More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0254 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  100 
 
 
683 aa  1384    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1082  surface antigen (D15)  35.96 
 
 
767 aa  307  5.0000000000000004e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  29.25 
 
 
553 aa  211  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3741  surface antigen (D15)  26.52 
 
 
821 aa  166  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0815  surface antigen (D15)  24.87 
 
 
961 aa  159  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0094  surface antigen variable number  24.91 
 
 
838 aa  156  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39497  normal  0.155801 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4497  surface antigen (D15)  23.97 
 
 
688 aa  150  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537472  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.17 
 
 
772 aa  143  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1436  outer envelope membrane protein-like  25 
 
 
712 aa  141  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  23.76 
 
 
560 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2608  surface antigen (D15)  23.61 
 
 
843 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4653  surface antigen (D15)  25.04 
 
 
999 aa  137  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0482957 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0355  surface antigen (D15)  24.57 
 
 
752 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0362  surface antigen (D15)  24.57 
 
 
752 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14991  outer envelope membrane protein-like protein  23.27 
 
 
714 aa  123  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15241  outer envelope membrane protein-like protein  24.63 
 
 
712 aa  120  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0928  outer envelope membrane protein  23.24 
 
 
721 aa  117  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4388  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.69 
 
 
865 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0400  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.76 
 
 
827 aa  113  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000108596  unclonable  0.0000045929 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  23.97 
 
 
893 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05491  outer envelope membrane protein  23.89 
 
 
762 aa  111  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.445832 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.21 
 
 
808 aa  108  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.13 
 
 
895 aa  108  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15381  outer envelope membrane protein-like protein  22.95 
 
 
712 aa  107  9e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.613394  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.73 
 
 
752 aa  107  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1446  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.23 
 
 
800 aa  106  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  22.54 
 
 
770 aa  105  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0397  surface antigen (D15)  25.48 
 
 
830 aa  105  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00277353  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13921  membrane protein-like protein  24.55 
 
 
743 aa  104  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.802793 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  24.49 
 
 
888 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.13 
 
 
802 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  22.48 
 
 
752 aa  102  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.53 
 
 
781 aa  102  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.69 
 
 
758 aa  102  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  21.53 
 
 
781 aa  102  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0265  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.66 
 
 
803 aa  101  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000300024  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.91 
 
 
865 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.518377  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.64 
 
 
821 aa  100  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000592139  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1529  putative surface antigen (D15)  24.35 
 
 
803 aa  99.4  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000190996  normal  0.0121061 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.36 
 
 
770 aa  99.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  23.26 
 
 
751 aa  99.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  22.57 
 
 
790 aa  99.8  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  23.16 
 
 
790 aa  99  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00175  hypothetical protein  23.16 
 
 
810 aa  99  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000980871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3426  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.16 
 
 
810 aa  99  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480767  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17651  outer envelope membrane protein-like protein  23.58 
 
 
767 aa  98.6  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.773387 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0179  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.16 
 
 
810 aa  99  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000266992  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  22.54 
 
 
763 aa  99  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0170  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.16 
 
 
810 aa  99  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000513305  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0181  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.16 
 
 
810 aa  99  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000194171  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0187  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.16 
 
 
810 aa  99  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00010789  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00174  hypothetical protein  23.16 
 
 
810 aa  99  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00018653  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3483  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.16 
 
 
810 aa  99  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000802072  normal  0.102232 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0715  outer membrane protein assembly factor YaeT  22.51 
 
 
805 aa  98.6  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000733739  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0250  outer membrane protein assembly factor YaeT  22.54 
 
 
810 aa  98.2  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.609554  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  22.54 
 
 
810 aa  98.2  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  0.197895 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0262  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.48 
 
 
803 aa  97.4  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.26 
 
 
804 aa  97.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25845  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0188  outer membrane protein assembly factor YaeT  22.32 
 
 
810 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000418762  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.03 
 
 
831 aa  96.3  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000452148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  21.28 
 
 
769 aa  96.3  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  22.55 
 
 
791 aa  96.3  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0928  surface antigen (D15)  23.9 
 
 
668 aa  95.1  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1686  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.02 
 
 
749 aa  95.1  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.998639  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0164  OMP85 family outer membrane protein  23.62 
 
 
739 aa  94.7  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00465042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2540  surface antigen (D15)  22.38 
 
 
772 aa  94.4  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0124  OMP85 family outer membrane protein  23.62 
 
 
739 aa  94.4  7e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  23.68 
 
 
610 aa  94.4  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0554  chloroplast outer envelope membrane protein-like  22.85 
 
 
739 aa  94  8e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1708  surface antigen (D15)  23.79 
 
 
807 aa  94  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930875  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3427  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.3 
 
 
795 aa  93.6  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000902719  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1074  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.3 
 
 
795 aa  93.6  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000979052  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1796  surface antigen (D15)  23.64 
 
 
818 aa  93.2  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00389709  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1021  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.3 
 
 
795 aa  93.6  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000998639  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  24.81 
 
 
622 aa  93.2  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.05 
 
 
770 aa  92.8  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  22.82 
 
 
765 aa  92.4  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3782  outer membrane protein assembly factor YaeT  22.59 
 
 
801 aa  91.7  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000907033  hitchhiker  0.00340919 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  21.62 
 
 
760 aa  90.9  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  22.77 
 
 
763 aa  90.9  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3412  outer membrane protein; surface antigen  22.52 
 
 
848 aa  90.1  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1053  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.08 
 
 
807 aa  90.1  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.78 
 
 
848 aa  89.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  22.87 
 
 
781 aa  89.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  25.15 
 
 
609 aa  89.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  23.83 
 
 
778 aa  88.6  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.2 
 
 
765 aa  88.6  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.12 
 
 
574 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0909  import-associated channel, putative chloroplast protein IAP75  22.91 
 
 
767 aa  87.8  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0718  OMP85 family outer membrane protein  23.22 
 
 
744 aa  88.2  5e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  20.53 
 
 
767 aa  88.2  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  24.38 
 
 
574 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0215  conserved hypothetical protein, putative outer membrane protein  23.14 
 
 
738 aa  87.8  7e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0238562  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  21.08 
 
 
768 aa  87.4  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  23.26 
 
 
622 aa  87  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  22.37 
 
 
766 aa  87  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  21.08 
 
 
769 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2119  outer envelope membrane protein-like  22.22 
 
 
736 aa  86.7  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  33.83 
 
 
653 aa  86.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.08 
 
 
768 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.426313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>