288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1690 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_04315  putative outer membrane protein  56.24 
 
 
860 aa  928    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1690  surface antigen (D15)  100 
 
 
900 aa  1816    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1357  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  54.52 
 
 
844 aa  929    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0741004  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  40.04 
 
 
865 aa  631  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.518377  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0986  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  42.17 
 
 
838 aa  612  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3412  outer membrane protein; surface antigen  39.82 
 
 
848 aa  561  1e-158  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1052  surface antigen variable number repeat protein  36.8 
 
 
914 aa  556  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000329593  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0191  outer membrane protein, putative  32.99 
 
 
891 aa  494  9.999999999999999e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.796772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4388  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  40.89 
 
 
865 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0782  hypothetical protein  30.99 
 
 
895 aa  404  1e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1959  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.52 
 
 
836 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.364204  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0400  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.07 
 
 
827 aa  369  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000108596  unclonable  0.0000045929 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0463  surface antigen family protein  35.41 
 
 
858 aa  352  1e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1751  surface antigen family protein  34.82 
 
 
820 aa  340  9.999999999999999e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0397  surface antigen (D15)  34.13 
 
 
830 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00277353  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.82 
 
 
831 aa  327  5e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000452148  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0432  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.5 
 
 
834 aa  325  2e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.23 
 
 
821 aa  306  8.000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000592139  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  24.56 
 
 
820 aa  157  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0322  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.69 
 
 
784 aa  153  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  27.86 
 
 
752 aa  154  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0357  outer membrane antigen  26.69 
 
 
784 aa  153  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.433119  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  25.2 
 
 
788 aa  152  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.35 
 
 
787 aa  150  9e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.2 
 
 
799 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  23.2 
 
 
787 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.66 
 
 
793 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  24.07 
 
 
806 aa  146  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  23.09 
 
 
787 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.4 
 
 
765 aa  145  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.66 
 
 
793 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  25.2 
 
 
765 aa  145  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.73 
 
 
821 aa  145  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  23.71 
 
 
770 aa  144  6e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1796  surface antigen (D15)  26.19 
 
 
818 aa  144  9e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00389709  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  23.63 
 
 
785 aa  144  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  24.35 
 
 
905 aa  143  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  24.85 
 
 
792 aa  143  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.06 
 
 
765 aa  142  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.54 
 
 
784 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  26.54 
 
 
791 aa  142  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  24.76 
 
 
786 aa  142  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  24.5 
 
 
765 aa  141  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  26.97 
 
 
765 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  24.81 
 
 
766 aa  141  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.46 
 
 
855 aa  140  7.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  26.54 
 
 
795 aa  140  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.43 
 
 
758 aa  140  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  26.05 
 
 
786 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  26.05 
 
 
786 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.1 
 
 
797 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  26.71 
 
 
785 aa  139  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.1 
 
 
787 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1529  putative surface antigen (D15)  25.4 
 
 
803 aa  139  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000190996  normal  0.0121061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  24.9 
 
 
794 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1708  surface antigen (D15)  24.58 
 
 
807 aa  138  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930875  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1446  surface antigen (D15)  23.71 
 
 
765 aa  138  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.332057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.52 
 
 
800 aa  137  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  25 
 
 
790 aa  137  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2607  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.24 
 
 
811 aa  137  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.745531  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1407  surface antigen (D15)  24.31 
 
 
796 aa  136  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  24.6 
 
 
888 aa  137  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  25.61 
 
 
781 aa  136  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.61 
 
 
803 aa  136  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.32 
 
 
781 aa  135  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  24.32 
 
 
781 aa  135  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2687  surface antigen (D15)  25.31 
 
 
784 aa  135  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.379638  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  24.85 
 
 
887 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  25.94 
 
 
769 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1766  surface antigen (D15)  26.34 
 
 
766 aa  133  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0726033  normal  0.0207518 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.12 
 
 
848 aa  133  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  24.77 
 
 
845 aa  132  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3999  surface antigen (D15)  23.95 
 
 
782 aa  132  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54012  normal  0.826111 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.51 
 
 
769 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0623  outer membrane protein assembly factor  22.36 
 
 
803 aa  131  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000661464  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0724  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.36 
 
 
803 aa  131  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.000000000000238666  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.17 
 
 
784 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1574  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.05 
 
 
786 aa  131  6e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  24.42 
 
 
763 aa  131  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  23.2 
 
 
843 aa  130  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  23.75 
 
 
777 aa  130  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.67 
 
 
841 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2589  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  22.54 
 
 
896 aa  130  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0085313  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  24.96 
 
 
910 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  24.34 
 
 
781 aa  129  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  23.88 
 
 
779 aa  129  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  23.51 
 
 
852 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  23.72 
 
 
841 aa  129  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  24.44 
 
 
796 aa  128  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.14 
 
 
770 aa  128  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  24.37 
 
 
844 aa  128  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.44 
 
 
808 aa  127  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  24.88 
 
 
760 aa  127  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.24 
 
 
752 aa  127  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  26.2 
 
 
778 aa  127  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0751  surface antigen  25.35 
 
 
840 aa  127  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  23.05 
 
 
834 aa  127  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.75 
 
 
781 aa  126  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  23.76 
 
 
790 aa  126  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  23.83 
 
 
758 aa  125  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>