 
 
 		 787 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  29.9 
 
 		 787 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.16 
 
 		 758 aa  334  4e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  29.89 
 
 		 798 aa  333  6e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  30.78 
 
 		 788 aa  332  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1796  surface antigen (D15)  29.3 
 
 		 818 aa  332  2e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00389709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  29.61 
 
 		 796 aa  332  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  29.6 
 
 		 765 aa  331  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.12 
 
 		 800 aa  332  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  29.66 
 
 		 794 aa  331  3e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.12 
 
 		 765 aa  330  5.0000000000000004e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  29.12 
 
 		 765 aa  330  6e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  30.26 
 
 		 790 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.56 
 
 		 787 aa  327  5e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  30.01 
 
 		 786 aa  325  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  29.44 
 
 		 845 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  29.91 
 
 		 791 aa  324  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  30.63 
 
 		 766 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  29.35 
 
 		 792 aa  322  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1458  surface antigen (D15)  29.74 
 
 		 780 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  29.33 
 
 		 795 aa  319  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  29.28 
 
 		 785 aa  319  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  29.4 
 
 		 781 aa  318  3e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  28.91 
 
 		 841 aa  318  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.65 
 
 		 780 aa  318  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.4 
 
 		 803 aa  317  4e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  29.7 
 
 		 844 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.01 
 
 		 804 aa  317  5e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847749 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  29.04 
 
 		 779 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0164  OMP85 family outer membrane protein  29.24 
 
 		 739 aa  314  3.9999999999999997e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00465042  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0124  OMP85 family outer membrane protein  29.33 
 
 		 739 aa  313  5.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>