More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1436 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_13921  membrane protein-like protein  52.29 
 
 		 743 aa  732    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.802793 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0909  import-associated channel, putative chloroplast protein IAP75  50.93 
 
 		 767 aa  689    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2119  outer envelope membrane protein-like  47.05 
 
 		 736 aa  641    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1436  outer envelope membrane protein-like  100 
 
 		 712 aa  1449    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05491  outer envelope membrane protein  46.36 
 
 		 762 aa  686    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.445832 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15241  outer envelope membrane protein-like protein  83.01 
 
 		 712 aa  1197    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14991  outer envelope membrane protein-like protein  72.63 
 
 		 714 aa  1079    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17651  outer envelope membrane protein-like protein  51.21 
 
 		 767 aa  692    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.773387 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15381  outer envelope membrane protein-like protein  83.99 
 
 		 712 aa  1212    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.613394  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0554  chloroplast outer envelope membrane protein-like  43.43 
 
 		 739 aa  634  1e-180  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3741  surface antigen (D15)  36.08 
 
 		 821 aa  421  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0928  outer envelope membrane protein  35.91 
 
 		 721 aa  405  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4497  surface antigen (D15)  37.17 
 
 		 688 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0094  surface antigen variable number  34.45 
 
 		 838 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39497  normal  0.155801 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2608  surface antigen (D15)  35.27 
 
 		 843 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4653  surface antigen (D15)  35.65 
 
 		 999 aa  385  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0482957 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0355  surface antigen (D15)  32.96 
 
 		 752 aa  366  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0362  surface antigen (D15)  32.96 
 
 		 752 aa  365  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0928  surface antigen (D15)  28.8 
 
 		 668 aa  247  4.9999999999999997e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1450  surface antigen (D15)  27.46 
 
 		 491 aa  180  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.490099  normal  0.0216399 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  24.96 
 
 		 560 aa  151  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  23.46 
 
 		 553 aa  147  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  25 
 
 		 683 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50834  predicted protein  26.32 
 
 		 580 aa  130  9.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0624274 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1555  surface antigen (D15)  35.94 
 
 		 488 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00258915  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0815  surface antigen (D15)  23.22 
 
 		 961 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  25.97 
 
 		 790 aa  103  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36376  predicted protein  23.94 
 
 		 519 aa  96.7  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.66 
 
 		 855 aa  89.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.62 
 
 		 857 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  30.21 
 
 		 888 aa  85.5  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23 
 
 		 829 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1082  surface antigen (D15)  26.24 
 
 		 767 aa  84.3  0.000000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.03 
 
 		 769 aa  84  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.56 
 
 		 821 aa  84  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.78 
 
 		 854 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.78 
 
 		 854 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.78 
 
 		 864 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.26 
 
 		 799 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.33 
 
 		 856 aa  81.3  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.65 
 
 		 784 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.79 
 
 		 844 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  32.5 
 
 		 841 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  23.16 
 
 		 834 aa  78.6  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  24.62 
 
 		 794 aa  77.8  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.78 
 
 		 787 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  21.71 
 
 		 787 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.81 
 
 		 769 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  30 
 
 		 852 aa  77  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  30.83 
 
 		 845 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  22.65 
 
 		 843 aa  76.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  29.67 
 
 		 777 aa  75.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  22.08 
 
 		 787 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3157  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.24 
 
 		 805 aa  76.6  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0017892  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  29.17 
 
 		 843 aa  75.5  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  22.3 
 
 		 768 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  22.3 
 
 		 768 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  22.3 
 
 		 768 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  22.3 
 
 		 769 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  22.3 
 
 		 769 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  22.3 
 
 		 768 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2453  surface antigen (D15)  31.05 
 
 		 772 aa  74.7  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0002154 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0142  OMP85 family outer membrane protein  27.93 
 
 		 739 aa  74.7  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0561822  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  22.3 
 
 		 768 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  22.3 
 
 		 769 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1446  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.55 
 
 		 800 aa  74.7  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  21.83 
 
 		 791 aa  74.7  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  29.17 
 
 		 844 aa  74.3  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  21.37 
 
 		 767 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  30 
 
 		 834 aa  73.9  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0124  OMP85 family outer membrane protein  26.58 
 
 		 739 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  23.62 
 
 		 795 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  23.23 
 
 		 791 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  22.08 
 
 		 784 aa  73.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  23.21 
 
 		 785 aa  73.6  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.17 
 
 		 841 aa  73.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  21.79 
 
 		 751 aa  73.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1074  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.06 
 
 		 795 aa  73.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000979052  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0715  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.41 
 
 		 805 aa  73.6  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000733739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0164  OMP85 family outer membrane protein  26.58 
 
 		 739 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00465042  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  22.2 
 
 		 913 aa  73.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1021  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.06 
 
 		 795 aa  73.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000998639  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3427  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.06 
 
 		 795 aa  73.9  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000902719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  22.3 
 
 		 769 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  22.3 
 
 		 769 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  28.37 
 
 		 778 aa  72.8  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  22.82 
 
 		 786 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  22.3 
 
 		 769 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  21.47 
 
 		 760 aa  72  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1684  surface antigen (D15)  22.17 
 
 		 862 aa  72  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.434922  normal  0.438103 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.85 
 
 		 769 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.3 
 
 		 769 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  22.08 
 
 		 768 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  22.82 
 
 		 786 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3273  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.71 
 
 		 827 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2972  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.57 
 
 		 807 aa  71.6  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0353111  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3153  surface antigen (D15)  35.71 
 
 		 827 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000352533  normal  0.0112151 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0188  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.71 
 
 		 810 aa  70.9  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000418762  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3426  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.16 
 
 		 810 aa  70.9  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480767  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0187  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.16 
 
 		 810 aa  70.9  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00010789  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>