More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1574 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1574  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  100 
 
 		 786 aa  1569    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0636  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.06 
 
 		 775 aa  485  1e-135  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0791016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  27.79 
 
 		 888 aa  304  4.0000000000000003e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  29.02 
 
 		 752 aa  302  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  30.24 
 
 		 769 aa  296  8e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  28.83 
 
 		 765 aa  291  5.0000000000000004e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.65 
 
 		 808 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.69 
 
 		 895 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.6 
 
 		 752 aa  266  8e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.78 
 
 		 892 aa  265  3e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.12 
 
 		 802 aa  264  6e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  27.52 
 
 		 751 aa  262  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  27.39 
 
 		 763 aa  260  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  25.89 
 
 		 893 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  26.34 
 
 		 770 aa  243  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1458  surface antigen (D15)  25.03 
 
 		 780 aa  239  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  25.93 
 
 		 791 aa  238  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.29 
 
 		 769 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1750  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.13 
 
 		 761 aa  233  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.330816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.85 
 
 		 765 aa  233  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  26.17 
 
 		 913 aa  230  6e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.03 
 
 		 770 aa  229  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  24.97 
 
 		 767 aa  229  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.19 
 
 		 784 aa  229  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.39 
 
 		 768 aa  228  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  24.42 
 
 		 769 aa  228  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  24.29 
 
 		 768 aa  226  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.84 
 
 		 769 aa  226  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  24.29 
 
 		 769 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  24.29 
 
 		 769 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.16 
 
 		 769 aa  225  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.16 
 
 		 769 aa  226  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.68 
 
 		 765 aa  225  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  26.92 
 
 		 790 aa  224  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  25.68 
 
 		 765 aa  225  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1766  surface antigen (D15)  26.5 
 
 		 766 aa  224  7e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0726033  normal  0.0207518 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  24.78 
 
 		 768 aa  223  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  24.65 
 
 		 769 aa  223  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  24.65 
 
 		 769 aa  223  9e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  24.9 
 
 		 768 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.27 
 
 		 770 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.9 
 
 		 793 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  24.78 
 
 		 769 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.62 
 
 		 793 aa  221  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  24.77 
 
 		 806 aa  221  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  24.78 
 
 		 768 aa  221  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  24.78 
 
 		 768 aa  221  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  24.78 
 
 		 768 aa  221  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  24.76 
 
 		 781 aa  220  7e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.68 
 
 		 920 aa  220  7e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.76 
 
 		 781 aa  220  7e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  25.03 
 
 		 820 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  25.22 
 
 		 763 aa  219  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2687  surface antigen (D15)  25.54 
 
 		 784 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.379638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.55 
 
 		 895 aa  216  9e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  26.34 
 
 		 765 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1796  surface antigen (D15)  24.97 
 
 		 818 aa  214  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00389709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  26.04 
 
 		 760 aa  214  7e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  25.19 
 
 		 896 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2447  OMP85 family outer membrane protein  24.68 
 
 		 796 aa  213  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.019137  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  24.06 
 
 		 790 aa  210  8e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  22.83 
 
 		 792 aa  209  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1529  putative surface antigen (D15)  23.13 
 
 		 803 aa  209  2e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000190996  normal  0.0121061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.57 
 
 		 784 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3782  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.09 
 
 		 801 aa  208  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000907033  hitchhiker  0.00340919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  23.57 
 
 		 786 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  23.57 
 
 		 786 aa  207  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.51 
 
 		 784 aa  207  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.98 
 
 		 758 aa  207  7e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  25.9 
 
 		 779 aa  207  9e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  24.16 
 
 		 787 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  25.06 
 
 		 765 aa  206  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1074  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.28 
 
 		 795 aa  206  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000979052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3427  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.28 
 
 		 795 aa  206  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000902719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  24.16 
 
 		 787 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1021  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.28 
 
 		 795 aa  206  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000998639  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1446  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.33 
 
 		 800 aa  205  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.07 
 
 		 787 aa  204  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  24.58 
 
 		 767 aa  204  7e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  23.51 
 
 		 766 aa  203  8e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.06 
 
 		 765 aa  203  8e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  23.24 
 
 		 794 aa  203  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.24 
 
 		 799 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  24.28 
 
 		 786 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  23.93 
 
 		 791 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0250  outer membrane protein assembly factor YaeT  25 
 
 		 810 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.609554  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1708  surface antigen (D15)  22.63 
 
 		 807 aa  202  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  25 
 
 		 810 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  0.197895 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.04 
 
 		 750 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.27 
 
 		 797 aa  202  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  23.59 
 
 		 796 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0397  surface antigen (D15)  26.69 
 
 		 830 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00277353  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0164  OMP85 family outer membrane protein  26.56 
 
 		 739 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00465042  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.28 
 
 		 781 aa  200  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  25.39 
 
 		 905 aa  199  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0715  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.64 
 
 		 805 aa  199  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000733739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  24.77 
 
 		 785 aa  198  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0124  OMP85 family outer membrane protein  26.43 
 
 		 739 aa  198  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1489  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.86 
 
 		 780 aa  198  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0142  OMP85 family outer membrane protein  26.72 
 
 		 739 aa  197  5.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0561822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>