More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A1589 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  99.16 
 
 
714 aa  1435    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  100 
 
 
933 aa  1496    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  100 
 
 
728 aa  1476    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  90.64 
 
 
920 aa  1326    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  90.64 
 
 
930 aa  1324    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  73.38 
 
 
804 aa  1078    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  87.8 
 
 
852 aa  1281    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  100 
 
 
945 aa  1498    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  71.89 
 
 
813 aa  1056    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  49.93 
 
 
767 aa  670    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  72.26 
 
 
798 aa  1061    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  73.24 
 
 
803 aa  1072    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  72.12 
 
 
796 aa  1065    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  73.51 
 
 
803 aa  1080    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  73.51 
 
 
803 aa  1080    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  52.53 
 
 
667 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  36.18 
 
 
753 aa  425  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  37.11 
 
 
777 aa  422  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  36.88 
 
 
790 aa  417  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  36.65 
 
 
750 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  33.7 
 
 
745 aa  358  2.9999999999999997e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  33.15 
 
 
751 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  33.88 
 
 
733 aa  355  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  33.06 
 
 
727 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  32.83 
 
 
728 aa  356  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  33.38 
 
 
728 aa  351  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  32.88 
 
 
728 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  32.13 
 
 
737 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  32.15 
 
 
741 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  34.16 
 
 
728 aa  336  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  34.53 
 
 
728 aa  335  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  33.93 
 
 
748 aa  335  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  31.3 
 
 
738 aa  327  5e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  31.3 
 
 
737 aa  327  7e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  31.44 
 
 
738 aa  327  7e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  31.44 
 
 
736 aa  325  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  31.17 
 
 
738 aa  325  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  30.31 
 
 
735 aa  325  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  31.8 
 
 
734 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  31.32 
 
 
738 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  31.32 
 
 
738 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  31.66 
 
 
739 aa  321  3e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  30.98 
 
 
738 aa  320  7e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  31.22 
 
 
738 aa  316  9e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  30.77 
 
 
737 aa  311  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  30.27 
 
 
754 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  29.87 
 
 
751 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  30.72 
 
 
735 aa  301  3e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  31.41 
 
 
764 aa  290  5.0000000000000004e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0465  patatin  29.45 
 
 
729 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1334  patatin-like protein of phospholipase family protein  29.86 
 
 
745 aa  285  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425162  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  28.63 
 
 
771 aa  260  6e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  28.28 
 
 
733 aa  256  8e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  28.85 
 
 
776 aa  250  6e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  26.3 
 
 
740 aa  227  7e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  25 
 
 
760 aa  218  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  26.63 
 
 
740 aa  201  3e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  31.75 
 
 
720 aa  187  7e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  35.48 
 
 
707 aa  184  7e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  30.81 
 
 
746 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  39.37 
 
 
256 aa  180  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  36.51 
 
 
311 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  37.62 
 
 
333 aa  171  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  37.3 
 
 
320 aa  170  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  37.3 
 
 
320 aa  170  9e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  34.88 
 
 
263 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  36.97 
 
 
302 aa  166  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  37.46 
 
 
981 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  38.46 
 
 
330 aa  164  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  37.93 
 
 
293 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  37.33 
 
 
315 aa  164  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  37.67 
 
 
273 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  36.99 
 
 
317 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  39.93 
 
 
875 aa  162  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  38.08 
 
 
950 aa  162  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  37.54 
 
 
349 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  37.54 
 
 
308 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  37.41 
 
 
306 aa  160  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  37.41 
 
 
305 aa  160  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  37.41 
 
 
305 aa  160  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  34.56 
 
 
263 aa  159  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  34.56 
 
 
263 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  34.56 
 
 
263 aa  159  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  34.56 
 
 
263 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  34.56 
 
 
263 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  34.56 
 
 
263 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  37.41 
 
 
302 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  37.43 
 
 
923 aa  159  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  34.23 
 
 
263 aa  158  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  38.11 
 
 
474 aa  158  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  38.11 
 
 
306 aa  158  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  38.11 
 
 
347 aa  158  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  38.11 
 
 
347 aa  158  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  38.11 
 
 
347 aa  158  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  37.06 
 
 
302 aa  157  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  36.27 
 
 
301 aa  156  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  34.51 
 
 
253 aa  156  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  38.11 
 
 
358 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  33.24 
 
 
909 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  35.08 
 
 
346 aa  153  8.999999999999999e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>