287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04315 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1690  surface antigen (D15)  56.62 
 
 		 900 aa  987    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  42.91 
 
 		 865 aa  648    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.518377  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04315  putative outer membrane protein  100 
 
 		 860 aa  1746    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0986  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  42.74 
 
 		 838 aa  641    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1357  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  55.7 
 
 		 844 aa  943    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0741004  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4388  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  40.47 
 
 		 865 aa  629  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3412  outer membrane protein; surface antigen  40.5 
 
 		 848 aa  608  9.999999999999999e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1052  surface antigen variable number repeat protein  37.77 
 
 		 914 aa  569  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000329593  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0191  outer membrane protein, putative  33.23 
 
 		 891 aa  489  1e-137  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.796772 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.43 
 
 		 831 aa  462  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000452148  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1959  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.77 
 
 		 836 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.364204  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1751  surface antigen family protein  34.39 
 
 		 820 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0397  surface antigen (D15)  33.81 
 
 		 830 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00277353  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0432  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.67 
 
 		 834 aa  434  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0463  surface antigen family protein  33.81 
 
 		 858 aa  434  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.6 
 
 		 821 aa  431  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000592139  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0400  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.3 
 
 		 827 aa  411  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000108596  unclonable  0.0000045929 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0782  hypothetical protein  31.36 
 
 		 895 aa  409  1.0000000000000001e-112  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  25.52 
 
 		 888 aa  182  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  23.88 
 
 		 913 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.26 
 
 		 758 aa  169  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  23.44 
 
 		 770 aa  162  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.41 
 
 		 772 aa  159  3e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.4 
 
 		 892 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2334  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.86 
 
 		 763 aa  155  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.57 
 
 		 765 aa  152  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  22.67 
 
 		 820 aa  152  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.39 
 
 		 781 aa  151  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  24.39 
 
 		 781 aa  151  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  26.92 
 
 		 765 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  24.26 
 
 		 905 aa  149  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  23.23 
 
 		 806 aa  148  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1446  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.19 
 
 		 800 aa  147  7.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  23.4 
 
 		 765 aa  147  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.94 
 
 		 793 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  25.95 
 
 		 785 aa  146  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  23.68 
 
 		 887 aa  146  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.29 
 
 		 793 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0863  surface antigen (D15):surface antigen variable number  22.65 
 
 		 769 aa  143  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1808  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.85 
 
 		 868 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.61 
 
 		 808 aa  142  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1796  surface antigen (D15)  24.79 
 
 		 818 aa  141  4.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00389709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  26.52 
 
 		 752 aa  141  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.45 
 
 		 848 aa  140  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1529  putative surface antigen (D15)  22.39 
 
 		 803 aa  139  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000190996  normal  0.0121061 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.75 
 
 		 895 aa  139  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.37 
 
 		 765 aa  138  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.9 
 
 		 752 aa  138  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  23.26 
 
 		 765 aa  137  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.43 
 
 		 769 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  22.83 
 
 		 896 aa  137  8e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  24 
 
 		 910 aa  137  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.07 
 
 		 800 aa  137  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  24.71 
 
 		 781 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2687  surface antigen (D15)  23.05 
 
 		 784 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.379638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1708  surface antigen (D15)  22.5 
 
 		 807 aa  136  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1407  surface antigen (D15)  24.65 
 
 		 796 aa  136  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.71 
 
 		 803 aa  135  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.97 
 
 		 769 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1446  surface antigen (D15)  22.61 
 
 		 765 aa  135  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.332057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2607  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.35 
 
 		 811 aa  134  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.745531  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.78 
 
 		 770 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0636  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.3 
 
 		 775 aa  132  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0791016  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  24.95 
 
 		 785 aa  132  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  22.57 
 
 		 769 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  22.57 
 
 		 768 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  22.68 
 
 		 893 aa  132  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  22.57 
 
 		 768 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  22.57 
 
 		 768 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.54 
 
 		 841 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1766  surface antigen (D15)  22.35 
 
 		 766 aa  131  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0726033  normal  0.0207518 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  22.3 
 
 		 768 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  22.3 
 
 		 769 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  22.3 
 
 		 769 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.29 
 
 		 855 aa  130  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  22.3 
 
 		 768 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  25.35 
 
 		 841 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  22.82 
 
 		 790 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  25.51 
 
 		 769 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.2 
 
 		 802 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2601  surface antigen, putative  27.48 
 
 		 818 aa  129  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  23.22 
 
 		 790 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  22.09 
 
 		 763 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  22.71 
 
 		 767 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  22.55 
 
 		 794 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  22.24 
 
 		 781 aa  128  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.8 
 
 		 770 aa  128  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1458  surface antigen (D15)  23.25 
 
 		 780 aa  127  8.000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.57 
 
 		 821 aa  127  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  22.75 
 
 		 786 aa  127  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1561  OMP85 family outer membrane protein  23.08 
 
 		 817 aa  127  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347163  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  23.9 
 
 		 790 aa  127  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  22.55 
 
 		 768 aa  127  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  22.75 
 
 		 786 aa  127  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2589  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  22.78 
 
 		 896 aa  126  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0085313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.68 
 
 		 797 aa  126  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.59 
 
 		 854 aa  125  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  23.04 
 
 		 798 aa  125  3e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0357  outer membrane antigen  23.24 
 
 		 784 aa  125  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.433119  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.59 
 
 		 864 aa  125  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>