More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1686 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0124  OMP85 family outer membrane protein  50.8 
 
 
739 aa  759    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0215  conserved hypothetical protein, putative outer membrane protein  50.8 
 
 
738 aa  733    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0238562  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0142  OMP85 family outer membrane protein  50.27 
 
 
739 aa  747    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0561822  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  47.35 
 
 
745 aa  653    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0942  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  56.45 
 
 
751 aa  810    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000918625  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1757  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  55.63 
 
 
759 aa  816    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000442418  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0164  OMP85 family outer membrane protein  50.8 
 
 
739 aa  758    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00465042  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1501  OMP85 family outer membrane protein  60.11 
 
 
757 aa  943    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1686  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  100 
 
 
749 aa  1514    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.998639  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0660  surface antigen (D15)  39.68 
 
 
755 aa  484  1e-135  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.665209  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.56 
 
 
752 aa  349  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  29.99 
 
 
752 aa  335  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  29.4 
 
 
765 aa  330  4e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  30.13 
 
 
763 aa  330  7e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  29.42 
 
 
769 aa  323  5e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.03 
 
 
892 aa  319  1e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  30.25 
 
 
751 aa  313  7.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.74 
 
 
808 aa  308  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.07 
 
 
802 aa  307  5.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.61 
 
 
895 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  28.72 
 
 
777 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  28.42 
 
 
913 aa  283  9e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  29.04 
 
 
781 aa  280  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  26.12 
 
 
763 aa  273  7e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  27.92 
 
 
893 aa  272  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.93 
 
 
920 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  26.69 
 
 
767 aa  268  4e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.91 
 
 
895 aa  265  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.34 
 
 
765 aa  265  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  28.35 
 
 
888 aa  265  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.02 
 
 
750 aa  264  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2540  surface antigen (D15)  28.15 
 
 
772 aa  263  8.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  27.56 
 
 
765 aa  262  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.73 
 
 
768 aa  260  8e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.65 
 
 
787 aa  259  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  26.96 
 
 
790 aa  259  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  27.45 
 
 
769 aa  259  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.32 
 
 
769 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  27.45 
 
 
769 aa  259  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  27.45 
 
 
769 aa  259  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  27.19 
 
 
768 aa  258  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0357  outer membrane antigen  26.33 
 
 
784 aa  258  4e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.433119  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  27.79 
 
 
778 aa  258  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0322  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.19 
 
 
784 aa  257  5e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.75 
 
 
758 aa  256  9e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.06 
 
 
769 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  28.78 
 
 
896 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.21 
 
 
784 aa  253  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.34 
 
 
770 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  25.7 
 
 
788 aa  251  4e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  26.78 
 
 
767 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  28.15 
 
 
785 aa  249  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.86 
 
 
769 aa  248  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1750  surface antigen (D15):surface antigen variable number  27.76 
 
 
761 aa  248  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.330816  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  26.41 
 
 
768 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  26.41 
 
 
769 aa  246  8e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  26.41 
 
 
769 aa  246  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  26.51 
 
 
768 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  26.95 
 
 
769 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  26.95 
 
 
768 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  26.95 
 
 
768 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  26.07 
 
 
790 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  24.94 
 
 
781 aa  246  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.94 
 
 
781 aa  246  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.73 
 
 
804 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25845  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  26.95 
 
 
768 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.58 
 
 
803 aa  245  3e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.61 
 
 
770 aa  245  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0265  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.64 
 
 
803 aa  245  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000300024  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.46 
 
 
781 aa  244  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  26.25 
 
 
758 aa  244  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1446  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.33 
 
 
800 aa  244  5e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  25.23 
 
 
785 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2968  surface antigen (D15)  25.48 
 
 
802 aa  243  7.999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.270101  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  27.26 
 
 
798 aa  243  9e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  27.45 
 
 
781 aa  243  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  26.37 
 
 
784 aa  242  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0262  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.64 
 
 
803 aa  242  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3273  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.29 
 
 
827 aa  242  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.65 
 
 
780 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.75 
 
 
779 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  26.25 
 
 
791 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  25.79 
 
 
820 aa  241  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  26.64 
 
 
765 aa  241  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.25 
 
 
793 aa  240  5e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.12 
 
 
793 aa  240  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1458  surface antigen (D15)  25.23 
 
 
780 aa  240  6.999999999999999e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  25.89 
 
 
806 aa  240  8e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3153  surface antigen (D15)  26.17 
 
 
827 aa  238  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000352533  normal  0.0112151 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  25.23 
 
 
770 aa  238  4e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0250  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.58 
 
 
810 aa  238  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.609554  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.58 
 
 
810 aa  238  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  0.197895 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1147  surface antigen  26.35 
 
 
844 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003885  normal  0.883859 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1489  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.9 
 
 
780 aa  236  8e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.98 
 
 
800 aa  236  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3352  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.15 
 
 
815 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  26.33 
 
 
794 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0715  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.64 
 
 
805 aa  234  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000733739  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.83 
 
 
797 aa  234  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  25.47 
 
 
786 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>