More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4224 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1716  surface antigen (D15)  53.01 
 
 
653 aa  652    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  100 
 
 
653 aa  1297    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  41.44 
 
 
663 aa  429  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  39.52 
 
 
665 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  38.8 
 
 
661 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  39.23 
 
 
661 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  39.29 
 
 
661 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  39.88 
 
 
677 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  40.59 
 
 
652 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  38.18 
 
 
643 aa  382  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  37.86 
 
 
639 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0053  surface antigen (D15)  38.07 
 
 
671 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0047  hypothetical protein  37.7 
 
 
639 aa  375  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.858357  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  36.59 
 
 
620 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  38.24 
 
 
674 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  36.47 
 
 
637 aa  356  6.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  36.18 
 
 
622 aa  356  8.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  36.36 
 
 
622 aa  356  8.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  32.2 
 
 
653 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2099  surface antigen  35.32 
 
 
632 aa  270  5e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  35.89 
 
 
776 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  31.3 
 
 
647 aa  248  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2905  surface antigen (D15)  32.98 
 
 
789 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0651948 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3381  hypothetical protein  31.41 
 
 
594 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  29.61 
 
 
595 aa  238  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  30.14 
 
 
588 aa  234  5e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  33.51 
 
 
607 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  30.02 
 
 
627 aa  233  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  31.26 
 
 
627 aa  230  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  33.33 
 
 
607 aa  230  5e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0384  surface antigen (D15)  32.51 
 
 
615 aa  228  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  29.76 
 
 
702 aa  221  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2483  surface antigen (D15)  30.32 
 
 
593 aa  218  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.190586  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  28.36 
 
 
598 aa  205  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  31.32 
 
 
595 aa  204  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2395  surface antigen (D15)  28.11 
 
 
610 aa  198  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  27.23 
 
 
633 aa  197  7e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  30.78 
 
 
670 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  30.83 
 
 
613 aa  193  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  28.97 
 
 
571 aa  192  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1102  surface antigen (D15)  30.34 
 
 
709 aa  191  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  29.33 
 
 
779 aa  163  8.000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  25.18 
 
 
610 aa  148  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  26.22 
 
 
583 aa  138  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2434  surface antigen (D15)  26.38 
 
 
575 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.208591  normal  0.972609 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2694  hypothetical protein  24.39 
 
 
579 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  27.29 
 
 
558 aa  134  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31680  hypothetical protein  24.14 
 
 
579 aa  134  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.574321 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  24.81 
 
 
583 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  24.95 
 
 
583 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  25.56 
 
 
575 aa  132  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  24.9 
 
 
580 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28860  outer membrane surface antigen (D15)  25.73 
 
 
555 aa  124  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238861  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  26.69 
 
 
574 aa  123  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1958  outer membrane protein, OMP85 family  23.11 
 
 
576 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1626  surface antigen (D15)  23.11 
 
 
618 aa  121  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.200512  hitchhiker  0.00000168183 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0448  outer membrane protein, OMP85 family  25.54 
 
 
573 aa  117  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  25.31 
 
 
574 aa  115  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0296  surface antigen (D15)  25.38 
 
 
596 aa  114  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443396  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0188  hypothetical protein  26.35 
 
 
607 aa  114  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2808  surface antigen (D15)  25.05 
 
 
603 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  24.17 
 
 
609 aa  110  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0370  Outer membrane protein  25.97 
 
 
588 aa  108  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  25.4 
 
 
657 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  24.92 
 
 
677 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2172  surface antigen (D15)  23.48 
 
 
636 aa  107  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  25.83 
 
 
582 aa  107  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  24.47 
 
 
677 aa  107  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1505  surface antigen (D15)  23.34 
 
 
613 aa  102  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5265  surface antigen (D15)  26.14 
 
 
835 aa  100  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  25.68 
 
 
765 aa  99.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  25.33 
 
 
777 aa  98.6  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  23.29 
 
 
573 aa  98.2  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  25.62 
 
 
888 aa  98.2  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  26.14 
 
 
752 aa  98.2  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  22.16 
 
 
760 aa  98.2  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2194  surface antigen (D15)  25.53 
 
 
591 aa  97.8  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.685824 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0173  surface antigen (D15)  23.68 
 
 
673 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182212  normal  0.412559 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  26.69 
 
 
820 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1087  surface antigen (D15)  23.64 
 
 
597 aa  95.5  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000374236 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  24.61 
 
 
578 aa  95.5  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1444  surface antigen (D15)  22.45 
 
 
596 aa  95.1  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0504  surface antigen (D15)  24.86 
 
 
629 aa  94  7e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.89986  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.6 
 
 
769 aa  94  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.78 
 
 
768 aa  94  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03724  pathogenicity protein  25.71 
 
 
584 aa  93.2  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1863  surface antigen (D15)  37.76 
 
 
611 aa  93.2  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25 
 
 
793 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.88 
 
 
770 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1903  surface antigen (D15)  23.25 
 
 
617 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  21.25 
 
 
768 aa  92.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.11 
 
 
793 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1936  surface antigen (D15)  23.25 
 
 
617 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.538993  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1929  surface antigen (D15)  23.06 
 
 
617 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229005  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  24.26 
 
 
806 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3176  surface antigen (D15)  22.91 
 
 
601 aa  92  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2390  surface antigen (D15)  23.06 
 
 
617 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.21138 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  22.83 
 
 
913 aa  92.4  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  23.65 
 
 
573 aa  91.7  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0568  pathogenicity protein  25.24 
 
 
612 aa  91.7  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>