More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0365 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  44.33 
 
 		 785 aa  705    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  100 
 
 		 804 aa  1653    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847749 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  40.5 
 
 		 785 aa  623  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1388  surface antigen (D15)  34.51 
 
 		 795 aa  494  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0577653  normal  0.0157833 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  35.09 
 
 		 794 aa  491  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  35.07 
 
 		 834 aa  485  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  35.74 
 
 		 845 aa  486  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.28 
 
 		 841 aa  479  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.77 
 
 		 785 aa  476  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  34.45 
 
 		 841 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  35.46 
 
 		 843 aa  476  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  32.78 
 
 		 905 aa  473  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  34.74 
 
 		 852 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  35.29 
 
 		 834 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  34.84 
 
 		 843 aa  464  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0751  surface antigen  34.69 
 
 		 840 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  34.76 
 
 		 844 aa  465  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  32.07 
 
 		 887 aa  456  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  33.42 
 
 		 781 aa  438  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.42 
 
 		 803 aa  437  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  34.44 
 
 		 777 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.69 
 
 		 855 aa  434  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  32.88 
 
 		 785 aa  431  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.75 
 
 		 821 aa  420  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  33.06 
 
 		 910 aa  419  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  32.73 
 
 		 778 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  32.53 
 
 		 788 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  31.49 
 
 		 767 aa  409  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5827  putative protective surface antigen precursor (Outer membrane protein D15)  31.57 
 
 		 782 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  30.9 
 
 		 798 aa  391  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.1 
 
 		 857 aa  389  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2146  surface antigen (D15)  31.87 
 
 		 792 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.766596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31 
 
 		 856 aa  386  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.91 
 
 		 829 aa  385  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.1 
 
 		 779 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.65 
 
 		 780 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.7 
 
 		 854 aa  378  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.07 
 
 		 844 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3999  surface antigen (D15)  31.61 
 
 		 782 aa  375  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54012  normal  0.826111 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1369  surface antigen (D15)  30.52 
 
 		 799 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.747321  decreased coverage  0.00880921 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.12 
 
 		 864 aa  373  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2711  putative outer membrane protein  30.49 
 
 		 799 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.902664  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.12 
 
 		 854 aa  372  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1407  surface antigen (D15)  31.03 
 
 		 796 aa  372  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2453  surface antigen (D15)  29.75 
 
 		 772 aa  358  1.9999999999999998e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0002154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1499  hypothetical protein  31.02 
 
 		 748 aa  342  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696254  normal  0.873913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  29.75 
 
 		 769 aa  335  3e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.63 
 
 		 752 aa  334  4e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0863  surface antigen (D15):surface antigen variable number  28 
 
 		 769 aa  334  4e-90  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.78 
 
 		 808 aa  333  9e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.69 
 
 		 802 aa  323  8e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  28.57 
 
 		 765 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  26.61 
 
 		 751 aa  317  5e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0718  OMP85 family outer membrane protein  27.86 
 
 		 744 aa  312  1e-83  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  27.98 
 
 		 790 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  28.01 
 
 		 752 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  28.85 
 
 		 810 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  0.197895 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0250  outer membrane protein assembly factor YaeT  28.85 
 
 		 810 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.609554  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  27.2 
 
 		 790 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00175  hypothetical protein  29.26 
 
 		 810 aa  302  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000980871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3426  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.26 
 
 		 810 aa  302  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480767  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0170  outer membrane protein assembly factor YaeT  29.26 
 
 		 810 aa  302  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000513305  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0181  outer membrane protein assembly factor YaeT  29.26 
 
 		 810 aa  302  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000194171  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00174  hypothetical protein  29.26 
 
 		 810 aa  302  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00018653  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3483  outer membrane protein assembly factor YaeT  29.26 
 
 		 810 aa  302  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000802072  normal  0.102232 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0187  outer membrane protein assembly factor YaeT  29.26 
 
 		 810 aa  302  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00010789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0179  outer membrane protein assembly factor YaeT  29.26 
 
 		 810 aa  302  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000266992  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0188  outer membrane protein assembly factor YaeT  29.4 
 
 		 810 aa  301  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000418762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  27.37 
 
 		 763 aa  300  5e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.63 
 
 		 799 aa  300  6e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  28.93 
 
 		 804 aa  300  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25845  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0265  outer membrane protein assembly factor YaeT  29.07 
 
 		 803 aa  300  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000300024  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  28.85 
 
 		 787 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  28.85 
 
 		 787 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3782  outer membrane protein assembly factor YaeT  28.48 
 
 		 801 aa  299  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000907033  hitchhiker  0.00340919 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2877  surface antigen (D15)  29.09 
 
 		 827 aa  297  5e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000948  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1071  OMP85 family outer membrane protein  26.63 
 
 		 773 aa  297  5e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0702133  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1147  surface antigen  28.64 
 
 		 844 aa  296  1e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003885  normal  0.883859 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1356  surface antigen (D15)  28.37 
 
 		 826 aa  295  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000205975  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0949  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.91 
 
 		 809 aa  294  5e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00135315  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0715  outer membrane protein assembly factor YaeT  28.45 
 
 		 805 aa  293  7e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000733739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.4 
 
 		 769 aa  293  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0262  outer membrane protein assembly factor YaeT  28.82 
 
 		 803 aa  293  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1458  surface antigen (D15)  27.65 
 
 		 827 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000234879  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3157  outer membrane protein assembly factor YaeT  28.39 
 
 		 805 aa  292  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0017892  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.96 
 
 		 770 aa  291  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  28 
 
 		 781 aa  291  4e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2972  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.28 
 
 		 807 aa  291  4e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0353111  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28 
 
 		 781 aa  291  4e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  28.81 
 
 		 770 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2633  surface antigen (D15)  27.69 
 
 		 826 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000445373  normal  0.203506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2700  surface antigen (D15)  27.69 
 
 		 826 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000360043  hitchhiker  0.00504138 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2894  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.77 
 
 		 826 aa  290  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172199  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1489  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.02 
 
 		 780 aa  290  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1489  surface antigen (D15)  27.77 
 
 		 826 aa  290  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1453  surface antigen (D15)  27.77 
 
 		 826 aa  290  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000244779  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3273  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.59 
 
 		 827 aa  289  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.53 
 
 		 758 aa  289  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.66 
 
 		 770 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3352  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.7 
 
 		 815 aa  288  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>