258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0909 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0909  import-associated channel, putative chloroplast protein IAP75  100 
 
 		 767 aa  1555    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13921  membrane protein-like protein  61.56 
 
 		 743 aa  904    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.802793 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0554  chloroplast outer envelope membrane protein-like  50.76 
 
 		 739 aa  788    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2119  outer envelope membrane protein-like  53.32 
 
 		 736 aa  780    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1436  outer envelope membrane protein-like  50.93 
 
 		 712 aa  704    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15241  outer envelope membrane protein-like protein  50.74 
 
 		 712 aa  686    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15381  outer envelope membrane protein-like protein  50.21 
 
 		 712 aa  689    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.613394  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05491  outer envelope membrane protein  58.91 
 
 		 762 aa  885    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.445832 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14991  outer envelope membrane protein-like protein  50.72 
 
 		 714 aa  707    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17651  outer envelope membrane protein-like protein  96.09 
 
 		 767 aa  1459    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.773387 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0928  outer envelope membrane protein  33.73 
 
 		 721 aa  385  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2608  surface antigen (D15)  34.4 
 
 		 843 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4497  surface antigen (D15)  32.79 
 
 		 688 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3741  surface antigen (D15)  32.71 
 
 		 821 aa  367  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0094  surface antigen variable number  32.5 
 
 		 838 aa  358  2.9999999999999997e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39497  normal  0.155801 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0355  surface antigen (D15)  32.08 
 
 		 752 aa  345  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0362  surface antigen (D15)  32.08 
 
 		 752 aa  343  5e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4653  surface antigen (D15)  34.42 
 
 		 999 aa  228  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0482957 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0928  surface antigen (D15)  33.1 
 
 		 668 aa  149  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1450  surface antigen (D15)  38.16 
 
 		 491 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.490099  normal  0.0216399 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1555  surface antigen (D15)  38.1 
 
 		 488 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00258915  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50834  predicted protein  22.46 
 
 		 580 aa  110  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0624274 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  23.05 
 
 		 683 aa  98.6  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  26.4 
 
 		 553 aa  87.4  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.07 
 
 		 772 aa  84.7  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  26.26 
 
 		 560 aa  81.3  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  25.23 
 
 		 852 aa  78.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0751  surface antigen  25.33 
 
 		 840 aa  78.2  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  25.54 
 
 		 896 aa  78.2  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  24.66 
 
 		 845 aa  76.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  22.94 
 
 		 785 aa  75.5  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  25.23 
 
 		 844 aa  75.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  28.05 
 
 		 843 aa  75.1  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.23 
 
 		 841 aa  74.7  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1082  surface antigen (D15)  24.91 
 
 		 767 aa  74.7  0.000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  27.81 
 
 		 834 aa  74.3  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  28.57 
 
 		 841 aa  74.3  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.03 
 
 		 844 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.76 
 
 		 855 aa  73.6  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.34 
 
 		 857 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.66 
 
 		 829 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.56 
 
 		 854 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.56 
 
 		 854 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.34 
 
 		 864 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.56 
 
 		 856 aa  71.6  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.62 
 
 		 808 aa  71.2  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0815  surface antigen (D15)  24.04 
 
 		 961 aa  70.9  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  27.44 
 
 		 843 aa  70.1  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.1 
 
 		 821 aa  70.1  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  24.66 
 
 		 791 aa  70.1  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.4 
 
 		 770 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  30.58 
 
 		 888 aa  68.2  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1529  putative surface antigen (D15)  26.28 
 
 		 803 aa  68.2  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000190996  normal  0.0121061 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1446  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.97 
 
 		 800 aa  68.2  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.18 
 
 		 802 aa  68.2  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.93 
 
 		 769 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  23.6 
 
 		 777 aa  67.4  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1796  surface antigen (D15)  23.64 
 
 		 818 aa  67  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00389709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  23.94 
 
 		 790 aa  67  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1708  surface antigen (D15)  25.93 
 
 		 807 aa  67  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  23.53 
 
 		 769 aa  67  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  23.27 
 
 		 784 aa  66.6  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3999  surface antigen (D15)  33.04 
 
 		 782 aa  65.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54012  normal  0.826111 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36376  predicted protein  31.07 
 
 		 519 aa  65.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.85 
 
 		 781 aa  65.5  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  24.12 
 
 		 767 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.11 
 
 		 770 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.66 
 
 		 769 aa  64.7  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  25.4 
 
 		 765 aa  64.3  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  24.45 
 
 		 752 aa  63.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.88 
 
 		 779 aa  62.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  25 
 
 		 758 aa  62.8  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3273  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.06 
 
 		 827 aa  62.4  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  22.03 
 
 		 834 aa  62  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3153  surface antigen (D15)  30.06 
 
 		 827 aa  62  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000352533  normal  0.0112151 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.38 
 
 		 780 aa  61.6  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  25.12 
 
 		 794 aa  61.6  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  23.91 
 
 		 781 aa  61.2  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.91 
 
 		 781 aa  61.2  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  21.15 
 
 		 765 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  28.83 
 
 		 778 aa  60.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.96 
 
 		 800 aa  59.7  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  19.78 
 
 		 785 aa  58.9  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.96 
 
 		 895 aa  58.9  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1369  surface antigen (D15)  25.51 
 
 		 799 aa  58.9  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.747321  decreased coverage  0.00880921 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2711  putative outer membrane protein  25.51 
 
 		 799 aa  58.9  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.902664  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2607  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.12 
 
 		 811 aa  58.9  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.745531  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0142  OMP85 family outer membrane protein  24.89 
 
 		 739 aa  58.2  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0561822  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2627  surface antigen (D15)  28.72 
 
 		 827 aa  58.5  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0218715  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  23.05 
 
 		 781 aa  58.2  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.03 
 
 		 803 aa  58.2  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1147  surface antigen  30.33 
 
 		 844 aa  57.8  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003885  normal  0.883859 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0124  OMP85 family outer membrane protein  24.79 
 
 		 739 aa  57.4  0.0000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.42 
 
 		 768 aa  57  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.38 
 
 		 765 aa  57  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.06 
 
 		 804 aa  57.4  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847749 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1489  surface antigen (D15)  28.22 
 
 		 826 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  24.42 
 
 		 768 aa  57  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2894  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.22 
 
 		 826 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172199  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2807  surface antigen (D15)  28.22 
 
 		 826 aa  57  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000285002  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>