More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1099 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1099  Patatin  100 
 
 		 216 aa  436  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  88.43 
 
 		 301 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  61.4 
 
 		 318 aa  274  7e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  61.4 
 
 		 318 aa  274  9e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  62.79 
 
 		 319 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  59.35 
 
 		 316 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  57.21 
 
 		 311 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  53.02 
 
 		 302 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  52.56 
 
 		 308 aa  228  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  52.56 
 
 		 302 aa  228  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  52.56 
 
 		 306 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  52.56 
 
 		 305 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  52.56 
 
 		 305 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  53.02 
 
 		 347 aa  226  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  53.02 
 
 		 474 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  53.02 
 
 		 347 aa  226  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  53.02 
 
 		 306 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  53.02 
 
 		 347 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  52.56 
 
 		 349 aa  226  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  53.02 
 
 		 347 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  52.56 
 
 		 358 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  53.02 
 
 		 347 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  51.63 
 
 		 315 aa  223  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  51.63 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  53.5 
 
 		 327 aa  211  7e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  52.28 
 
 		 358 aa  209  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  53.57 
 
 		 298 aa  207  7e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  47.66 
 
 		 323 aa  202  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  44.86 
 
 		 308 aa  191  9e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  45.33 
 
 		 293 aa  190  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  47.44 
 
 		 302 aa  189  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  44.44 
 
 		 346 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  44.44 
 
 		 346 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  44.65 
 
 		 330 aa  178  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  44.86 
 
 		 346 aa  174  9e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  43.93 
 
 		 345 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  44.39 
 
 		 348 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  54.93 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  36.49 
 
 		 311 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  33.96 
 
 		 256 aa  128  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  32.37 
 
 		 263 aa  125  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  32.37 
 
 		 263 aa  124  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  35.35 
 
 		 262 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  32.37 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  31.25 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  31.25 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  31.25 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  31.25 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  31.25 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  31.88 
 
 		 263 aa  121  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  31.25 
 
 		 263 aa  121  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  31.25 
 
 		 263 aa  121  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  34.42 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  33.95 
 
 		 320 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  33.95 
 
 		 320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  33.49 
 
 		 333 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  33.47 
 
 		 334 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  32.23 
 
 		 324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  30.14 
 
 		 260 aa  108  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  33.64 
 
 		 320 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  30.8 
 
 		 335 aa  107  9.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  30.94 
 
 		 304 aa  106  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  33.66 
 
 		 300 aa  104  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  38.75 
 
 		 803 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  38.75 
 
 		 803 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  38.75 
 
 		 803 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  39.26 
 
 		 852 aa  101  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  35.59 
 
 		 667 aa  101  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  31.55 
 
 		 253 aa  101  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  38.89 
 
 		 728 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  38.89 
 
 		 930 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  38.89 
 
 		 933 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  38.89 
 
 		 920 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  38.89 
 
 		 945 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  38.89 
 
 		 714 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  30.84 
 
 		 280 aa  99.8  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  36.88 
 
 		 804 aa  99.4  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  30.67 
 
 		 300 aa  98.6  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  38.12 
 
 		 796 aa  98.6  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  38.12 
 
 		 798 aa  98.6  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0062  hypothetical protein  27.98 
 
 		 286 aa  98.2  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.968802  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  37.5 
 
 		 813 aa  97.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1321  patatin  26.57 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  30.23 
 
 		 272 aa  96.7  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2248  patatin  34.07 
 
 		 346 aa  96.3  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000483093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  35.52 
 
 		 727 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  45.63 
 
 		 335 aa  96.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  31.21 
 
 		 259 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  34.97 
 
 		 728 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1250  Patatin  31.4 
 
 		 315 aa  94.7  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2444  patatin  30.64 
 
 		 312 aa  94.7  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  29.57 
 
 		 316 aa  94.4  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  29.57 
 
 		 316 aa  94.4  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  32.97 
 
 		 738 aa  94  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  34.97 
 
 		 728 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  34.97 
 
 		 751 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  33.5 
 
 		 310 aa  94  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  34.52 
 
 		 748 aa  93.6  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  28.77 
 
 		 275 aa  93.2  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  32.51 
 
 		 728 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>