56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1555 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1555  surface antigen (D15)  100 
 
 
488 aa  960    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00258915  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4497  surface antigen (D15)  46.02 
 
 
688 aa  259  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537472  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4653  surface antigen (D15)  40.3 
 
 
999 aa  228  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0482957 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2608  surface antigen (D15)  39.94 
 
 
843 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0094  surface antigen variable number  39.77 
 
 
838 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39497  normal  0.155801 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3741  surface antigen (D15)  40.35 
 
 
821 aa  200  6e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0928  surface antigen (D15)  39.39 
 
 
668 aa  200  6e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0362  surface antigen (D15)  37.86 
 
 
752 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0355  surface antigen (D15)  38.24 
 
 
752 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1450  surface antigen (D15)  38.46 
 
 
491 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.490099  normal  0.0216399 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0928  outer envelope membrane protein  39.34 
 
 
721 aa  179  8e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0909  import-associated channel, putative chloroplast protein IAP75  31.04 
 
 
767 aa  136  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17651  outer envelope membrane protein-like protein  31.04 
 
 
767 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.773387 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05491  outer envelope membrane protein  32.01 
 
 
762 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.445832 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1436  outer envelope membrane protein-like  35.94 
 
 
712 aa  126  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14991  outer envelope membrane protein-like protein  37.5 
 
 
714 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13921  membrane protein-like protein  29.53 
 
 
743 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.802793 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15241  outer envelope membrane protein-like protein  36.06 
 
 
712 aa  113  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2119  outer envelope membrane protein-like  29.29 
 
 
736 aa  110  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50834  predicted protein  32.61 
 
 
580 aa  110  8.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0624274 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15381  outer envelope membrane protein-like protein  36.19 
 
 
712 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.613394  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0554  chloroplast outer envelope membrane protein-like  28.83 
 
 
739 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36376  predicted protein  26.45 
 
 
519 aa  87  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  29.29 
 
 
553 aa  68.6  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  32.27 
 
 
633 aa  55.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  29.56 
 
 
647 aa  56.2  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.91 
 
 
772 aa  55.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  23.83 
 
 
610 aa  54.7  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.76 
 
 
895 aa  54.3  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  28.04 
 
 
653 aa  53.9  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2814  hypothetical protein  30.88 
 
 
1224 aa  53.5  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28132  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4112  surface antigen (D15)  24.18 
 
 
414 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116065  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1425  surface antigen (D15)  28.11 
 
 
843 aa  51.6  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491464  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0541  hypothetical protein  26.42 
 
 
388 aa  51.2  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0408675  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  26.9 
 
 
607 aa  51.2  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3162  surface antigen (D15)  23.61 
 
 
414 aa  51.2  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.153148  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0482  hypothetical protein  26.94 
 
 
388 aa  50.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000379744  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  33.33 
 
 
913 aa  50.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3409  surface antigen (D15)  23.89 
 
 
430 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  26.55 
 
 
607 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  29.65 
 
 
677 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  26.64 
 
 
595 aa  47  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4688  hypothetical protein  23.83 
 
 
855 aa  47  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  30.83 
 
 
595 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  24.52 
 
 
613 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  26.01 
 
 
653 aa  45.4  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3353  surface antigen (D15)  23.28 
 
 
427 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0268  hypothetical protein  25 
 
 
383 aa  44.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  25.12 
 
 
702 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  23.68 
 
 
790 aa  44.7  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28 
 
 
892 aa  44.3  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  25.73 
 
 
888 aa  44.3  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0368  putative lipoprotein  24 
 
 
416 aa  43.9  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2446  surface antigen (D15)  28.02 
 
 
359 aa  43.5  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1411  metallophosphoesterase  26.37 
 
 
1223 aa  43.5  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.569709  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0660  hypothetical protein  25.39 
 
 
388 aa  43.5  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000211177  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>