More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1501 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  50.98 
 
 		 745 aa  732    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0124  OMP85 family outer membrane protein  57.07 
 
 		 739 aa  878    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0215  conserved hypothetical protein, putative outer membrane protein  54.43 
 
 		 738 aa  817    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0238562  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0164  OMP85 family outer membrane protein  57.07 
 
 		 739 aa  876    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00465042  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1757  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  61.82 
 
 		 759 aa  946    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000442418  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0142  OMP85 family outer membrane protein  56.54 
 
 		 739 aa  864    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0561822  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0942  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  63.45 
 
 		 751 aa  928    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000918625  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1686  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  60.11 
 
 		 749 aa  943    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.998639  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1501  OMP85 family outer membrane protein  100 
 
 		 757 aa  1518    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0660  surface antigen (D15)  38.05 
 
 		 755 aa  503  1e-141  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.665209  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.63 
 
 		 752 aa  326  9e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  28.85 
 
 		 763 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  27.95 
 
 		 765 aa  306  6e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.23 
 
 		 892 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  26.41 
 
 		 751 aa  304  5.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.86 
 
 		 808 aa  302  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  28.12 
 
 		 752 aa  297  4e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.63 
 
 		 802 aa  293  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  28.22 
 
 		 763 aa  289  1e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.89 
 
 		 895 aa  287  4e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  27.83 
 
 		 769 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.75 
 
 		 765 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  28.02 
 
 		 893 aa  270  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.63 
 
 		 750 aa  270  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  28.46 
 
 		 781 aa  264  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  26.72 
 
 		 913 aa  262  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  28.23 
 
 		 768 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  28.23 
 
 		 769 aa  262  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  28.23 
 
 		 768 aa  262  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  28.23 
 
 		 768 aa  262  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  28.23 
 
 		 768 aa  262  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  27.58 
 
 		 765 aa  261  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  28.23 
 
 		 768 aa  260  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.38 
 
 		 787 aa  260  7e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.79 
 
 		 770 aa  260  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  28.1 
 
 		 769 aa  259  9e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  28.1 
 
 		 769 aa  259  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  27.27 
 
 		 784 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27 
 
 		 770 aa  258  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  27.41 
 
 		 767 aa  258  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.83 
 
 		 769 aa  257  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  25.65 
 
 		 790 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  26.41 
 
 		 758 aa  253  7e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  25.72 
 
 		 785 aa  253  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.27 
 
 		 758 aa  252  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2540  surface antigen (D15)  26.68 
 
 		 772 aa  252  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.31 
 
 		 787 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.52 
 
 		 781 aa  251  4e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.07 
 
 		 769 aa  251  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.59 
 
 		 895 aa  251  4e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  27.94 
 
 		 768 aa  250  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  27.94 
 
 		 769 aa  250  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  27.94 
 
 		 769 aa  250  7e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  27.94 
 
 		 769 aa  250  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  27.37 
 
 		 791 aa  249  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.31 
 
 		 781 aa  249  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  25.31 
 
 		 781 aa  249  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.88 
 
 		 768 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.17 
 
 		 769 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3782  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.37 
 
 		 801 aa  246  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000907033  hitchhiker  0.00340919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  27.02 
 
 		 786 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  26.29 
 
 		 788 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  27.02 
 
 		 786 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0265  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.89 
 
 		 803 aa  244  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000300024  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0250  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.91 
 
 		 810 aa  244  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.609554  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.91 
 
 		 810 aa  244  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  0.197895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.03 
 
 		 784 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3352  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.07 
 
 		 815 aa  241  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346772  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  25.59 
 
 		 767 aa  241  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  28.37 
 
 		 896 aa  240  8e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.98 
 
 		 804 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25845  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  26.71 
 
 		 888 aa  239  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002754  outer membrane protein assembly factor YaeT precursor  25.74 
 
 		 804 aa  239  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604223  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0262  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.64 
 
 		 803 aa  239  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0322  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.19 
 
 		 784 aa  238  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3157  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.4 
 
 		 805 aa  239  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0017892  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1843  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.25 
 
 		 803 aa  239  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000194278  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  27 
 
 		 794 aa  239  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  25.48 
 
 		 770 aa  238  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1750  surface antigen (D15):surface antigen variable number  26.84 
 
 		 761 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.330816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0357  outer membrane antigen  25.06 
 
 		 784 aa  237  5.0000000000000005e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.433119  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  26.28 
 
 		 787 aa  237  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1489  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.19 
 
 		 780 aa  237  6e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.14 
 
 		 769 aa  237  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  25.61 
 
 		 777 aa  237  7e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  25.79 
 
 		 806 aa  236  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.51 
 
 		 797 aa  236  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  26.28 
 
 		 787 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.79 
 
 		 793 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.09 
 
 		 799 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.79 
 
 		 793 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2972  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.18 
 
 		 807 aa  234  6e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0353111  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03229  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.19 
 
 		 804 aa  234  6e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0949  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.91 
 
 		 809 aa  233  7.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00135315  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0188  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.67 
 
 		 810 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000418762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  26.25 
 
 		 760 aa  233  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  26.74 
 
 		 790 aa  232  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.45 
 
 		 803 aa  231  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1021  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.96 
 
 		 795 aa  231  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000998639  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3427  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.96 
 
 		 795 aa  231  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000902719  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>