More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0432 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  71.41 
 
 		 831 aa  1244    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000452148  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1751  surface antigen family protein  68.66 
 
 		 820 aa  1167    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0463  surface antigen family protein  67.96 
 
 		 858 aa  1211    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0397  surface antigen (D15)  69.77 
 
 		 830 aa  1230    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00277353  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0400  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  62.74 
 
 		 827 aa  1033    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000108596  unclonable  0.0000045929 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  60.61 
 
 		 821 aa  1021    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000592139  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0432  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  100 
 
 		 834 aa  1701    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.01 
 
 		 865 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.518377  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4388  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.84 
 
 		 865 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1959  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.58 
 
 		 836 aa  429  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.364204  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0986  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.33 
 
 		 838 aa  419  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1357  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.02 
 
 		 844 aa  410  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0741004  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3412  outer membrane protein; surface antigen  32.72 
 
 		 848 aa  410  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1052  surface antigen variable number repeat protein  30.74 
 
 		 914 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000329593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0782  hypothetical protein  32.35 
 
 		 895 aa  393  1e-108  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04315  putative outer membrane protein  32.63 
 
 		 860 aa  381  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0191  outer membrane protein, putative  30.23 
 
 		 891 aa  372  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.796772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1690  surface antigen (D15)  33.5 
 
 		 900 aa  303  7.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  28.64 
 
 		 765 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  28.16 
 
 		 752 aa  252  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  27.8 
 
 		 913 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  27.03 
 
 		 769 aa  241  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  26.38 
 
 		 888 aa  229  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.23 
 
 		 895 aa  223  9e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2334  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.36 
 
 		 763 aa  214  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117402 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.77 
 
 		 808 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  27.72 
 
 		 763 aa  213  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.95 
 
 		 802 aa  213  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.09 
 
 		 892 aa  209  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.06 
 
 		 752 aa  209  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3273  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.14 
 
 		 827 aa  204  7e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  25.79 
 
 		 790 aa  200  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0949  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.18 
 
 		 809 aa  199  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00135315  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2877  surface antigen (D15)  25.57 
 
 		 827 aa  198  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000948  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2807  surface antigen (D15)  25.6 
 
 		 826 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000285002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2540  surface antigen (D15)  25.61 
 
 		 772 aa  197  7e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  25.63 
 
 		 751 aa  197  9e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1356  surface antigen (D15)  25.46 
 
 		 826 aa  196  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000205975  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2633  surface antigen (D15)  25.75 
 
 		 826 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000445373  normal  0.203506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2700  surface antigen (D15)  25.75 
 
 		 826 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000360043  hitchhiker  0.00504138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1453  surface antigen (D15)  24.94 
 
 		 826 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000244779  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2627  surface antigen (D15)  24.61 
 
 		 827 aa  196  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0218715  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  25.31 
 
 		 763 aa  196  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2894  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.94 
 
 		 826 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172199  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1489  surface antigen (D15)  24.94 
 
 		 826 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1147  surface antigen  25.46 
 
 		 844 aa  195  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003885  normal  0.883859 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  25.4 
 
 		 887 aa  194  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.09 
 
 		 758 aa  194  7e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1458  surface antigen (D15)  24.97 
 
 		 827 aa  194  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000234879  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  26.55 
 
 		 777 aa  193  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  25.96 
 
 		 834 aa  192  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1637  surface antigen  25.32 
 
 		 826 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2972  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.76 
 
 		 807 aa  192  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0353111  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3782  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.3 
 
 		 801 aa  192  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000907033  hitchhiker  0.00340919 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3157  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.49 
 
 		 805 aa  191  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0017892  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  24.88 
 
 		 786 aa  191  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1278  surface antigen (D15)  25.6 
 
 		 827 aa  189  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00357264  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1053  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.14 
 
 		 807 aa  188  3e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0265  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.88 
 
 		 803 aa  188  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000300024  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3352  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.8 
 
 		 815 aa  187  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346772  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  24.57 
 
 		 792 aa  187  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3153  surface antigen (D15)  24.3 
 
 		 827 aa  187  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000352533  normal  0.0112151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.25 
 
 		 785 aa  187  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.5 
 
 		 855 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0715  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.03 
 
 		 805 aa  186  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000733739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.3 
 
 		 784 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  24.36 
 
 		 770 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.49 
 
 		 804 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25845  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  23.83 
 
 		 905 aa  185  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0262  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.64 
 
 		 803 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  24.47 
 
 		 910 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0751  surface antigen  25.17 
 
 		 840 aa  184  7e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  27.08 
 
 		 778 aa  183  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.1 
 
 		 793 aa  183  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.28 
 
 		 769 aa  183  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.57 
 
 		 848 aa  183  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  23.47 
 
 		 791 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  24.9 
 
 		 806 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.92 
 
 		 895 aa  182  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.53 
 
 		 797 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.03 
 
 		 769 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  25.95 
 
 		 785 aa  182  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  24.07 
 
 		 786 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  24.07 
 
 		 786 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.04 
 
 		 810 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  0.197895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  24.32 
 
 		 794 aa  181  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0250  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.04 
 
 		 810 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.609554  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0623  outer membrane protein assembly factor  25.67 
 
 		 803 aa  181  5.999999999999999e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000661464  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.49 
 
 		 784 aa  181  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0724  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.67 
 
 		 803 aa  181  5.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.000000000000238666  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.91 
 
 		 779 aa  180  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  23.59 
 
 		 852 aa  180  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  25.1 
 
 		 844 aa  180  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.99 
 
 		 787 aa  180  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1574  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.22 
 
 		 786 aa  179  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  24.34 
 
 		 787 aa  180  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  24.8 
 
 		 841 aa  180  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0188  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.73 
 
 		 810 aa  180  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000418762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.97 
 
 		 793 aa  180  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  25.07 
 
 		 845 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>