285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1357 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1357  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  100 
 
 		 844 aa  1716    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0741004  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1690  surface antigen (D15)  54.09 
 
 		 900 aa  935    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04315  putative outer membrane protein  54.95 
 
 		 860 aa  891    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0986  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  41.3 
 
 		 838 aa  600  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  39.21 
 
 		 865 aa  597  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.518377  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4388  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  39.95 
 
 		 865 aa  593  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3412  outer membrane protein; surface antigen  39.82 
 
 		 848 aa  590  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1052  surface antigen variable number repeat protein  37 
 
 		 914 aa  562  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000329593  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0191  outer membrane protein, putative  34.06 
 
 		 891 aa  514  1e-144  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.796772 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.7 
 
 		 831 aa  449  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000452148  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1959  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.49 
 
 		 836 aa  452  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.364204  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0397  surface antigen (D15)  35.02 
 
 		 830 aa  438  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00277353  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.45 
 
 		 821 aa  432  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000592139  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0432  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.02 
 
 		 834 aa  428  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1751  surface antigen family protein  34.06 
 
 		 820 aa  425  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0782  hypothetical protein  30.9 
 
 		 895 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0463  surface antigen family protein  33.53 
 
 		 858 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0400  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.57 
 
 		 827 aa  412  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000108596  unclonable  0.0000045929 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  22.74 
 
 		 888 aa  163  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  23.85 
 
 		 913 aa  160  9e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.66 
 
 		 758 aa  152  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2334  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.57 
 
 		 763 aa  148  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117402 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.35 
 
 		 855 aa  147  6e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.1 
 
 		 895 aa  146  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1808  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.77 
 
 		 868 aa  144  5e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  27.04 
 
 		 785 aa  144  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.39 
 
 		 793 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  23.05 
 
 		 763 aa  143  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.04 
 
 		 821 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.22 
 
 		 895 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  22.48 
 
 		 806 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0248  surface antigen (D15)  24.2 
 
 		 926 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  25.33 
 
 		 905 aa  141  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  21.95 
 
 		 820 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.14 
 
 		 793 aa  141  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0724  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.49 
 
 		 803 aa  140  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.000000000000238666  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0623  outer membrane protein assembly factor  24.49 
 
 		 803 aa  140  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000661464  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.66 
 
 		 752 aa  140  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.89 
 
 		 808 aa  139  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.43 
 
 		 848 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.71 
 
 		 765 aa  139  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2601  surface antigen, putative  26.71 
 
 		 818 aa  139  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  22.21 
 
 		 790 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0322  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.28 
 
 		 784 aa  137  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  22.59 
 
 		 792 aa  137  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  23.35 
 
 		 770 aa  137  9e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25 
 
 		 803 aa  137  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  23.82 
 
 		 765 aa  137  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1529  putative surface antigen (D15)  25.14 
 
 		 803 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000190996  normal  0.0121061 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0357  outer membrane antigen  26.08 
 
 		 784 aa  136  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.433119  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1796  surface antigen (D15)  25.52 
 
 		 818 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00389709  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  24.83 
 
 		 781 aa  135  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1708  surface antigen (D15)  25.14 
 
 		 807 aa  135  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.33 
 
 		 765 aa  134  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  23.31 
 
 		 765 aa  134  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  25.61 
 
 		 794 aa  134  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0569  hypothetical protein  25.15 
 
 		 770 aa  134  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0863  surface antigen (D15):surface antigen variable number  22.07 
 
 		 769 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  22.1 
 
 		 766 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.9 
 
 		 781 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  24.12 
 
 		 765 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0545  hypothetical protein  24.75 
 
 		 770 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  25.05 
 
 		 752 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  25 
 
 		 788 aa  133  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  24.9 
 
 		 781 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  26.88 
 
 		 769 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.57 
 
 		 800 aa  132  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.54 
 
 		 787 aa  131  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1446  surface antigen (D15)  23 
 
 		 765 aa  131  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.332057 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  23.33 
 
 		 765 aa  130  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1446  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.07 
 
 		 800 aa  130  8.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  23.22 
 
 		 781 aa  129  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1489  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.51 
 
 		 780 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.73 
 
 		 780 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  24.77 
 
 		 785 aa  128  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  22.53 
 
 		 787 aa  127  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  23.93 
 
 		 790 aa  127  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.71 
 
 		 769 aa  127  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.57 
 
 		 765 aa  127  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  22.66 
 
 		 786 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.12 
 
 		 787 aa  127  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.67 
 
 		 750 aa  127  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1071  OMP85 family outer membrane protein  23.2 
 
 		 773 aa  126  1e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0702133  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.77 
 
 		 769 aa  126  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.73 
 
 		 784 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  25.61 
 
 		 788 aa  126  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  22.76 
 
 		 786 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.05 
 
 		 770 aa  125  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.86 
 
 		 770 aa  125  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  21.63 
 
 		 794 aa  125  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  22.42 
 
 		 787 aa  125  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  23.49 
 
 		 758 aa  125  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.19 
 
 		 781 aa  125  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.5 
 
 		 797 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.07 
 
 		 857 aa  125  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  24.52 
 
 		 845 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0825  outer membrane protein  25.34 
 
 		 821 aa  124  5e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.860855  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  22.98 
 
 		 790 aa  124  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.28 
 
 		 854 aa  124  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.28 
 
 		 864 aa  124  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>