More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1053 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1053  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  100 
 
 		 807 aa  1650    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2334  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.76 
 
 		 763 aa  369  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117402 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.45 
 
 		 892 aa  265  4e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.16 
 
 		 752 aa  263  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.58 
 
 		 895 aa  261  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  26.49 
 
 		 763 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  26.25 
 
 		 765 aa  251  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  26.61 
 
 		 913 aa  249  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  28.22 
 
 		 888 aa  248  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  26.68 
 
 		 752 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  25.13 
 
 		 893 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  26.53 
 
 		 769 aa  243  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.2 
 
 		 808 aa  240  9e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.18 
 
 		 803 aa  239  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  28.18 
 
 		 781 aa  239  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  26.76 
 
 		 751 aa  239  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  27.34 
 
 		 785 aa  233  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.5 
 
 		 802 aa  233  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.27 
 
 		 895 aa  230  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  25.97 
 
 		 794 aa  228  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  27.02 
 
 		 758 aa  228  5.0000000000000005e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.13 
 
 		 770 aa  226  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.07 
 
 		 785 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_002620  TC0512  outer membrane protein, putative  26.96 
 
 		 792 aa  226  2e-57  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.74 
 
 		 770 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  26.54 
 
 		 790 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.66 
 
 		 781 aa  222  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  26.21 
 
 		 788 aa  221  5e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  25.07 
 
 		 767 aa  221  5e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.87 
 
 		 848 aa  220  8.999999999999998e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  26.83 
 
 		 777 aa  219  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.95 
 
 		 769 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.77 
 
 		 779 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  24.71 
 
 		 767 aa  218  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  25.73 
 
 		 769 aa  216  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  25.73 
 
 		 769 aa  216  9e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  25.6 
 
 		 768 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  26.4 
 
 		 768 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  26.4 
 
 		 769 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  26.4 
 
 		 768 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  26.4 
 
 		 768 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  27.24 
 
 		 778 aa  215  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  25.73 
 
 		 768 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0636  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.16 
 
 		 775 aa  214  4.9999999999999996e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0791016  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.94 
 
 		 793 aa  214  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  23.9 
 
 		 896 aa  213  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.58 
 
 		 793 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  25.52 
 
 		 820 aa  213  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  25.06 
 
 		 806 aa  212  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.7 
 
 		 769 aa  211  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.63 
 
 		 769 aa  211  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  25.63 
 
 		 769 aa  211  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  25.63 
 
 		 769 aa  211  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  25.5 
 
 		 769 aa  210  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.12 
 
 		 831 aa  209  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000452148  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1686  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.63 
 
 		 749 aa  209  2e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.998639  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  25.36 
 
 		 768 aa  209  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.97 
 
 		 768 aa  208  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.53 
 
 		 769 aa  207  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0124  OMP85 family outer membrane protein  25.95 
 
 		 739 aa  205  2e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1751  surface antigen family protein  27.52 
 
 		 820 aa  205  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0164  OMP85 family outer membrane protein  25.61 
 
 		 739 aa  204  4e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00465042  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  26.45 
 
 		 765 aa  204  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.31 
 
 		 920 aa  204  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.33 
 
 		 780 aa  204  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  25.67 
 
 		 770 aa  203  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  25.53 
 
 		 791 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.2 
 
 		 784 aa  201  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0142  OMP85 family outer membrane protein  25.24 
 
 		 739 aa  201  6e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0561822  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2687  surface antigen (D15)  25.88 
 
 		 784 aa  199  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.379638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1489  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.99 
 
 		 780 aa  197  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.16 
 
 		 750 aa  196  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.32 
 
 		 765 aa  196  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  24.49 
 
 		 785 aa  196  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  24.96 
 
 		 760 aa  194  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  26.33 
 
 		 785 aa  194  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0215  conserved hypothetical protein, putative outer membrane protein  26.09 
 
 		 738 aa  194  7e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0238562  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0463  surface antigen family protein  26.77 
 
 		 858 aa  193  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  26.7 
 
 		 765 aa  192  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1458  surface antigen (D15)  25.82 
 
 		 780 aa  193  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.73 
 
 		 856 aa  193  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0400  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.25 
 
 		 827 aa  192  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000108596  unclonable  0.0000045929 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.16 
 
 		 784 aa  192  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  25.09 
 
 		 845 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1766  surface antigen (D15)  25.98 
 
 		 766 aa  192  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0726033  normal  0.0207518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  24.88 
 
 		 841 aa  191  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.44 
 
 		 804 aa  190  8e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847749 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.05 
 
 		 821 aa  190  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000592139  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.59 
 
 		 765 aa  190  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.54 
 
 		 765 aa  189  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.81 
 
 		 800 aa  189  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  26.54 
 
 		 765 aa  189  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  26.02 
 
 		 779 aa  189  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  24.54 
 
 		 844 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  24.87 
 
 		 910 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0397  surface antigen (D15)  26.78 
 
 		 830 aa  187  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00277353  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0751  surface antigen  24.3 
 
 		 840 aa  187  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.09 
 
 		 854 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  24.87 
 
 		 843 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1750  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.6 
 
 		 761 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.330816  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>