More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0231 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0124  OMP85 family outer membrane protein  49.87 
 
 		 739 aa  739    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1757  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  49.22 
 
 		 759 aa  710    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000442418  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1686  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  47.35 
 
 		 749 aa  685    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.998639  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0142  OMP85 family outer membrane protein  49.2 
 
 		 739 aa  721    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0561822  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  100 
 
 		 745 aa  1507    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0942  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  51.42 
 
 		 751 aa  717    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000918625  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0215  conserved hypothetical protein, putative outer membrane protein  48.51 
 
 		 738 aa  706    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0238562  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1501  OMP85 family outer membrane protein  50.98 
 
 		 757 aa  765    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0164  OMP85 family outer membrane protein  49.87 
 
 		 739 aa  738    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00465042  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0660  surface antigen (D15)  41.28 
 
 		 755 aa  550  1e-155  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.665209  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.75 
 
 		 752 aa  317  7e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  28.83 
 
 		 763 aa  303  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  26.24 
 
 		 751 aa  300  6e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.93 
 
 		 808 aa  300  6e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  28.83 
 
 		 752 aa  298  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  28.26 
 
 		 765 aa  295  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.86 
 
 		 895 aa  293  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  28.05 
 
 		 769 aa  292  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.96 
 
 		 769 aa  282  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.87 
 
 		 802 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  28.91 
 
 		 770 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  26.49 
 
 		 763 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.3 
 
 		 750 aa  274  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  25.78 
 
 		 785 aa  274  5.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.53 
 
 		 892 aa  272  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.17 
 
 		 765 aa  272  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  28.26 
 
 		 777 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  27.25 
 
 		 767 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  28.48 
 
 		 781 aa  266  7e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  27.25 
 
 		 790 aa  266  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.07 
 
 		 787 aa  265  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.73 
 
 		 770 aa  265  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3352  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.96 
 
 		 815 aa  265  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346772  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  27.38 
 
 		 768 aa  265  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  27.61 
 
 		 765 aa  263  6.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  27.38 
 
 		 768 aa  263  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  27.38 
 
 		 769 aa  263  8e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  27.38 
 
 		 768 aa  263  8e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  27.38 
 
 		 768 aa  263  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  27.38 
 
 		 768 aa  263  8e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  27.25 
 
 		 769 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  27.25 
 
 		 769 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.5 
 
 		 770 aa  261  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  26.45 
 
 		 788 aa  260  7e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1750  surface antigen (D15):surface antigen variable number  27.02 
 
 		 761 aa  258  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.330816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  27.22 
 
 		 791 aa  258  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  27.2 
 
 		 784 aa  257  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0949  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.61 
 
 		 809 aa  256  8e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00135315  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.44 
 
 		 765 aa  256  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3782  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.68 
 
 		 801 aa  256  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000907033  hitchhiker  0.00340919 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.75 
 
 		 769 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1843  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.83 
 
 		 803 aa  254  5.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000194278  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.83 
 
 		 768 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.69 
 
 		 769 aa  253  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0715  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.49 
 
 		 805 aa  252  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000733739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0322  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.27 
 
 		 784 aa  252  2e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3427  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.93 
 
 		 795 aa  251  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000902719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1074  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.93 
 
 		 795 aa  251  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000979052  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1021  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.93 
 
 		 795 aa  251  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000998639  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03229  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.47 
 
 		 804 aa  251  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2968  surface antigen (D15)  26.75 
 
 		 802 aa  251  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.270101  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  26.56 
 
 		 769 aa  251  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  26.43 
 
 		 769 aa  251  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  26.83 
 
 		 768 aa  251  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  26.43 
 
 		 769 aa  251  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.18 
 
 		 769 aa  251  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  24.8 
 
 		 767 aa  251  5e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  26.25 
 
 		 893 aa  250  6e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0357  outer membrane antigen  26.14 
 
 		 784 aa  250  7e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.433119  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.43 
 
 		 779 aa  250  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0188  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.82 
 
 		 810 aa  249  9e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000418762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0250  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.18 
 
 		 810 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.609554  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.18 
 
 		 810 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  0.197895 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002754  outer membrane protein assembly factor YaeT precursor  26.04 
 
 		 804 aa  249  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604223  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.52 
 
 		 780 aa  248  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  26.53 
 
 		 778 aa  248  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00175  hypothetical protein  25.7 
 
 		 810 aa  248  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000980871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3426  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.7 
 
 		 810 aa  248  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480767  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0187  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.7 
 
 		 810 aa  248  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00010789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00174  hypothetical protein  25.7 
 
 		 810 aa  248  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00018653  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0179  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.7 
 
 		 810 aa  248  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000266992  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3483  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.7 
 
 		 810 aa  248  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000802072  normal  0.102232 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0181  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.7 
 
 		 810 aa  248  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000194171  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0170  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.7 
 
 		 810 aa  248  4e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000513305  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.49 
 
 		 804 aa  247  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25845  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3157  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.25 
 
 		 805 aa  247  6.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0017892  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2419  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.61 
 
 		 806 aa  246  8e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0333898  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.85 
 
 		 803 aa  246  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0265  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.77 
 
 		 803 aa  246  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000300024  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  27.72 
 
 		 781 aa  244  3e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0262  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.77 
 
 		 803 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.84 
 
 		 800 aa  244  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  25.65 
 
 		 806 aa  243  9e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1458  surface antigen (D15)  26.75 
 
 		 780 aa  242  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.65 
 
 		 793 aa  242  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2972  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.91 
 
 		 807 aa  242  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0353111  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.42 
 
 		 784 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.65 
 
 		 793 aa  241  4e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  25.15 
 
 		 794 aa  239  9e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2540  surface antigen (D15)  26.2 
 
 		 772 aa  239  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>