More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1180 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  100 
 
 		 223 aa  441  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  70.89 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  76.76 
 
 		 298 aa  282  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  69.61 
 
 		 308 aa  251  6e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  64.29 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  56.31 
 
 		 358 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  57.42 
 
 		 315 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  59.41 
 
 		 323 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  59.43 
 
 		 311 aa  232  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  58.05 
 
 		 317 aa  231  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  57.35 
 
 		 358 aa  230  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  59.9 
 
 		 319 aa  229  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  56.59 
 
 		 306 aa  228  8e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  56.59 
 
 		 347 aa  227  9e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  56.59 
 
 		 347 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  57.14 
 
 		 474 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  56.59 
 
 		 347 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  57.75 
 
 		 349 aa  224  8e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  57.29 
 
 		 318 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  57.29 
 
 		 318 aa  222  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  57.14 
 
 		 293 aa  220  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  59.46 
 
 		 301 aa  220  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  56.38 
 
 		 302 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  55.32 
 
 		 305 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  55.32 
 
 		 306 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  55.32 
 
 		 305 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  55.85 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  54.79 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  49.08 
 
 		 330 aa  193  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  56.52 
 
 		 302 aa  193  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  46.19 
 
 		 335 aa  186  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  50.81 
 
 		 346 aa  186  3e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  50.81 
 
 		 346 aa  186  3e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  55.49 
 
 		 347 aa  185  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  55.49 
 
 		 347 aa  185  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  52.43 
 
 		 346 aa  184  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  45.21 
 
 		 334 aa  184  9e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  48.62 
 
 		 348 aa  183  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  48.04 
 
 		 345 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  45.79 
 
 		 320 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  48.09 
 
 		 333 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2248  patatin  47.03 
 
 		 346 aa  159  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000483093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  49.15 
 
 		 311 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  47.54 
 
 		 320 aa  158  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1099  Patatin  54.93 
 
 		 216 aa  158  7e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  47.54 
 
 		 320 aa  158  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  44.86 
 
 		 273 aa  154  7e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  47.15 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  47.25 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  45.51 
 
 		 262 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  44.33 
 
 		 323 aa  149  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  44.38 
 
 		 324 aa  148  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  40.56 
 
 		 263 aa  147  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  38.89 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1250  Patatin  49.08 
 
 		 315 aa  146  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  40 
 
 		 263 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  42.78 
 
 		 276 aa  145  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  40.56 
 
 		 263 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  40.56 
 
 		 263 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  40.56 
 
 		 263 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  40 
 
 		 263 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  40 
 
 		 263 aa  144  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  40 
 
 		 263 aa  144  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  40 
 
 		 263 aa  144  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  41.97 
 
 		 335 aa  144  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  45.21 
 
 		 316 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  45.21 
 
 		 316 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  40 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  44.81 
 
 		 322 aa  142  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  45.3 
 
 		 310 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  43.72 
 
 		 354 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  43.26 
 
 		 315 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  36.76 
 
 		 287 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  39.13 
 
 		 272 aa  137  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  40.84 
 
 		 323 aa  136  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  41.82 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  43.24 
 
 		 311 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  44.69 
 
 		 335 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  36.76 
 
 		 275 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  36.36 
 
 		 746 aa  132  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  37.09 
 
 		 751 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  37.09 
 
 		 728 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  37.09 
 
 		 728 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  36.02 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2220  Patatin  44.2 
 
 		 351 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0960823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2263  patatin  44.04 
 
 		 352 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.622551  normal  0.202768 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  40.34 
 
 		 250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  37.09 
 
 		 727 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  36.76 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  42.61 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  36.36 
 
 		 760 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2538  Patatin  42.71 
 
 		 352 aa  129  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.54485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  41.21 
 
 		 343 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1647  patatin  40.28 
 
 		 373 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  35.81 
 
 		 299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0353  Patatin  39.01 
 
 		 321 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016762 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  37.5 
 
 		 253 aa  128  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  40.45 
 
 		 327 aa  128  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  38.35 
 
 		 345 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  40.66 
 
 		 305 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>