194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1082 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1082  surface antigen (D15)  100 
 
 		 767 aa  1545    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  35.24 
 
 		 683 aa  305  3.0000000000000004e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4497  surface antigen (D15)  27.76 
 
 		 688 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0928  outer envelope membrane protein  24.9 
 
 		 721 aa  95.1  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13921  membrane protein-like protein  25.66 
 
 		 743 aa  90.5  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.802793 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3741  surface antigen (D15)  24.68 
 
 		 821 aa  88.2  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05491  outer envelope membrane protein  23.17 
 
 		 762 aa  87.8  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.445832 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0094  surface antigen variable number  24.79 
 
 		 838 aa  85.9  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39497  normal  0.155801 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0554  chloroplast outer envelope membrane protein-like  26.43 
 
 		 739 aa  84.7  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1436  outer envelope membrane protein-like  26.24 
 
 		 712 aa  84.7  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4653  surface antigen (D15)  25.89 
 
 		 999 aa  85.1  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0482957 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15241  outer envelope membrane protein-like protein  27.72 
 
 		 712 aa  84.7  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  26.1 
 
 		 553 aa  84  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0362  surface antigen (D15)  28.2 
 
 		 752 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0355  surface antigen (D15)  27.55 
 
 		 752 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15381  outer envelope membrane protein-like protein  26.14 
 
 		 712 aa  78.6  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.613394  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17651  outer envelope membrane protein-like protein  24.69 
 
 		 767 aa  78.2  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.773387 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14991  outer envelope membrane protein-like protein  25.06 
 
 		 714 aa  77.4  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  26.07 
 
 		 560 aa  76.6  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2608  surface antigen (D15)  24.48 
 
 		 843 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1458  surface antigen (D15)  26.06 
 
 		 827 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000234879  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2119  outer envelope membrane protein-like  25.09 
 
 		 736 aa  75.1  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2877  surface antigen (D15)  26.54 
 
 		 827 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000948  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  22.36 
 
 		 781 aa  74.3  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.36 
 
 		 781 aa  74.3  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2894  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.41 
 
 		 826 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172199  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1637  surface antigen  25.73 
 
 		 826 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2807  surface antigen (D15)  25.73 
 
 		 826 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000285002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1489  surface antigen (D15)  25.41 
 
 		 826 aa  72  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1453  surface antigen (D15)  25.41 
 
 		 826 aa  72  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000244779  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1074  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.59 
 
 		 795 aa  72  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000979052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3427  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.59 
 
 		 795 aa  72  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000902719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1021  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.59 
 
 		 795 aa  72  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000998639  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2633  surface antigen (D15)  25.41 
 
 		 826 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000445373  normal  0.203506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2700  surface antigen (D15)  25.41 
 
 		 826 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000360043  hitchhiker  0.00504138 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1147  surface antigen  24.18 
 
 		 844 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003885  normal  0.883859 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3273  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.41 
 
 		 827 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1562  surface antigen (D15)  26.4 
 
 		 827 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000380588  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1356  surface antigen (D15)  24.25 
 
 		 826 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000205975  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  25.06 
 
 		 765 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0909  import-associated channel, putative chloroplast protein IAP75  24.91 
 
 		 767 aa  69.3  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2627  surface antigen (D15)  25.08 
 
 		 827 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0218715  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3153  surface antigen (D15)  25.16 
 
 		 827 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000352533  normal  0.0112151 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  22.66 
 
 		 875 aa  66.6  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  26.22 
 
 		 778 aa  65.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1278  surface antigen (D15)  25.08 
 
 		 827 aa  66.2  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00357264  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.76 
 
 		 848 aa  63.9  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  21.03 
 
 		 913 aa  62.4  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002754  outer membrane protein assembly factor YaeT precursor  21.4 
 
 		 804 aa  62  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604223  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2265  surface antigen (D15)  23.05 
 
 		 839 aa  62  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0815  surface antigen (D15)  20.64 
 
 		 961 aa  61.6  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.39 
 
 		 821 aa  61.2  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2419  outer membrane protein assembly factor YaeT  21.11 
 
 		 806 aa  60.8  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0333898  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00175  hypothetical protein  23.45 
 
 		 810 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000980871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3426  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.45 
 
 		 810 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480767  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0188  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.45 
 
 		 810 aa  60.8  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000418762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0170  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.45 
 
 		 810 aa  60.5  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000513305  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0187  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.45 
 
 		 810 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00010789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0181  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.45 
 
 		 810 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000194171  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00174  hypothetical protein  23.45 
 
 		 810 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00018653  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0179  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.45 
 
 		 810 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000266992  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3483  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.45 
 
 		 810 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000802072  normal  0.102232 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  21.77 
 
 		 781 aa  60.8  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03229  outer membrane protein assembly factor YaeT  21.8 
 
 		 804 aa  59.7  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  25.88 
 
 		 834 aa  59.3  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0250  outer membrane protein assembly factor YaeT  22.3 
 
 		 810 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.609554  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  22.3 
 
 		 810 aa  58.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  0.197895 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  30 
 
 		 588 aa  59.3  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0265  outer membrane protein assembly factor YaeT  22.3 
 
 		 803 aa  58.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000300024  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0715  outer membrane protein assembly factor YaeT  22.3 
 
 		 805 aa  58.9  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000733739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.99 
 
 		 856 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2968  surface antigen (D15)  23.66 
 
 		 802 aa  58.2  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.270101  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  22.3 
 
 		 804 aa  58.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25845  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3157  outer membrane protein assembly factor YaeT  22.45 
 
 		 805 aa  57.8  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0017892  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0949  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.65 
 
 		 809 aa  57.4  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00135315  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3352  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.65 
 
 		 815 aa  57  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346772  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1684  surface antigen (D15)  23.93 
 
 		 862 aa  57.4  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.434922  normal  0.438103 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2972  outer membrane protein assembly factor YaeT  22.09 
 
 		 807 aa  57  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0353111  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0191  outer membrane protein, putative  25.08 
 
 		 891 aa  56.6  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.796772 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.18 
 
 		 831 aa  56.6  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000452148  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  24.54 
 
 		 767 aa  56.2  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0397  surface antigen (D15)  24.07 
 
 		 830 aa  56.2  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00277353  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.78 
 
 		 855 aa  56.2  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1843  outer membrane protein assembly factor YaeT  21.11 
 
 		 803 aa  56.2  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000194278  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.21 
 
 		 864 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  23.17 
 
 		 893 aa  55.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.21 
 
 		 854 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.21 
 
 		 854 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  19.63 
 
 		 784 aa  55.5  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.47 
 
 		 808 aa  55.1  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.65 
 
 		 802 aa  55.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.56 
 
 		 781 aa  54.7  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1446  surface antigen (D15)  20.5 
 
 		 765 aa  54.7  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.332057 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0569  hypothetical protein  22.19 
 
 		 770 aa  53.9  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.21 
 
 		 844 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0262  outer membrane protein assembly factor YaeT  21.97 
 
 		 803 aa  53.9  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4388  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.33 
 
 		 865 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3782  outer membrane protein assembly factor YaeT  22.15 
 
 		 801 aa  53.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000907033  hitchhiker  0.00340919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.4 
 
 		 829 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1808  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.74 
 
 		 868 aa  53.5  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>