267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4434 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0986  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  44.91 
 
 		 838 aa  683    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1052  surface antigen variable number repeat protein  42.04 
 
 		 914 aa  670    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000329593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4388  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  60.98 
 
 		 865 aa  1066    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3412  outer membrane protein; surface antigen  47.5 
 
 		 848 aa  795    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  100 
 
 		 865 aa  1766    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.518377  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04315  putative outer membrane protein  42.01 
 
 		 860 aa  572  1.0000000000000001e-162  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1357  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.79 
 
 		 844 aa  567  1e-160  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0741004  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0191  outer membrane protein, putative  34.83 
 
 		 891 aa  518  1.0000000000000001e-145  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.796772 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0782  hypothetical protein  35.66 
 
 		 895 aa  511  1e-143  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1959  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.57 
 
 		 836 aa  484  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.364204  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.59 
 
 		 831 aa  474  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000452148  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0397  surface antigen (D15)  34.99 
 
 		 830 aa  444  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00277353  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.41 
 
 		 821 aa  442  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000592139  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1690  surface antigen (D15)  40.33 
 
 		 900 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0432  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.36 
 
 		 834 aa  434  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0400  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.87 
 
 		 827 aa  431  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000108596  unclonable  0.0000045929 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1751  surface antigen family protein  33.37 
 
 		 820 aa  424  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0463  surface antigen family protein  34.01 
 
 		 858 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.28 
 
 		 895 aa  174  6.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  24.06 
 
 		 888 aa  165  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.04 
 
 		 793 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.28 
 
 		 793 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  22.92 
 
 		 806 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1796  surface antigen (D15)  24.85 
 
 		 818 aa  150  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00389709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  23.54 
 
 		 913 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  22.06 
 
 		 820 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  22.52 
 
 		 896 aa  144  8e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.21 
 
 		 772 aa  143  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.82 
 
 		 769 aa  142  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  23.41 
 
 		 785 aa  140  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.64 
 
 		 752 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.46 
 
 		 758 aa  140  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.38 
 
 		 895 aa  139  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1708  surface antigen (D15)  23.52 
 
 		 807 aa  139  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2540  surface antigen (D15)  21.12 
 
 		 772 aa  139  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  24.19 
 
 		 765 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1529  putative surface antigen (D15)  23.43 
 
 		 803 aa  137  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000190996  normal  0.0121061 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.59 
 
 		 808 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  21.26 
 
 		 763 aa  137  7.000000000000001e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.91 
 
 		 770 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.22 
 
 		 802 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2601  surface antigen, putative  25.61 
 
 		 818 aa  135  3e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.72 
 
 		 848 aa  135  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  21.72 
 
 		 760 aa  134  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1808  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.29 
 
 		 868 aa  134  6e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2334  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.58 
 
 		 763 aa  134  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117402 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  22.31 
 
 		 767 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  23.12 
 
 		 765 aa  134  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.99 
 
 		 799 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0248  surface antigen (D15)  24.71 
 
 		 926 aa  134  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.58 
 
 		 769 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2877  surface antigen (D15)  22.14 
 
 		 827 aa  132  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000948  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1574  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.87 
 
 		 786 aa  132  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0322  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.11 
 
 		 784 aa  132  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  22.46 
 
 		 787 aa  132  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.74 
 
 		 784 aa  132  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1356  surface antigen (D15)  22.75 
 
 		 826 aa  132  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000205975  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  22.78 
 
 		 763 aa  132  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  21.03 
 
 		 770 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0357  outer membrane antigen  24.89 
 
 		 784 aa  131  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.433119  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  21.79 
 
 		 790 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  25.38 
 
 		 791 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2633  surface antigen (D15)  23.32 
 
 		 826 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000445373  normal  0.203506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2700  surface antigen (D15)  23.32 
 
 		 826 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000360043  hitchhiker  0.00504138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  22.98 
 
 		 794 aa  131  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.24 
 
 		 769 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.08 
 
 		 770 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  23.54 
 
 		 905 aa  130  9.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  22.32 
 
 		 787 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.62 
 
 		 784 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.54 
 
 		 787 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  23.6 
 
 		 790 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2807  surface antigen (D15)  23.55 
 
 		 826 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000285002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2894  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.91 
 
 		 826 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172199  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  22.77 
 
 		 765 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1637  surface antigen  22.62 
 
 		 826 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  24.72 
 
 		 752 aa  130  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1489  surface antigen (D15)  22.91 
 
 		 826 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.58 
 
 		 797 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1453  surface antigen (D15)  22.91 
 
 		 826 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000244779  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1147  surface antigen  22.89 
 
 		 844 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003885  normal  0.883859 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  21.71 
 
 		 769 aa  129  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  21.71 
 
 		 769 aa  129  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  21.96 
 
 		 768 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  21.96 
 
 		 769 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  21.96 
 
 		 768 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  21.71 
 
 		 768 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  21.96 
 
 		 768 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  21.71 
 
 		 768 aa  128  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  22.35 
 
 		 769 aa  128  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2627  surface antigen (D15)  21.77 
 
 		 827 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0218715  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  22.62 
 
 		 792 aa  127  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  23.14 
 
 		 786 aa  127  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  23.17 
 
 		 790 aa  127  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  23.16 
 
 		 758 aa  126  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  23.81 
 
 		 769 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  23.81 
 
 		 769 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1458  surface antigen (D15)  22.22 
 
 		 827 aa  127  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000234879  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.81 
 
 		 769 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  23.14 
 
 		 786 aa  127  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>