More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0362 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  61.19 
 
 
950 aa  1085    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1840  Patatin  48.75 
 
 
900 aa  846    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  49.71 
 
 
909 aa  851    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  100 
 
 
875 aa  1785    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  48.75 
 
 
981 aa  848    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  60.02 
 
 
894 aa  1104    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  56.91 
 
 
923 aa  1042    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  38.44 
 
 
728 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  34.47 
 
 
728 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  36.61 
 
 
728 aa  171  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  37.41 
 
 
728 aa  171  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  37.67 
 
 
728 aa  170  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  38.01 
 
 
751 aa  170  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  35.14 
 
 
720 aa  169  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  37.93 
 
 
727 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  31.96 
 
 
737 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  36.01 
 
 
741 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  38.97 
 
 
738 aa  165  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  38.97 
 
 
738 aa  165  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  36.23 
 
 
740 aa  164  5.0000000000000005e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  34.83 
 
 
735 aa  164  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  34.29 
 
 
751 aa  162  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  33.07 
 
 
735 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  33.07 
 
 
754 aa  162  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  38.6 
 
 
738 aa  162  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  40.43 
 
 
933 aa  161  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  40.43 
 
 
920 aa  161  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  40.43 
 
 
945 aa  161  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  40.35 
 
 
930 aa  160  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  40.43 
 
 
728 aa  160  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  40.86 
 
 
852 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  30.73 
 
 
734 aa  159  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  37.5 
 
 
739 aa  159  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  38.01 
 
 
767 aa  157  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  32.58 
 
 
737 aa  157  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  32.58 
 
 
738 aa  157  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  36.23 
 
 
738 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  35.87 
 
 
736 aa  156  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  36.82 
 
 
733 aa  156  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  32.58 
 
 
738 aa  156  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  32.17 
 
 
740 aa  155  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  39.93 
 
 
803 aa  154  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  39.93 
 
 
803 aa  154  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  40.21 
 
 
798 aa  153  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  39.57 
 
 
804 aa  153  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  40.21 
 
 
796 aa  153  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  39.57 
 
 
803 aa  152  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  31.58 
 
 
760 aa  152  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  35.51 
 
 
738 aa  152  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  40.29 
 
 
714 aa  151  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  32.22 
 
 
737 aa  150  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  39.78 
 
 
813 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  33.53 
 
 
748 aa  149  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  30.77 
 
 
733 aa  148  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  30.92 
 
 
775 aa  146  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  35.86 
 
 
777 aa  144  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  36.97 
 
 
750 aa  143  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  37.78 
 
 
667 aa  142  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1334  patatin-like protein of phospholipase family protein  36.26 
 
 
745 aa  142  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425162  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  27.27 
 
 
746 aa  141  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  35.05 
 
 
790 aa  140  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  33.52 
 
 
707 aa  135  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  32.66 
 
 
753 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  31.18 
 
 
745 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  31.4 
 
 
771 aa  127  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  33 
 
 
776 aa  125  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  31.34 
 
 
275 aa  125  4e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  30.97 
 
 
275 aa  123  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  30.6 
 
 
275 aa  120  9e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  31.16 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  33.33 
 
 
764 aa  118  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  35.94 
 
 
335 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  34.56 
 
 
315 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  35.75 
 
 
323 aa  114  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  29.25 
 
 
311 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  29.45 
 
 
346 aa  112  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  30.27 
 
 
349 aa  111  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  33.94 
 
 
323 aa  111  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  29.45 
 
 
346 aa  111  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  29.14 
 
 
308 aa  110  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  33.2 
 
 
310 aa  110  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  30.25 
 
 
302 aa  108  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  32.32 
 
 
250 aa  108  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  29.28 
 
 
310 aa  108  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  30.6 
 
 
305 aa  108  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  30.6 
 
 
306 aa  108  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  30.6 
 
 
305 aa  108  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  25.86 
 
 
260 aa  107  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  29.89 
 
 
272 aa  106  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  29.89 
 
 
302 aa  106  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  31.82 
 
 
330 aa  105  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  32.59 
 
 
358 aa  105  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  29.87 
 
 
320 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  34.56 
 
 
315 aa  105  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  32.03 
 
 
315 aa  105  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  29.87 
 
 
320 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  27.3 
 
 
263 aa  105  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  28.19 
 
 
333 aa  104  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  29.61 
 
 
311 aa  104  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  29.9 
 
 
315 aa  104  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>