More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03442 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  65.67 
 
 		 764 aa  979    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  80.26 
 
 		 776 aa  1282    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  100 
 
 		 771 aa  1583    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  38.34 
 
 		 738 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  38.21 
 
 		 738 aa  498  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  37.86 
 
 		 739 aa  496  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  37.65 
 
 		 738 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  38.34 
 
 		 738 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  38.18 
 
 		 738 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  38.04 
 
 		 738 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  37.5 
 
 		 737 aa  488  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  38.63 
 
 		 736 aa  489  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  38.04 
 
 		 737 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  38.93 
 
 		 738 aa  488  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  37.79 
 
 		 735 aa  474  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  37.07 
 
 		 751 aa  474  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  37.45 
 
 		 734 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  36.04 
 
 		 754 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  34.94 
 
 		 737 aa  449  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  33.96 
 
 		 735 aa  421  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1334  patatin-like protein of phospholipase family protein  34.96 
 
 		 745 aa  397  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  34.18 
 
 		 745 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  32.42 
 
 		 748 aa  361  3e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  31.26 
 
 		 741 aa  358  2.9999999999999997e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  33.2 
 
 		 750 aa  352  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  31.96 
 
 		 727 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  31.61 
 
 		 728 aa  336  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  32.3 
 
 		 728 aa  335  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  31.4 
 
 		 728 aa  335  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  31.02 
 
 		 728 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  30.89 
 
 		 751 aa  333  9e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  31.83 
 
 		 777 aa  331  4e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  32.16 
 
 		 728 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  30.9 
 
 		 733 aa  324  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  31.38 
 
 		 753 aa  308  3e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  29.65 
 
 		 767 aa  298  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  31.61 
 
 		 667 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  28.06 
 
 		 790 aa  278  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  29.46 
 
 		 813 aa  276  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  30.03 
 
 		 803 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  28.97 
 
 		 920 aa  275  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  30.03 
 
 		 803 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  30.03 
 
 		 803 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  28.97 
 
 		 930 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  29.08 
 
 		 796 aa  273  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  29.12 
 
 		 798 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  28.63 
 
 		 728 aa  270  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  28.51 
 
 		 933 aa  269  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  28.51 
 
 		 945 aa  269  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  28.8 
 
 		 804 aa  265  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  28.93 
 
 		 852 aa  264  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  28.67 
 
 		 714 aa  263  8e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0465  patatin  25.83 
 
 		 729 aa  219  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  28.46 
 
 		 733 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  28.06 
 
 		 760 aa  211  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  27.09 
 
 		 740 aa  204  7e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  31.03 
 
 		 740 aa  195  3e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  25.1 
 
 		 720 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  30.5 
 
 		 746 aa  174  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  36.13 
 
 		 981 aa  162  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  35.54 
 
 		 256 aa  161  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1840  Patatin  35.71 
 
 		 900 aa  160  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  35.37 
 
 		 707 aa  154  4e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  31.75 
 
 		 909 aa  155  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  33.67 
 
 		 923 aa  150  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  33.45 
 
 		 311 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  34.23 
 
 		 950 aa  147  6e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  34.69 
 
 		 320 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0958  patatin family protein  41.71 
 
 		 303 aa  147  7.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  32.57 
 
 		 894 aa  146  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  33.58 
 
 		 272 aa  144  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  31.58 
 
 		 315 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  32.18 
 
 		 320 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  32.18 
 
 		 333 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  32.18 
 
 		 320 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  31.4 
 
 		 875 aa  141  4.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  38.97 
 
 		 323 aa  140  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  33.45 
 
 		 775 aa  140  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  37.56 
 
 		 323 aa  135  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  31.05 
 
 		 260 aa  134  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  31.25 
 
 		 275 aa  134  5e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  31.75 
 
 		 259 aa  134  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  31.62 
 
 		 275 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  32.97 
 
 		 263 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  32.56 
 
 		 330 aa  130  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  31.25 
 
 		 275 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  35.43 
 
 		 323 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18298  predicted protein  27.91 
 
 		 1275 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  32.27 
 
 		 253 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  33.58 
 
 		 263 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  33.58 
 
 		 263 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  34.88 
 
 		 327 aa  128  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  32.48 
 
 		 311 aa  127  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  31.43 
 
 		 327 aa  126  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  30.07 
 
 		 302 aa  126  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  34.82 
 
 		 335 aa  126  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  33.12 
 
 		 316 aa  126  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  32.18 
 
 		 318 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  33.21 
 
 		 263 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  33.21 
 
 		 263 aa  125  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>