More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0838 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0605  patatin  61.95 
 
 		 767 aa  750    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  100 
 
 		 667 aa  1352    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  52.53 
 
 		 933 aa  572  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  52.53 
 
 		 728 aa  571  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  52.53 
 
 		 945 aa  572  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  52.18 
 
 		 813 aa  568  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  53.66 
 
 		 803 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  53.66 
 
 		 803 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  51.76 
 
 		 920 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  51.76 
 
 		 930 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  52.78 
 
 		 804 aa  559  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  52.04 
 
 		 714 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  51.8 
 
 		 798 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  51.8 
 
 		 796 aa  561  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  53.31 
 
 		 803 aa  558  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  53.12 
 
 		 852 aa  554  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  41.05 
 
 		 777 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  41.03 
 
 		 753 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  39 
 
 		 790 aa  351  2e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  38.64 
 
 		 750 aa  345  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  35.64 
 
 		 748 aa  316  7e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  34.27 
 
 		 727 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  35.14 
 
 		 733 aa  310  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  35.25 
 
 		 738 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  35.25 
 
 		 738 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  35.55 
 
 		 738 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  35.25 
 
 		 737 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  35.38 
 
 		 738 aa  301  4e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  35.2 
 
 		 739 aa  300  4e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  35.25 
 
 		 738 aa  300  5e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  36.3 
 
 		 745 aa  300  7e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  36.14 
 
 		 728 aa  300  7e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  36.01 
 
 		 728 aa  299  9e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  34.21 
 
 		 751 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  33.86 
 
 		 728 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  34.52 
 
 		 754 aa  298  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  34.68 
 
 		 736 aa  296  9e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  34.04 
 
 		 728 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  36.48 
 
 		 741 aa  293  6e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  35.78 
 
 		 737 aa  293  6e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  33.16 
 
 		 751 aa  291  4e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  35.54 
 
 		 738 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  33.5 
 
 		 728 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  32.87 
 
 		 735 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  33.68 
 
 		 737 aa  281  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  33.21 
 
 		 735 aa  281  4e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  36.53 
 
 		 738 aa  280  6e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  33.45 
 
 		 734 aa  277  5e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  31.61 
 
 		 771 aa  270  5.9999999999999995e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  31.53 
 
 		 776 aa  265  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  31.41 
 
 		 764 aa  249  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0465  patatin  30.76 
 
 		 729 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1334  patatin-like protein of phospholipase family protein  33.48 
 
 		 745 aa  244  3.9999999999999997e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  30.68 
 
 		 733 aa  228  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  28.95 
 
 		 760 aa  224  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  30.18 
 
 		 740 aa  205  3e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  28.26 
 
 		 740 aa  187  5e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  33.74 
 
 		 707 aa  182  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  36.1 
 
 		 746 aa  183  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  31.81 
 
 		 720 aa  179  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  35.62 
 
 		 333 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  36.73 
 
 		 311 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  37.38 
 
 		 358 aa  160  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  34.97 
 
 		 320 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  34.97 
 
 		 320 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  40.07 
 
 		 293 aa  158  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  34.49 
 
 		 256 aa  156  9e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  36.34 
 
 		 316 aa  156  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  38.97 
 
 		 950 aa  155  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  37.68 
 
 		 981 aa  155  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  36.51 
 
 		 315 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  35.2 
 
 		 474 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  35.18 
 
 		 317 aa  152  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  35.2 
 
 		 306 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  35.29 
 
 		 909 aa  151  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  35.2 
 
 		 347 aa  151  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  35.2 
 
 		 347 aa  151  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  37.67 
 
 		 923 aa  150  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  34.87 
 
 		 347 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  35.84 
 
 		 330 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  36.69 
 
 		 302 aa  149  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  35.66 
 
 		 306 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  35.22 
 
 		 320 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  35.66 
 
 		 305 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  35.66 
 
 		 305 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  36.69 
 
 		 308 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  35.37 
 
 		 302 aa  147  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  35.5 
 
 		 358 aa  147  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  35.66 
 
 		 349 aa  147  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  34.88 
 
 		 318 aa  146  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  34.38 
 
 		 311 aa  146  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  35.49 
 
 		 318 aa  146  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  36.79 
 
 		 273 aa  146  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  40.35 
 
 		 323 aa  146  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  32.47 
 
 		 275 aa  145  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  32.46 
 
 		 292 aa  146  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  32.26 
 
 		 263 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  35.03 
 
 		 302 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0981  hypothetical protein  32.79 
 
 		 292 aa  144  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  31.29 
 
 		 275 aa  144  4e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>