More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0765 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  100 
 
 
272 aa  541  1e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  45.87 
 
 
256 aa  224  9e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  46.34 
 
 
253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  42.97 
 
 
263 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  42.97 
 
 
263 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  43.37 
 
 
263 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  41.67 
 
 
263 aa  210  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  42.57 
 
 
263 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  42.57 
 
 
263 aa  210  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  42.57 
 
 
263 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  42.57 
 
 
263 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  42.17 
 
 
263 aa  209  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  42.17 
 
 
263 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  41.77 
 
 
263 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  40.91 
 
 
311 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  39.44 
 
 
260 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  41.06 
 
 
333 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  41.06 
 
 
320 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  41.06 
 
 
320 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  41.67 
 
 
273 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  41.9 
 
 
262 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  38.17 
 
 
280 aa  187  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  37.55 
 
 
293 aa  175  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  36.54 
 
 
323 aa  175  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  41.42 
 
 
320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  36.95 
 
 
323 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  36.44 
 
 
252 aa  169  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  34.47 
 
 
310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  34.34 
 
 
275 aa  166  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  35.11 
 
 
751 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  35.11 
 
 
728 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  33.67 
 
 
753 aa  163  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  35.04 
 
 
259 aa  162  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  33.58 
 
 
275 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  34.75 
 
 
728 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  33.96 
 
 
275 aa  160  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  35.11 
 
 
727 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  33.33 
 
 
750 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  34.88 
 
 
728 aa  159  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  35.45 
 
 
315 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  33.89 
 
 
733 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  35.45 
 
 
317 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  34.28 
 
 
767 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  34.23 
 
 
316 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  43.89 
 
 
287 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  33.72 
 
 
311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  34.66 
 
 
324 aa  153  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  31.93 
 
 
777 aa  152  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  33.33 
 
 
318 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  33.33 
 
 
318 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  33.68 
 
 
310 aa  151  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  45.2 
 
 
315 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  44.15 
 
 
335 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  32.19 
 
 
733 aa  149  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  32.99 
 
 
300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  33.6 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  34.51 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  33.85 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  34.27 
 
 
720 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  33.11 
 
 
741 aa  146  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  33.47 
 
 
298 aa  145  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  34.88 
 
 
728 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  34.52 
 
 
728 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  32.74 
 
 
790 aa  145  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  32.94 
 
 
319 aa  145  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  33.59 
 
 
346 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  33.33 
 
 
920 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  32.83 
 
 
346 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  33.33 
 
 
930 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  36.48 
 
 
358 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  45.65 
 
 
316 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  31.43 
 
 
760 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  45.65 
 
 
316 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  33.21 
 
 
852 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0981  hypothetical protein  32.51 
 
 
292 aa  142  5e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  31.03 
 
 
738 aa  142  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  32.86 
 
 
667 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  32.97 
 
 
945 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  32.97 
 
 
933 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  31.1 
 
 
292 aa  142  6e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  32.4 
 
 
751 aa  142  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  33.58 
 
 
754 aa  142  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  32.97 
 
 
728 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  42.22 
 
 
323 aa  142  7e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2928  putative patatin-like phospholipase  32.38 
 
 
317 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793052  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  32.67 
 
 
330 aa  141  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  32.67 
 
 
348 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  36.33 
 
 
707 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  30.98 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  31.6 
 
 
735 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  30.22 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  33.33 
 
 
803 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  44.13 
 
 
335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  32.68 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  30.98 
 
 
347 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  30.98 
 
 
347 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  30 
 
 
305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  30 
 
 
306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  30 
 
 
305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  33.33 
 
 
803 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>