More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0434 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0400  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  69.8 
 
 		 827 aa  1198    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000108596  unclonable  0.0000045929 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0432  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  61.62 
 
 		 834 aa  1009    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  62.5 
 
 		 831 aa  1073    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000452148  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1751  surface antigen family protein  61.59 
 
 		 820 aa  1007    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0463  surface antigen family protein  61.74 
 
 		 858 aa  1019    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  100 
 
 		 821 aa  1675    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000592139  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0397  surface antigen (D15)  60.84 
 
 		 830 aa  1008    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00277353  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4388  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.41 
 
 		 865 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1959  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.42 
 
 		 836 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.364204  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.41 
 
 		 865 aa  442  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.518377  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3412  outer membrane protein; surface antigen  34.74 
 
 		 848 aa  441  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1052  surface antigen variable number repeat protein  32.8 
 
 		 914 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000329593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1357  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.63 
 
 		 844 aa  409  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0741004  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0986  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.07 
 
 		 838 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04315  putative outer membrane protein  31.9 
 
 		 860 aa  377  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0191  outer membrane protein, putative  31.61 
 
 		 891 aa  367  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.796772 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0782  hypothetical protein  29.93 
 
 		 895 aa  354  4e-96  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1690  surface antigen (D15)  33.07 
 
 		 900 aa  284  4.0000000000000003e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  26.76 
 
 		 752 aa  239  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.84 
 
 		 892 aa  229  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  26.25 
 
 		 765 aa  226  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  26.28 
 
 		 769 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  26.57 
 
 		 913 aa  219  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  25.73 
 
 		 888 aa  219  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  26.62 
 
 		 777 aa  213  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  26.52 
 
 		 751 aa  210  9e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2540  surface antigen (D15)  25.21 
 
 		 772 aa  206  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.75 
 
 		 895 aa  204  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.22 
 
 		 808 aa  204  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3273  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.67 
 
 		 827 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2894  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.77 
 
 		 826 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172199  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1489  surface antigen (D15)  26.77 
 
 		 826 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1453  surface antigen (D15)  26.77 
 
 		 826 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000244779  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2807  surface antigen (D15)  26.97 
 
 		 826 aa  201  6e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000285002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2633  surface antigen (D15)  26.49 
 
 		 826 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000445373  normal  0.203506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2700  surface antigen (D15)  26.49 
 
 		 826 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000360043  hitchhiker  0.00504138 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1458  surface antigen (D15)  26.49 
 
 		 827 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000234879  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1356  surface antigen (D15)  26.21 
 
 		 826 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000205975  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  25.74 
 
 		 763 aa  198  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1637  surface antigen  26.69 
 
 		 826 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.57 
 
 		 802 aa  197  9e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3782  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.59 
 
 		 801 aa  196  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000907033  hitchhiker  0.00340919 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2627  surface antigen (D15)  25.78 
 
 		 827 aa  196  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0218715  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0949  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.32 
 
 		 809 aa  195  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00135315  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25 
 
 		 780 aa  194  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1147  surface antigen  25.61 
 
 		 844 aa  193  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003885  normal  0.883859 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.22 
 
 		 752 aa  193  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3352  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.83 
 
 		 815 aa  192  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346772  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1278  surface antigen (D15)  26.34 
 
 		 827 aa  192  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00357264  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2877  surface antigen (D15)  25.48 
 
 		 827 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000948  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.19 
 
 		 848 aa  192  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.6 
 
 		 779 aa  191  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  26.59 
 
 		 785 aa  191  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0265  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.7 
 
 		 803 aa  191  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000300024  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0715  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.69 
 
 		 805 aa  190  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000733739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1053  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.05 
 
 		 807 aa  190  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3157  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.18 
 
 		 805 aa  189  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0017892  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.27 
 
 		 765 aa  189  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  24.35 
 
 		 763 aa  188  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.84 
 
 		 895 aa  188  4e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0262  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.53 
 
 		 803 aa  187  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0250  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.49 
 
 		 810 aa  187  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.609554  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.49 
 
 		 810 aa  187  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  0.197895 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3153  surface antigen (D15)  25.89 
 
 		 827 aa  187  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000352533  normal  0.0112151 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  25.06 
 
 		 790 aa  187  7e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.56 
 
 		 804 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25845  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  26.12 
 
 		 784 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  25.63 
 
 		 788 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  24.88 
 
 		 785 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  25.18 
 
 		 765 aa  185  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.12 
 
 		 769 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.07 
 
 		 781 aa  183  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0188  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.58 
 
 		 810 aa  182  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000418762  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00175  hypothetical protein  26.59 
 
 		 810 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000980871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3426  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.59 
 
 		 810 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480767  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0187  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.59 
 
 		 810 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00010789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00174  hypothetical protein  26.59 
 
 		 810 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00018653  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0170  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.59 
 
 		 810 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000513305  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0181  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.59 
 
 		 810 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000194171  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3483  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.59 
 
 		 810 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000802072  normal  0.102232 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0179  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.59 
 
 		 810 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000266992  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2334  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.89 
 
 		 763 aa  181  7e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117402 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  25.97 
 
 		 791 aa  180  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.12 
 
 		 784 aa  180  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.21 
 
 		 758 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  23.91 
 
 		 770 aa  179  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.75 
 
 		 770 aa  179  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  24.89 
 
 		 905 aa  179  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1562  surface antigen (D15)  25.18 
 
 		 827 aa  179  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000380588  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.25 
 
 		 750 aa  178  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  24.69 
 
 		 910 aa  179  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  25.98 
 
 		 790 aa  178  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.86 
 
 		 803 aa  178  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2589  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  23.92 
 
 		 896 aa  178  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0085313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.63 
 
 		 799 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  25.99 
 
 		 758 aa  177  7e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3427  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.55 
 
 		 795 aa  177  9e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000902719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1074  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.55 
 
 		 795 aa  177  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000979052  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1021  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.55 
 
 		 795 aa  177  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000998639  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  25 
 
 		 778 aa  176  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>