270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4388 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4388  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  100 
 
 		 865 aa  1768    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1052  surface antigen variable number repeat protein  42.2 
 
 		 914 aa  687    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000329593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  60.98 
 
 		 865 aa  1066    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.518377  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0986  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  45.74 
 
 		 838 aa  690    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3412  outer membrane protein; surface antigen  47.31 
 
 		 848 aa  779    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1357  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  40.9 
 
 		 844 aa  568  1e-160  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0741004  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04315  putative outer membrane protein  39.46 
 
 		 860 aa  547  1e-154  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0191  outer membrane protein, putative  35.21 
 
 		 891 aa  524  1e-147  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.796772 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0782  hypothetical protein  35.25 
 
 		 895 aa  513  1e-144  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1959  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.66 
 
 		 836 aa  488  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.364204  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.41 
 
 		 821 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000592139  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.71 
 
 		 831 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000452148  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0463  surface antigen family protein  32.33 
 
 		 858 aa  437  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0400  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.74 
 
 		 827 aa  435  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000108596  unclonable  0.0000045929 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1690  surface antigen (D15)  40.57 
 
 		 900 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0432  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.02 
 
 		 834 aa  427  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0397  surface antigen (D15)  32.79 
 
 		 830 aa  428  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00277353  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1751  surface antigen family protein  33.49 
 
 		 820 aa  426  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  24.41 
 
 		 888 aa  187  8e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.27 
 
 		 895 aa  172  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  26.64 
 
 		 905 aa  172  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2540  surface antigen (D15)  24.68 
 
 		 772 aa  171  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  24.36 
 
 		 784 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  23.57 
 
 		 791 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  23.44 
 
 		 751 aa  162  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  23.09 
 
 		 765 aa  161  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.3 
 
 		 769 aa  157  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2601  surface antigen, putative  27.43 
 
 		 818 aa  155  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.39 
 
 		 758 aa  155  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.93 
 
 		 752 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0357  outer membrane antigen  23.88 
 
 		 784 aa  155  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.433119  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.33 
 
 		 770 aa  155  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  23.18 
 
 		 913 aa  155  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  23.56 
 
 		 792 aa  154  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1796  surface antigen (D15)  25.66 
 
 		 818 aa  153  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00389709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1529  putative surface antigen (D15)  26.2 
 
 		 803 aa  154  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000190996  normal  0.0121061 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2334  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.55 
 
 		 763 aa  154  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117402 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.7 
 
 		 848 aa  153  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1708  surface antigen (D15)  26.39 
 
 		 807 aa  153  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0322  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.76 
 
 		 784 aa  153  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.44 
 
 		 793 aa  152  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.52 
 
 		 768 aa  152  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.14 
 
 		 793 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.61 
 
 		 892 aa  151  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  22.94 
 
 		 768 aa  151  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.32 
 
 		 799 aa  151  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  24.32 
 
 		 794 aa  151  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.19 
 
 		 808 aa  151  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  23 
 
 		 806 aa  151  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  24.54 
 
 		 844 aa  150  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  22.82 
 
 		 769 aa  150  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  22.82 
 
 		 769 aa  150  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.95 
 
 		 769 aa  150  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  22.83 
 
 		 769 aa  150  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  22.83 
 
 		 769 aa  150  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  23.06 
 
 		 768 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  23.06 
 
 		 769 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  22.79 
 
 		 770 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  24.47 
 
 		 752 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  23.06 
 
 		 768 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  22.82 
 
 		 768 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  23.27 
 
 		 768 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  23.06 
 
 		 768 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.01 
 
 		 797 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  23.15 
 
 		 769 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.97 
 
 		 784 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  23.44 
 
 		 767 aa  149  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  24.18 
 
 		 845 aa  148  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.71 
 
 		 765 aa  147  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.24 
 
 		 770 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3999  surface antigen (D15)  25.46 
 
 		 782 aa  147  8.000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54012  normal  0.826111 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1750  surface antigen (D15):surface antigen variable number  22.88 
 
 		 761 aa  146  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.330816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1808  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.09 
 
 		 868 aa  147  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  24.22 
 
 		 787 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.09 
 
 		 769 aa  147  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.9 
 
 		 787 aa  146  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  24.04 
 
 		 766 aa  146  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  23.11 
 
 		 760 aa  146  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.37 
 
 		 750 aa  146  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  24.32 
 
 		 787 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.1 
 
 		 787 aa  145  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  23.96 
 
 		 786 aa  145  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.99 
 
 		 895 aa  145  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  23.96 
 
 		 786 aa  145  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  23.79 
 
 		 790 aa  144  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  24.59 
 
 		 834 aa  144  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  24.8 
 
 		 769 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1388  surface antigen (D15)  23.34 
 
 		 795 aa  144  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0577653  normal  0.0157833 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  22.8 
 
 		 788 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  22.4 
 
 		 786 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  24.34 
 
 		 910 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.84 
 
 		 781 aa  141  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.16 
 
 		 841 aa  142  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  24.62 
 
 		 896 aa  142  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  23.79 
 
 		 785 aa  141  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.82 
 
 		 769 aa  141  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  25.71 
 
 		 758 aa  140  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  22.61 
 
 		 820 aa  140  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.86 
 
 		 854 aa  140  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  20.72 
 
 		 785 aa  140  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>