272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_17651 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_05491  outer envelope membrane protein  58.47 
 
 
762 aa  879    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.445832 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17651  outer envelope membrane protein-like protein  100 
 
 
767 aa  1560    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.773387 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0909  import-associated channel, putative chloroplast protein IAP75  96.09 
 
 
767 aa  1454    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0554  chloroplast outer envelope membrane protein-like  47.77 
 
 
739 aa  773    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2119  outer envelope membrane protein-like  52.46 
 
 
736 aa  769    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15241  outer envelope membrane protein-like protein  51.03 
 
 
712 aa  687    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1436  outer envelope membrane protein-like  51.21 
 
 
712 aa  707    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14991  outer envelope membrane protein-like protein  50.72 
 
 
714 aa  706    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13921  membrane protein-like protein  60.49 
 
 
743 aa  902    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.802793 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15381  outer envelope membrane protein-like protein  50.5 
 
 
712 aa  688    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.613394  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2608  surface antigen (D15)  34.69 
 
 
843 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0928  outer envelope membrane protein  33.14 
 
 
721 aa  374  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3741  surface antigen (D15)  32.51 
 
 
821 aa  366  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4497  surface antigen (D15)  32.2 
 
 
688 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537472  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0094  surface antigen variable number  32.5 
 
 
838 aa  354  4e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39497  normal  0.155801 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0355  surface antigen (D15)  32.38 
 
 
752 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0362  surface antigen (D15)  32.38 
 
 
752 aa  343  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4653  surface antigen (D15)  33.83 
 
 
999 aa  224  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0482957 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0928  surface antigen (D15)  33.1 
 
 
668 aa  148  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1450  surface antigen (D15)  38.16 
 
 
491 aa  139  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.490099  normal  0.0216399 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1555  surface antigen (D15)  38.1 
 
 
488 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00258915  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  23.53 
 
 
683 aa  110  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50834  predicted protein  22.35 
 
 
580 aa  105  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0624274 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  26.77 
 
 
553 aa  93.2  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.62 
 
 
772 aa  85.5  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0751  surface antigen  26.55 
 
 
840 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  24.8 
 
 
845 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1082  surface antigen (D15)  24.69 
 
 
767 aa  82.8  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  26.99 
 
 
852 aa  83.2  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  25.56 
 
 
844 aa  81.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  24.35 
 
 
560 aa  80.1  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  25.27 
 
 
896 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.01 
 
 
841 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  26.46 
 
 
841 aa  79  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  26.11 
 
 
843 aa  79.3  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0815  surface antigen (D15)  25.44 
 
 
961 aa  78.2  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  23.01 
 
 
785 aa  78.2  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  26.37 
 
 
834 aa  77.8  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.76 
 
 
855 aa  75.9  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.77 
 
 
844 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.27 
 
 
829 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.67 
 
 
857 aa  75.5  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.32 
 
 
854 aa  74.3  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.32 
 
 
854 aa  74.7  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.22 
 
 
856 aa  74.3  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.32 
 
 
864 aa  74.3  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  25.66 
 
 
843 aa  73.9  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  26.44 
 
 
791 aa  73.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  23.69 
 
 
777 aa  72.8  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.1 
 
 
821 aa  72.8  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.36 
 
 
769 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.88 
 
 
770 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  27.72 
 
 
888 aa  71.2  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.55 
 
 
769 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1446  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.53 
 
 
800 aa  70.5  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  23.47 
 
 
790 aa  70.1  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3999  surface antigen (D15)  28.79 
 
 
782 aa  70.1  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54012  normal  0.826111 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25 
 
 
784 aa  68.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.62 
 
 
770 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.14 
 
 
808 aa  68.2  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  24.62 
 
 
767 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  22.97 
 
 
769 aa  67.8  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1529  putative surface antigen (D15)  25.09 
 
 
803 aa  67  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000190996  normal  0.0121061 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.39 
 
 
781 aa  66.6  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1796  surface antigen (D15)  23.64 
 
 
818 aa  67.4  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00389709  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  22.93 
 
 
765 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36376  predicted protein  31.07 
 
 
519 aa  66.2  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1708  surface antigen (D15)  24.74 
 
 
807 aa  65.9  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930875  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  22.74 
 
 
778 aa  65.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  23.81 
 
 
752 aa  65.5  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  24.42 
 
 
758 aa  65.5  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.32 
 
 
895 aa  65.1  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.48 
 
 
802 aa  64.7  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3273  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.63 
 
 
827 aa  64.3  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  25.59 
 
 
794 aa  63.9  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  21.94 
 
 
785 aa  63.9  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  27.97 
 
 
834 aa  63.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3153  surface antigen (D15)  29.01 
 
 
827 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000352533  normal  0.0112151 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1369  surface antigen (D15)  25.64 
 
 
799 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.747321  decreased coverage  0.00880921 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2711  putative outer membrane protein  25.64 
 
 
799 aa  62.4  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.902664  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  21.6 
 
 
763 aa  62.4  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.11 
 
 
781 aa  62  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  24.11 
 
 
781 aa  62  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0142  OMP85 family outer membrane protein  24.89 
 
 
739 aa  61.6  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0561822  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.53 
 
 
848 aa  61.6  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  22.39 
 
 
765 aa  60.8  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0124  OMP85 family outer membrane protein  24 
 
 
739 aa  60.8  0.00000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0164  OMP85 family outer membrane protein  24 
 
 
739 aa  60.5  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00465042  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2146  surface antigen (D15)  24.04 
 
 
792 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.766596  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.92 
 
 
769 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.87 
 
 
779 aa  59.7  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  23.97 
 
 
781 aa  59.3  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.97 
 
 
803 aa  59.7  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  23.92 
 
 
769 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  23.92 
 
 
769 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1453  surface antigen (D15)  27.16 
 
 
826 aa  58.9  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000244779  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1489  surface antigen (D15)  27.16 
 
 
826 aa  58.9  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390259  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.37 
 
 
780 aa  58.9  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2627  surface antigen (D15)  28.72 
 
 
827 aa  59.3  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0218715  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  22.66 
 
 
763 aa  58.9  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>