More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1864 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1864  patatin  100 
 
 		 293 aa  592  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  58.24 
 
 		 323 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  53.2 
 
 		 311 aa  297  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  53 
 
 		 316 aa  291  8e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  49.34 
 
 		 318 aa  286  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  49.01 
 
 		 318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  50.34 
 
 		 330 aa  281  8.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  53.46 
 
 		 319 aa  275  9e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  54.15 
 
 		 302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  48.63 
 
 		 348 aa  271  9e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  52.09 
 
 		 345 aa  269  4e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  52.38 
 
 		 346 aa  267  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  53.88 
 
 		 317 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  51.87 
 
 		 306 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  51.87 
 
 		 474 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  51.87 
 
 		 347 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  53.49 
 
 		 315 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  51.87 
 
 		 347 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  51.87 
 
 		 347 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  51.19 
 
 		 346 aa  264  2e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  51.19 
 
 		 346 aa  263  3e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  52.11 
 
 		 349 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  52.11 
 
 		 302 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  52.11 
 
 		 306 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  52.11 
 
 		 305 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  52.11 
 
 		 305 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  47.99 
 
 		 301 aa  261  6.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  51.72 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  52.45 
 
 		 358 aa  261  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  51.72 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  51.41 
 
 		 308 aa  258  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  49.82 
 
 		 327 aa  256  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  54.13 
 
 		 358 aa  256  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  53.97 
 
 		 298 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  51.26 
 
 		 347 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  51.26 
 
 		 347 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  43.55 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  36.88 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  38.14 
 
 		 335 aa  200  3e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  42.23 
 
 		 262 aa  198  9e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  43.65 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  42.56 
 
 		 320 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  43.25 
 
 		 320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  43.25 
 
 		 320 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  55.02 
 
 		 223 aa  195  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  41.04 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  41.13 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  41.13 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  41.13 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  41.13 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  41.13 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  41.13 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  41.13 
 
 		 263 aa  183  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  37.1 
 
 		 256 aa  183  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  40.73 
 
 		 263 aa  183  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  40.73 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  40.73 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  37.9 
 
 		 263 aa  179  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  37.1 
 
 		 260 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1099  Patatin  45.33 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2248  patatin  35.33 
 
 		 346 aa  176  5e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000483093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  37.55 
 
 		 272 aa  175  8e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  37.93 
 
 		 275 aa  171  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  39.36 
 
 		 324 aa  169  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  38.22 
 
 		 275 aa  168  8e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  38.87 
 
 		 300 aa  168  9e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1250  Patatin  41 
 
 		 315 aa  168  9e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  37.58 
 
 		 728 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  38.15 
 
 		 751 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  36.78 
 
 		 275 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  36.33 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  38.06 
 
 		 728 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  38.06 
 
 		 727 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  47.34 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  40.28 
 
 		 667 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  48.09 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  33.72 
 
 		 259 aa  155  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  36.9 
 
 		 310 aa  155  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  35.64 
 
 		 343 aa  155  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  37.32 
 
 		 733 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  46.99 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  34.85 
 
 		 314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  47.51 
 
 		 310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  34.3 
 
 		 754 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  40.88 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  36.01 
 
 		 316 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  33.95 
 
 		 751 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  38.28 
 
 		 813 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  36.9 
 
 		 280 aa  152  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  37.93 
 
 		 933 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  37.93 
 
 		 920 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  34.27 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  37.93 
 
 		 945 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  37.93 
 
 		 930 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  33.94 
 
 		 741 aa  150  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  37.93 
 
 		 728 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  35.69 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  34.95 
 
 		 738 aa  149  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  29.69 
 
 		 310 aa  149  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  37.59 
 
 		 852 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>