More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4653 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2608  surface antigen (D15)  45.64 
 
 
843 aa  675    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0355  surface antigen (D15)  54.78 
 
 
752 aa  677    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4497  surface antigen (D15)  56.23 
 
 
688 aa  662    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537472  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0094  surface antigen variable number  53.86 
 
 
838 aa  666    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39497  normal  0.155801 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0362  surface antigen (D15)  54.78 
 
 
752 aa  675    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3741  surface antigen (D15)  53.67 
 
 
821 aa  665    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4653  surface antigen (D15)  100 
 
 
999 aa  1999    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0482957 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0928  outer envelope membrane protein  48.28 
 
 
721 aa  570  1e-161  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0928  surface antigen (D15)  40.03 
 
 
668 aa  457  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05491  outer envelope membrane protein  34.98 
 
 
762 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.445832 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13921  membrane protein-like protein  35.14 
 
 
743 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.802793 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0554  chloroplast outer envelope membrane protein-like  34.62 
 
 
739 aa  410  1e-113  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2119  outer envelope membrane protein-like  34.23 
 
 
736 aa  412  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1436  outer envelope membrane protein-like  35.65 
 
 
712 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15241  outer envelope membrane protein-like protein  35.8 
 
 
712 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15381  outer envelope membrane protein-like protein  35.35 
 
 
712 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.613394  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14991  outer envelope membrane protein-like protein  34.84 
 
 
714 aa  389  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0909  import-associated channel, putative chloroplast protein IAP75  32.47 
 
 
767 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17651  outer envelope membrane protein-like protein  32.32 
 
 
767 aa  373  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.773387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1450  surface antigen (D15)  39.37 
 
 
491 aa  325  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.490099  normal  0.0216399 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1555  surface antigen (D15)  41.14 
 
 
488 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00258915  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  27.72 
 
 
553 aa  198  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50834  predicted protein  27.6 
 
 
580 aa  191  4e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0624274 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  25.73 
 
 
560 aa  171  8e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0815  surface antigen (D15)  25.08 
 
 
961 aa  155  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  25.25 
 
 
683 aa  150  9e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  26.27 
 
 
888 aa  127  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36376  predicted protein  25.51 
 
 
519 aa  126  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.91 
 
 
772 aa  117  8.999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  23.18 
 
 
913 aa  110  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  24.51 
 
 
770 aa  109  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  23.43 
 
 
790 aa  109  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.38 
 
 
895 aa  109  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.56 
 
 
784 aa  102  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  24.95 
 
 
769 aa  102  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  27.52 
 
 
777 aa  100  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  25.06 
 
 
791 aa  99.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  23.36 
 
 
610 aa  99.4  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  26.47 
 
 
785 aa  98.2  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  23.73 
 
 
769 aa  97.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  23.73 
 
 
768 aa  97.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  23.73 
 
 
769 aa  97.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  23.73 
 
 
768 aa  97.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  23.73 
 
 
769 aa  97.1  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  23.73 
 
 
768 aa  97.1  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  23.73 
 
 
768 aa  97.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  23.73 
 
 
768 aa  97.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.44 
 
 
752 aa  95.5  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.29 
 
 
750 aa  95.1  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  25.84 
 
 
765 aa  94.7  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.52 
 
 
765 aa  94.7  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.63 
 
 
855 aa  94  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  23.83 
 
 
760 aa  93.2  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.02 
 
 
770 aa  92.4  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.5 
 
 
784 aa  92  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.34 
 
 
892 aa  92  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.21 
 
 
808 aa  91.7  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.58 
 
 
769 aa  91.7  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.73 
 
 
769 aa  91.7  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.57 
 
 
821 aa  91.3  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.55 
 
 
802 aa  90.1  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.09 
 
 
765 aa  89.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.05 
 
 
768 aa  88.6  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  23.74 
 
 
779 aa  88.2  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  23.27 
 
 
768 aa  87.8  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  23.98 
 
 
893 aa  87.8  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  24.57 
 
 
765 aa  87.4  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.81 
 
 
770 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  23.24 
 
 
751 aa  87  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  23.27 
 
 
769 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  23.27 
 
 
769 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.25 
 
 
769 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  23.27 
 
 
769 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.7 
 
 
844 aa  85.9  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1085  surface antigen  22.46 
 
 
778 aa  85.5  0.000000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.86 
 
 
769 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.73 
 
 
781 aa  85.1  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1082  surface antigen (D15)  25.89 
 
 
767 aa  85.5  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  23.78 
 
 
765 aa  84.7  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  29.3 
 
 
834 aa  84.7  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  23.62 
 
 
763 aa  84.7  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2265  surface antigen (D15)  25.44 
 
 
839 aa  84.3  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1446  surface antigen (D15)  24.71 
 
 
765 aa  84.3  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.332057 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.06 
 
 
787 aa  83.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0718  OMP85 family outer membrane protein  22.73 
 
 
744 aa  83.2  0.00000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  22.7 
 
 
767 aa  84  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  27.21 
 
 
785 aa  83.2  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1766  surface antigen (D15)  24.41 
 
 
766 aa  82.8  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0726033  normal  0.0207518 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  22.16 
 
 
766 aa  82.4  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.46 
 
 
854 aa  82.4  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.46 
 
 
864 aa  81.6  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.46 
 
 
854 aa  81.6  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  24.53 
 
 
778 aa  80.5  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0636  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.34 
 
 
775 aa  80.9  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0791016  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.19 
 
 
787 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.73 
 
 
856 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  22.78 
 
 
852 aa  80.1  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.83 
 
 
765 aa  80.1  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  23.83 
 
 
765 aa  80.5  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.37 
 
 
841 aa  79.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>