296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0463 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0432  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  67.84 
 
 		 834 aa  1185    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0400  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  61.94 
 
 		 827 aa  1023    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000108596  unclonable  0.0000045929 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  61.74 
 
 		 821 aa  1019    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000592139  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1751  surface antigen family protein  66.75 
 
 		 820 aa  1125    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0463  surface antigen family protein  100 
 
 		 858 aa  1764    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0397  surface antigen (D15)  62.5 
 
 		 830 aa  1113    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00277353  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  66.88 
 
 		 831 aa  1121    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000452148  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1959  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.65 
 
 		 836 aa  444  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.364204  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4388  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.33 
 
 		 865 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1052  surface antigen variable number repeat protein  31.26 
 
 		 914 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000329593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0986  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.37 
 
 		 838 aa  425  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.01 
 
 		 865 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.518377  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3412  outer membrane protein; surface antigen  32.23 
 
 		 848 aa  400  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1357  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.53 
 
 		 844 aa  397  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0741004  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04315  putative outer membrane protein  33.45 
 
 		 860 aa  378  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0191  outer membrane protein, putative  30.79 
 
 		 891 aa  372  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.796772 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0782  hypothetical protein  31.38 
 
 		 895 aa  371  1e-101  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1690  surface antigen (D15)  35.41 
 
 		 900 aa  330  6e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  27.98 
 
 		 913 aa  249  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  28.11 
 
 		 752 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  27.03 
 
 		 769 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  26.85 
 
 		 765 aa  232  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.16 
 
 		 892 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.85 
 
 		 808 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2334  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.53 
 
 		 763 aa  221  6e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117402 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  27.34 
 
 		 763 aa  217  8e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.37 
 
 		 802 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0949  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.84 
 
 		 809 aa  210  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00135315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.19 
 
 		 752 aa  210  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.68 
 
 		 848 aa  208  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3352  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.38 
 
 		 815 aa  206  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346772  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3782  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.79 
 
 		 801 aa  203  9e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000907033  hitchhiker  0.00340919 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.19 
 
 		 895 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2540  surface antigen (D15)  25.91 
 
 		 772 aa  203  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  25 
 
 		 751 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1356  surface antigen (D15)  27.31 
 
 		 826 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000205975  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  24.5 
 
 		 888 aa  198  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  23.01 
 
 		 905 aa  197  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2877  surface antigen (D15)  26.81 
 
 		 827 aa  197  7e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000948  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  25 
 
 		 777 aa  197  9e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.39 
 
 		 779 aa  196  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  24.55 
 
 		 834 aa  196  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0265  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.96 
 
 		 803 aa  195  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000300024  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2807  surface antigen (D15)  27.13 
 
 		 826 aa  194  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000285002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3157  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.53 
 
 		 805 aa  194  8e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0017892  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  25.51 
 
 		 834 aa  193  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3273  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.57 
 
 		 827 aa  193  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1053  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.77 
 
 		 807 aa  193  1e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2633  surface antigen (D15)  26.99 
 
 		 826 aa  193  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000445373  normal  0.203506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2700  surface antigen (D15)  26.99 
 
 		 826 aa  193  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000360043  hitchhiker  0.00504138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  25.19 
 
 		 852 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  25.53 
 
 		 785 aa  192  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2894  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.7 
 
 		 826 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172199  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0262  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.58 
 
 		 803 aa  192  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2627  surface antigen (D15)  25.75 
 
 		 827 aa  191  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0218715  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1458  surface antigen (D15)  26.85 
 
 		 827 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000234879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1489  surface antigen (D15)  26.7 
 
 		 826 aa  191  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1453  surface antigen (D15)  26.7 
 
 		 826 aa  191  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000244779  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  25.09 
 
 		 785 aa  191  5.999999999999999e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.34 
 
 		 895 aa  190  9e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0248  surface antigen (D15)  27.19 
 
 		 926 aa  190  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  24.93 
 
 		 910 aa  190  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2972  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.52 
 
 		 807 aa  189  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0353111  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.86 
 
 		 780 aa  189  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  24.2 
 
 		 790 aa  189  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.64 
 
 		 804 aa  189  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25845  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  26.11 
 
 		 765 aa  188  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1074  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.39 
 
 		 795 aa  187  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000979052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3427  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.39 
 
 		 795 aa  187  6e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000902719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1369  surface antigen (D15)  26 
 
 		 799 aa  187  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.747321  decreased coverage  0.00880921 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1021  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.39 
 
 		 795 aa  187  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000998639  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.86 
 
 		 829 aa  187  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.31 
 
 		 784 aa  187  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2711  putative outer membrane protein  26 
 
 		 799 aa  187  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.902664  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.35 
 
 		 810 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  0.197895 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0250  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.35 
 
 		 810 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.609554  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  25.27 
 
 		 778 aa  186  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  24.9 
 
 		 887 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  24.37 
 
 		 787 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1637  surface antigen  26.6 
 
 		 826 aa  185  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  24.88 
 
 		 766 aa  185  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1574  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.18 
 
 		 786 aa  185  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  25.6 
 
 		 791 aa  185  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.17 
 
 		 799 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  23.78 
 
 		 770 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.59 
 
 		 803 aa  185  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00175  hypothetical protein  27.26 
 
 		 810 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000980871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3426  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.26 
 
 		 810 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0181  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.26 
 
 		 810 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000194171  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3483  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.26 
 
 		 810 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000802072  normal  0.102232 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00174  hypothetical protein  27.26 
 
 		 810 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00018653  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  25.27 
 
 		 845 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0179  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.26 
 
 		 810 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000266992  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0170  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.26 
 
 		 810 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000513305  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0187  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.26 
 
 		 810 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00010789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0188  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.26 
 
 		 810 aa  184  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000418762  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  24.79 
 
 		 781 aa  184  9.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  24.24 
 
 		 787 aa  183  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.43 
 
 		 784 aa  183  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2146  surface antigen (D15)  24.76 
 
 		 792 aa  183  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.766596  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>