More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3381 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  58.25 
 
 		 892 aa  1056    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  44.84 
 
 		 896 aa  765    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  40.37 
 
 		 920 aa  670    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  48.51 
 
 		 893 aa  822    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  100 
 
 		 895 aa  1822    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  45.3 
 
 		 895 aa  810    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  33.08 
 
 		 913 aa  511  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  32.89 
 
 		 888 aa  498  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  35.07 
 
 		 752 aa  481  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  34.44 
 
 		 769 aa  476  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  33.55 
 
 		 765 aa  465  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.82 
 
 		 808 aa  452  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.48 
 
 		 802 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  32.71 
 
 		 751 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.62 
 
 		 752 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  31.07 
 
 		 763 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  31.61 
 
 		 820 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.73 
 
 		 848 aa  362  1e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.82 
 
 		 793 aa  361  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  30.82 
 
 		 806 aa  360  6e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.43 
 
 		 793 aa  356  1e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  29.67 
 
 		 767 aa  328  3e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  31.53 
 
 		 763 aa  323  8e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  28.57 
 
 		 765 aa  310  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  29.3 
 
 		 770 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2334  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.8 
 
 		 763 aa  304  4.0000000000000003e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117402 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.04 
 
 		 765 aa  304  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.43 
 
 		 770 aa  304  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.04 
 
 		 750 aa  303  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.96 
 
 		 784 aa  302  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1750  surface antigen (D15):surface antigen variable number  28.19 
 
 		 761 aa  296  9e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.330816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  28.78 
 
 		 768 aa  296  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  28.06 
 
 		 768 aa  296  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  28.78 
 
 		 769 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  28.78 
 
 		 769 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  27.93 
 
 		 769 aa  295  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  28.78 
 
 		 768 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.78 
 
 		 769 aa  295  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  28.78 
 
 		 769 aa  295  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  28.78 
 
 		 768 aa  295  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  28.78 
 
 		 768 aa  295  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  28.78 
 
 		 768 aa  295  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  27.8 
 
 		 769 aa  295  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  27.8 
 
 		 769 aa  295  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.18 
 
 		 769 aa  294  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.06 
 
 		 768 aa  293  8e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.8 
 
 		 769 aa  293  8e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  27.63 
 
 		 791 aa  293  9e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  30.01 
 
 		 785 aa  293  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  28.96 
 
 		 787 aa  292  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  27.77 
 
 		 784 aa  292  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  28.96 
 
 		 787 aa  292  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.55 
 
 		 769 aa  292  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.26 
 
 		 781 aa  291  4e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.83 
 
 		 799 aa  290  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  28.57 
 
 		 760 aa  289  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1501  OMP85 family outer membrane protein  28.89 
 
 		 757 aa  288  2.9999999999999996e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1686  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.61 
 
 		 749 aa  288  4e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.998639  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  28.79 
 
 		 788 aa  287  5.999999999999999e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1458  surface antigen (D15)  29.4 
 
 		 780 aa  285  3.0000000000000004e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  28.01 
 
 		 767 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.43 
 
 		 770 aa  285  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  28.9 
 
 		 790 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.97 
 
 		 765 aa  283  8.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  27.32 
 
 		 791 aa  283  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1757  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.09 
 
 		 759 aa  282  2e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000442418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  26.72 
 
 		 794 aa  282  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0942  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.49 
 
 		 751 aa  281  5e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000918625  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  26.43 
 
 		 792 aa  280  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.76 
 
 		 784 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  27.34 
 
 		 786 aa  279  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  26.18 
 
 		 758 aa  279  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  27.31 
 
 		 795 aa  278  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.11 
 
 		 797 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.75 
 
 		 781 aa  276  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  26.75 
 
 		 781 aa  276  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  27 
 
 		 790 aa  276  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.86 
 
 		 745 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  28.22 
 
 		 794 aa  275  4.0000000000000004e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  27.44 
 
 		 786 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  27.44 
 
 		 786 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2607  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.02 
 
 		 811 aa  273  8.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.745531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.82 
 
 		 800 aa  273  9e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0215  conserved hypothetical protein, putative outer membrane protein  27.77 
 
 		 738 aa  273  1e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0238562  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  27.61 
 
 		 845 aa  273  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.87 
 
 		 841 aa  273  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.53 
 
 		 787 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  26.72 
 
 		 765 aa  272  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1971  putative outer membrane signal peptide protein  27.7 
 
 		 781 aa  272  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.208049  normal  0.130084 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.39 
 
 		 787 aa  272  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2842  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.18 
 
 		 770 aa  271  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  27.77 
 
 		 790 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  27.76 
 
 		 844 aa  271  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  26.49 
 
 		 834 aa  270  8.999999999999999e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  26.4 
 
 		 841 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2687  surface antigen (D15)  27.38 
 
 		 784 aa  269  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.379638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1574  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.69 
 
 		 786 aa  268  5e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.09 
 
 		 803 aa  267  5.999999999999999e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  26.07 
 
 		 788 aa  267  7e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0660  surface antigen (D15)  30.24 
 
 		 755 aa  266  2e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.665209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>