More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2334 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2334  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  100 
 
 
763 aa  1529    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0117402 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1053  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.76 
 
 
807 aa  369  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.63 
 
 
808 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.8 
 
 
895 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  29.37 
 
 
888 aa  301  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  30.14 
 
 
765 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  30.92 
 
 
752 aa  298  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.37 
 
 
802 aa  293  8e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.68 
 
 
752 aa  293  8e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.73 
 
 
895 aa  283  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  28.74 
 
 
769 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  28.44 
 
 
763 aa  272  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.46 
 
 
892 aa  267  5.999999999999999e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  28.55 
 
 
913 aa  266  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  27.79 
 
 
893 aa  262  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  29.2 
 
 
785 aa  257  6e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.26 
 
 
793 aa  252  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  28.13 
 
 
806 aa  251  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.13 
 
 
793 aa  250  7e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  28.02 
 
 
751 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.8 
 
 
920 aa  239  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  27.06 
 
 
781 aa  239  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.48 
 
 
803 aa  239  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  27.95 
 
 
820 aa  238  4e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.4 
 
 
785 aa  238  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  26.82 
 
 
778 aa  236  8e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  27.65 
 
 
788 aa  233  7.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  26.87 
 
 
777 aa  232  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  28.64 
 
 
887 aa  232  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0512  outer membrane protein, putative  26.52 
 
 
792 aa  231  3e-59  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  26.51 
 
 
785 aa  231  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0636  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.66 
 
 
775 aa  229  2e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0791016  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  28.06 
 
 
834 aa  226  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  26.41 
 
 
896 aa  226  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.82 
 
 
772 aa  224  6e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  25.36 
 
 
767 aa  223  7e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  25.8 
 
 
834 aa  223  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0751  surface antigen  25.58 
 
 
840 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0463  surface antigen family protein  26.53 
 
 
858 aa  221  5e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  27.85 
 
 
910 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  25.8 
 
 
843 aa  219  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  26.59 
 
 
843 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1388  surface antigen (D15)  28.16 
 
 
795 aa  216  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0577653  normal  0.0157833 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1751  surface antigen family protein  26.15 
 
 
820 aa  213  7.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.98 
 
 
841 aa  213  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  26.95 
 
 
785 aa  212  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.09 
 
 
821 aa  211  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.35 
 
 
848 aa  211  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.17 
 
 
855 aa  211  5e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0432  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.91 
 
 
834 aa  210  6e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  25.83 
 
 
841 aa  210  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  25.37 
 
 
844 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  24.57 
 
 
845 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  26.02 
 
 
905 aa  206  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.13 
 
 
780 aa  205  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  27.98 
 
 
852 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.06 
 
 
784 aa  200  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.38 
 
 
829 aa  200  9e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  24.84 
 
 
798 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.1 
 
 
781 aa  200  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  25.1 
 
 
781 aa  200  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  24.97 
 
 
791 aa  198  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  25.79 
 
 
765 aa  197  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  25.53 
 
 
770 aa  197  7e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.86 
 
 
857 aa  196  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.78 
 
 
831 aa  195  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000452148  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  25.06 
 
 
794 aa  195  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5827  putative protective surface antigen precursor (Outer membrane protein D15)  26.06 
 
 
782 aa  195  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.94 
 
 
750 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.99 
 
 
779 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0397  surface antigen (D15)  26.56 
 
 
830 aa  193  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00277353  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.03 
 
 
765 aa  192  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  24.72 
 
 
787 aa  191  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  24.72 
 
 
787 aa  191  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1574  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.46 
 
 
786 aa  189  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1446  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.53 
 
 
800 aa  189  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.72 
 
 
799 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1808  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.18 
 
 
868 aa  188  3e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.85 
 
 
804 aa  182  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0847749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.04 
 
 
856 aa  182  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.72 
 
 
854 aa  182  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  24.97 
 
 
790 aa  182  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.01 
 
 
844 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.23 
 
 
864 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.23 
 
 
854 aa  181  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.89 
 
 
821 aa  181  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000592139  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1356  surface antigen (D15)  22.78 
 
 
826 aa  181  7e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000205975  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0248  surface antigen (D15)  24.63 
 
 
926 aa  180  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  25.16 
 
 
769 aa  180  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  24.97 
 
 
790 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  25.16 
 
 
769 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  25.16 
 
 
769 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.81 
 
 
769 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.1 
 
 
765 aa  179  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0400  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.73 
 
 
827 aa  179  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000108596  unclonable  0.0000045929 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  25.16 
 
 
760 aa  179  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  25.16 
 
 
768 aa  179  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.61 
 
 
758 aa  179  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2633  surface antigen (D15)  22.72 
 
 
826 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000445373  normal  0.203506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2700  surface antigen (D15)  22.72 
 
 
826 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000360043  hitchhiker  0.00504138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>