More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3972 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  100 
 
 		 848 aa  1711    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  46.06 
 
 		 820 aa  663    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  44.11 
 
 		 793 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  43.62 
 
 		 806 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  43.99 
 
 		 793 aa  625  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  37.48 
 
 		 765 aa  480  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.59 
 
 		 808 aa  478  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.62 
 
 		 802 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  36.46 
 
 		 752 aa  464  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  35.14 
 
 		 769 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  34.13 
 
 		 763 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.84 
 
 		 752 aa  435  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  32.74 
 
 		 913 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  31.26 
 
 		 751 aa  398  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.76 
 
 		 892 aa  382  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  31.3 
 
 		 888 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.73 
 
 		 895 aa  362  1e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.24 
 
 		 895 aa  340  9e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  28.73 
 
 		 893 aa  334  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  28.78 
 
 		 770 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  29.83 
 
 		 767 aa  322  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.08 
 
 		 769 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  28.46 
 
 		 769 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  28.46 
 
 		 768 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  28.46 
 
 		 769 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.68 
 
 		 750 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  28.46 
 
 		 768 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  28.3 
 
 		 758 aa  314  3.9999999999999997e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.55 
 
 		 765 aa  314  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.25 
 
 		 770 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  28.46 
 
 		 768 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  28.46 
 
 		 768 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  28.46 
 
 		 768 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  28.46 
 
 		 769 aa  313  9e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  28.55 
 
 		 765 aa  311  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  28.59 
 
 		 769 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  28.59 
 
 		 769 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.46 
 
 		 769 aa  310  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.25 
 
 		 769 aa  310  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.09 
 
 		 768 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  28.21 
 
 		 769 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  28.45 
 
 		 794 aa  308  3e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  28.09 
 
 		 768 aa  308  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  27.22 
 
 		 790 aa  307  6e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.25 
 
 		 770 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.39 
 
 		 781 aa  304  5.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28 
 
 		 829 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.58 
 
 		 769 aa  303  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  27.12 
 
 		 896 aa  303  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  26.75 
 
 		 767 aa  303  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  28.24 
 
 		 760 aa  301  3e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1750  surface antigen (D15):surface antigen variable number  27.85 
 
 		 761 aa  301  4e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.330816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1388  surface antigen (D15)  29.9 
 
 		 795 aa  300  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0577653  normal  0.0157833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  28.47 
 
 		 784 aa  297  7e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.92 
 
 		 784 aa  296  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.81 
 
 		 857 aa  296  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  27.8 
 
 		 791 aa  294  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  28.44 
 
 		 791 aa  293  7e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.93 
 
 		 854 aa  293  8e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.58 
 
 		 864 aa  293  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.58 
 
 		 854 aa  293  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.63 
 
 		 758 aa  292  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  27.2 
 
 		 905 aa  291  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  26.51 
 
 		 786 aa  290  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  28.99 
 
 		 787 aa  290  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  27.59 
 
 		 766 aa  289  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  28.87 
 
 		 787 aa  288  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.25 
 
 		 797 aa  287  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  26.35 
 
 		 794 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  28.29 
 
 		 795 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1766  surface antigen (D15)  27.81 
 
 		 766 aa  286  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0726033  normal  0.0207518 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.87 
 
 		 799 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.31 
 
 		 781 aa  284  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  25.31 
 
 		 781 aa  284  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.02 
 
 		 920 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  27.05 
 
 		 786 aa  284  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  27.05 
 
 		 786 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.29 
 
 		 787 aa  283  9e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2687  surface antigen (D15)  27.71 
 
 		 784 aa  283  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.379638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  27.31 
 
 		 792 aa  283  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.27 
 
 		 784 aa  280  7e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  27.31 
 
 		 777 aa  279  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  26.5 
 
 		 796 aa  279  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  26.22 
 
 		 763 aa  278  3e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  27.03 
 
 		 790 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2607  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.91 
 
 		 811 aa  276  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.745531  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  27.21 
 
 		 779 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  27.92 
 
 		 781 aa  275  3e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.92 
 
 		 803 aa  274  5.000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.11 
 
 		 765 aa  274  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  27.18 
 
 		 765 aa  274  5.000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  26.11 
 
 		 765 aa  274  6e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.92 
 
 		 800 aa  273  7e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  27.61 
 
 		 785 aa  273  8.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  28.66 
 
 		 788 aa  273  8.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.37 
 
 		 765 aa  273  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.72 
 
 		 844 aa  272  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0724  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.45 
 
 		 803 aa  272  2e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.000000000000238666  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0623  outer membrane protein assembly factor  25.45 
 
 		 803 aa  272  2e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000661464  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  26.2 
 
 		 887 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>