298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0554 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0909  import-associated channel, putative chloroplast protein IAP75  50.76 
 
 		 767 aa  764    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0554  chloroplast outer envelope membrane protein-like  100 
 
 		 739 aa  1510    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2119  outer envelope membrane protein-like  74.34 
 
 		 736 aa  1141    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17651  outer envelope membrane protein-like protein  47.77 
 
 		 767 aa  750    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.773387 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13921  membrane protein-like protein  52.89 
 
 		 743 aa  804    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.802793 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05491  outer envelope membrane protein  66.33 
 
 		 762 aa  976    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.445832 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14991  outer envelope membrane protein-like protein  47.04 
 
 		 714 aa  638    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1436  outer envelope membrane protein-like  43.43 
 
 		 712 aa  634  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15241  outer envelope membrane protein-like protein  46.58 
 
 		 712 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15381  outer envelope membrane protein-like protein  45.49 
 
 		 712 aa  608  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.613394  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0928  outer envelope membrane protein  36.12 
 
 		 721 aa  419  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3741  surface antigen (D15)  33.93 
 
 		 821 aa  407  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0094  surface antigen variable number  34.72 
 
 		 838 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39497  normal  0.155801 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4653  surface antigen (D15)  34.47 
 
 		 999 aa  390  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0482957 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2608  surface antigen (D15)  34.44 
 
 		 843 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0355  surface antigen (D15)  31.86 
 
 		 752 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0362  surface antigen (D15)  31.86 
 
 		 752 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4497  surface antigen (D15)  34.63 
 
 		 688 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0928  surface antigen (D15)  25.26 
 
 		 668 aa  219  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1450  surface antigen (D15)  35.12 
 
 		 491 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.490099  normal  0.0216399 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  26.64 
 
 		 553 aa  100  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.37 
 
 		 829 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.65 
 
 		 856 aa  95.9  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.81 
 
 		 854 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.02 
 
 		 857 aa  94.7  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  27.62 
 
 		 560 aa  94.7  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  29.46 
 
 		 852 aa  94.7  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  22.85 
 
 		 683 aa  94.7  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  28.05 
 
 		 834 aa  94.4  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.19 
 
 		 854 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0751  surface antigen  32.89 
 
 		 840 aa  93.2  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.19 
 
 		 864 aa  93.2  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.38 
 
 		 821 aa  93.2  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.78 
 
 		 844 aa  92.4  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  29.73 
 
 		 844 aa  92  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.88 
 
 		 855 aa  91.7  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.18 
 
 		 841 aa  91.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0815  surface antigen (D15)  21.7 
 
 		 961 aa  91.3  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1555  surface antigen (D15)  33.33 
 
 		 488 aa  90.9  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00258915  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  27.34 
 
 		 777 aa  89.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  29.28 
 
 		 845 aa  89.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  33.33 
 
 		 843 aa  89.7  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  32.65 
 
 		 841 aa  87.8  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  31.09 
 
 		 785 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  22.73 
 
 		 781 aa  85.9  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.73 
 
 		 803 aa  85.9  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1082  surface antigen (D15)  27.02 
 
 		 767 aa  84.7  0.000000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  26.98 
 
 		 834 aa  84.7  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  31.41 
 
 		 843 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  23.59 
 
 		 778 aa  83.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  33.6 
 
 		 888 aa  83.2  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.43 
 
 		 920 aa  82.4  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50834  predicted protein  32.82 
 
 		 580 aa  82  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0624274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5827  putative protective surface antigen precursor (Outer membrane protein D15)  32.65 
 
 		 782 aa  80.9  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  35.97 
 
 		 785 aa  80.9  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.58 
 
 		 895 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.98 
 
 		 772 aa  79.7  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  27.61 
 
 		 896 aa  78.2  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  24.62 
 
 		 785 aa  75.9  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.11 
 
 		 781 aa  75.1  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  24.11 
 
 		 781 aa  75.1  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.7 
 
 		 895 aa  75.1  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0164  OMP85 family outer membrane protein  29.26 
 
 		 739 aa  74.7  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00465042  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0124  OMP85 family outer membrane protein  30.32 
 
 		 739 aa  74.3  0.000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30 
 
 		 892 aa  73.9  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1684  surface antigen (D15)  24.88 
 
 		 862 aa  72.8  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.434922  normal  0.438103 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0142  OMP85 family outer membrane protein  29.17 
 
 		 739 aa  73.2  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0561822  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  22.75 
 
 		 790 aa  72  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  30.95 
 
 		 794 aa  72  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.21 
 
 		 808 aa  72  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  25.73 
 
 		 893 aa  70.9  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.06 
 
 		 800 aa  70.5  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  23.67 
 
 		 752 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.72 
 
 		 785 aa  68.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1796  surface antigen (D15)  23.22 
 
 		 818 aa  68.6  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00389709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  33.11 
 
 		 913 aa  68.2  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  32.8 
 
 		 791 aa  68.6  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.18 
 
 		 802 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2607  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.14 
 
 		 811 aa  67.8  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.745531  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  22.74 
 
 		 905 aa  67.8  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  31.3 
 
 		 910 aa  67  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3999  surface antigen (D15)  31.25 
 
 		 782 aa  67  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54012  normal  0.826111 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  24.21 
 
 		 790 aa  67  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  25.25 
 
 		 788 aa  67  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.55 
 
 		 831 aa  67.4  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000452148  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  26.89 
 
 		 765 aa  65.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25 
 
 		 779 aa  65.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  32 
 
 		 784 aa  65.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  23.91 
 
 		 766 aa  65.9  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  24.38 
 
 		 769 aa  65.1  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25 
 
 		 780 aa  65.1  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2334  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.69 
 
 		 763 aa  65.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117402 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1808  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.55 
 
 		 868 aa  64.7  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0432  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.92 
 
 		 834 aa  64.7  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1446  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.65 
 
 		 800 aa  63.9  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  22.03 
 
 		 770 aa  63.5  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  24.37 
 
 		 765 aa  63.5  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.37 
 
 		 765 aa  63.5  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  30.82 
 
 		 798 aa  63.5  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1529  putative surface antigen (D15)  25.96 
 
 		 803 aa  63.2  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000190996  normal  0.0121061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>