More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1751 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0400  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  64.17 
 
 
827 aa  1046    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000108596  unclonable  0.0000045929 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1751  surface antigen family protein  100 
 
 
820 aa  1683    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0463  surface antigen family protein  66.75 
 
 
858 aa  1125    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  66.26 
 
 
831 aa  1135    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000452148  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0432  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  68.66 
 
 
834 aa  1149    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0397  surface antigen (D15)  64.48 
 
 
830 aa  1112    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00277353  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  60.76 
 
 
821 aa  1010    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000592139  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1959  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.9 
 
 
836 aa  445  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.364204  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4388  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.29 
 
 
865 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0986  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.61 
 
 
838 aa  428  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.37 
 
 
865 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.518377  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1052  surface antigen variable number repeat protein  31.12 
 
 
914 aa  420  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000329593  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3412  outer membrane protein; surface antigen  33.94 
 
 
848 aa  417  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1357  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.06 
 
 
844 aa  407  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0741004  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0191  outer membrane protein, putative  31.64 
 
 
891 aa  396  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.796772 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04315  putative outer membrane protein  34.27 
 
 
860 aa  382  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0782  hypothetical protein  30.95 
 
 
895 aa  359  9.999999999999999e-98  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1690  surface antigen (D15)  34.73 
 
 
900 aa  323  7e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  29.66 
 
 
913 aa  268  4e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  26.71 
 
 
888 aa  245  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  29.21 
 
 
752 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.82 
 
 
892 aa  238  3e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  28.43 
 
 
765 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  27.64 
 
 
769 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.35 
 
 
808 aa  225  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.42 
 
 
895 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.05 
 
 
802 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2334  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.15 
 
 
763 aa  214  5.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0117402 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  26.31 
 
 
763 aa  208  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1053  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.52 
 
 
807 aa  206  2e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  27.21 
 
 
763 aa  204  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  26.35 
 
 
751 aa  203  8e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2540  surface antigen (D15)  26.02 
 
 
772 aa  203  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2877  surface antigen (D15)  27.15 
 
 
827 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000948  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  27.1 
 
 
785 aa  201  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2633  surface antigen (D15)  27.41 
 
 
826 aa  202  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000445373  normal  0.203506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2700  surface antigen (D15)  27.41 
 
 
826 aa  202  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000360043  hitchhiker  0.00504138 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2807  surface antigen (D15)  27.41 
 
 
826 aa  200  7e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000285002  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1356  surface antigen (D15)  26 
 
 
826 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000205975  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.05 
 
 
803 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  27.05 
 
 
781 aa  199  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.59 
 
 
752 aa  198  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1574  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.23 
 
 
786 aa  197  6e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2894  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.13 
 
 
826 aa  197  7e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172199  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.19 
 
 
895 aa  197  7e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3273  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.15 
 
 
827 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1453  surface antigen (D15)  26.99 
 
 
826 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000244779  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.46 
 
 
758 aa  196  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1489  surface antigen (D15)  26.99 
 
 
826 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390259  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.48 
 
 
772 aa  196  1e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  27.25 
 
 
834 aa  195  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0623  outer membrane protein assembly factor  25.57 
 
 
803 aa  195  3e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000661464  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0724  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.57 
 
 
803 aa  195  3e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.000000000000238666  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1458  surface antigen (D15)  25.9 
 
 
827 aa  194  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000234879  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1637  surface antigen  26.47 
 
 
826 aa  193  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  24.97 
 
 
777 aa  192  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3782  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.88 
 
 
801 aa  192  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000907033  hitchhiker  0.00340919 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  26.82 
 
 
887 aa  192  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.27 
 
 
848 aa  192  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  25 
 
 
790 aa  191  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.91 
 
 
779 aa  190  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0949  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.79 
 
 
809 aa  190  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00135315  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  26.02 
 
 
778 aa  190  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1278  surface antigen (D15)  25.68 
 
 
827 aa  189  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00357264  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  26.17 
 
 
845 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0715  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.48 
 
 
805 aa  189  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000733739  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0262  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.33 
 
 
803 aa  188  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.82 
 
 
804 aa  187  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25845  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0265  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.97 
 
 
803 aa  187  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000300024  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  26.75 
 
 
841 aa  187  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2627  surface antigen (D15)  25.28 
 
 
827 aa  187  9e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0218715  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0250  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.42 
 
 
810 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.609554  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.42 
 
 
810 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  0.197895 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.92 
 
 
780 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3153  surface antigen (D15)  26.49 
 
 
827 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000352533  normal  0.0112151 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1147  surface antigen  24.75 
 
 
844 aa  185  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003885  normal  0.883859 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2972  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.46 
 
 
807 aa  185  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0353111  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3352  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.26 
 
 
815 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346772  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.06 
 
 
829 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  24.27 
 
 
910 aa  185  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  26.21 
 
 
844 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3157  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.94 
 
 
805 aa  184  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0017892  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0248  surface antigen (D15)  28.14 
 
 
926 aa  184  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0188  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.57 
 
 
810 aa  183  9.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000418762  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  26.61 
 
 
798 aa  183  1e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  23.87 
 
 
796 aa  182  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  24.28 
 
 
905 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00175  hypothetical protein  25.24 
 
 
810 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000980871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3426  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.24 
 
 
810 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480767  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0179  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.24 
 
 
810 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000266992  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1074  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.42 
 
 
795 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000979052  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0181  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.24 
 
 
810 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000194171  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3427  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.42 
 
 
795 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000902719  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1021  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.42 
 
 
795 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000998639  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0187  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.24 
 
 
810 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00010789  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00174  hypothetical protein  25.24 
 
 
810 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00018653  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3483  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.24 
 
 
810 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000802072  normal  0.102232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  26.16 
 
 
852 aa  182  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0170  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.24 
 
 
810 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000513305  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  25.1 
 
 
794 aa  180  9e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>