189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1684 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2265  surface antigen (D15)  48.78 
 
 		 839 aa  805    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1684  surface antigen (D15)  100 
 
 		 862 aa  1726    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.434922  normal  0.438103 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1425  surface antigen (D15)  32.32 
 
 		 843 aa  384  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491464  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  25.37 
 
 		 553 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  28.34 
 
 		 560 aa  98.6  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0362  surface antigen (D15)  24.46 
 
 		 752 aa  90.9  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0355  surface antigen (D15)  24.46 
 
 		 752 aa  91.3  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4497  surface antigen (D15)  24.79 
 
 		 688 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15241  outer envelope membrane protein-like protein  23.54 
 
 		 712 aa  84.3  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.84 
 
 		 920 aa  82.4  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2608  surface antigen (D15)  24.79 
 
 		 843 aa  79  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.06 
 
 		 895 aa  77.4  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3741  surface antigen (D15)  23.84 
 
 		 821 aa  77.4  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0815  surface antigen (D15)  20.54 
 
 		 961 aa  75.1  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.84 
 
 		 784 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14991  outer envelope membrane protein-like protein  23.46 
 
 		 714 aa  74.7  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0554  chloroplast outer envelope membrane protein-like  24.88 
 
 		 739 aa  72.8  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  26.24 
 
 		 683 aa  73.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  21.46 
 
 		 786 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1561  OMP85 family outer membrane protein  21.37 
 
 		 817 aa  72.4  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347163  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05491  outer envelope membrane protein  23.6 
 
 		 762 aa  72.4  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.445832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  21.46 
 
 		 786 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1436  outer envelope membrane protein-like  22.17 
 
 		 712 aa  72  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  21.58 
 
 		 787 aa  71.2  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  21.12 
 
 		 769 aa  71.2  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  22.29 
 
 		 792 aa  70.5  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15381  outer envelope membrane protein-like protein  22.34 
 
 		 712 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.613394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.06 
 
 		 808 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.46 
 
 		 787 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  21.58 
 
 		 787 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  22.33 
 
 		 763 aa  69.7  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  21.23 
 
 		 763 aa  69.7  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  21.56 
 
 		 795 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.39 
 
 		 799 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  22.17 
 
 		 784 aa  66.6  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  22.96 
 
 		 781 aa  66.6  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.96 
 
 		 781 aa  66.6  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0215  conserved hypothetical protein, putative outer membrane protein  21.26 
 
 		 738 aa  65.9  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0238562  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  21.37 
 
 		 791 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  21.67 
 
 		 796 aa  65.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  23.87 
 
 		 794 aa  65.5  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  22.15 
 
 		 752 aa  65.5  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  22.55 
 
 		 893 aa  65.1  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.93 
 
 		 770 aa  64.7  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  23.78 
 
 		 767 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  23.65 
 
 		 896 aa  63.9  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.64 
 
 		 821 aa  63.9  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000592139  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0432  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.26 
 
 		 834 aa  64.3  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0094  surface antigen variable number  23.54 
 
 		 838 aa  63.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39497  normal  0.155801 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2119  outer envelope membrane protein-like  22.12 
 
 		 736 aa  63.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  22 
 
 		 768 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.01 
 
 		 769 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  23.75 
 
 		 769 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  23.75 
 
 		 768 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.22 
 
 		 770 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0400  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.27 
 
 		 827 aa  62.8  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000108596  unclonable  0.0000045929 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  23.75 
 
 		 769 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.1 
 
 		 797 aa  62  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1843  outer membrane protein assembly factor YaeT  22.57 
 
 		 803 aa  62  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000194278  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1796  surface antigen (D15)  21.25 
 
 		 818 aa  62.4  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00389709  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  23.56 
 
 		 769 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.56 
 
 		 802 aa  61.6  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  22.1 
 
 		 794 aa  61.6  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  23.56 
 
 		 768 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  23.56 
 
 		 768 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  23.56 
 
 		 768 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2447  OMP85 family outer membrane protein  20.45 
 
 		 796 aa  61.2  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.019137  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.62 
 
 		 758 aa  61.2  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  21.88 
 
 		 769 aa  61.2  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  22.04 
 
 		 791 aa  60.8  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  23.56 
 
 		 768 aa  61.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.33 
 
 		 787 aa  60.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  20.62 
 
 		 913 aa  60.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  20.9 
 
 		 888 aa  60.1  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  22.45 
 
 		 765 aa  59.7  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  24.94 
 
 		 852 aa  60.1  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1751  surface antigen family protein  24.66 
 
 		 820 aa  59.3  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.61 
 
 		 768 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  23.1 
 
 		 765 aa  58.9  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.1 
 
 		 765 aa  58.9  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1529  putative surface antigen (D15)  21.73 
 
 		 803 aa  58.9  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000190996  normal  0.0121061 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.89 
 
 		 895 aa  58.9  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.11 
 
 		 804 aa  58.9  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25845  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0265  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.12 
 
 		 803 aa  58.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000300024  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  21.18 
 
 		 786 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.42 
 
 		 752 aa  58.2  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0463  surface antigen family protein  24.46 
 
 		 858 aa  58.2  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  20.96 
 
 		 790 aa  57.8  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.61 
 
 		 769 aa  57.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0250  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.6 
 
 		 810 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.609554  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.34 
 
 		 769 aa  57.4  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  23.43 
 
 		 785 aa  57.4  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1082  surface antigen (D15)  23.12 
 
 		 767 aa  57.4  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.6 
 
 		 810 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  0.197895 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  22.41 
 
 		 769 aa  57.4  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13921  membrane protein-like protein  22.86 
 
 		 743 aa  57  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.802793 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  22.41 
 
 		 769 aa  57.4  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0715  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.19 
 
 		 805 aa  57  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000733739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  23.5 
 
 		 785 aa  57  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  32.61 
 
 		 770 aa  56.6  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>