More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4884 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  72.01 
 
 		 933 aa  1073    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  100 
 
 		 798 aa  1618    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  72.18 
 
 		 920 aa  1081    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  85.7 
 
 		 804 aa  1347    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  72.26 
 
 		 728 aa  1068    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  86.71 
 
 		 803 aa  1355    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  73.32 
 
 		 852 aa  1099    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  49.53 
 
 		 767 aa  662    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  86.46 
 
 		 803 aa  1348    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  72.18 
 
 		 930 aa  1080    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  85.82 
 
 		 813 aa  1362    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  72.01 
 
 		 945 aa  1073    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  96.38 
 
 		 796 aa  1492    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  86.71 
 
 		 803 aa  1355    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  72.35 
 
 		 714 aa  1055    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  51.24 
 
 		 667 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  35.89 
 
 		 790 aa  414  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  36.58 
 
 		 777 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  37.09 
 
 		 750 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  35.9 
 
 		 753 aa  405  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  34.53 
 
 		 745 aa  372  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  32.92 
 
 		 727 aa  353  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  33.06 
 
 		 733 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  31.85 
 
 		 728 aa  343  7e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  32.42 
 
 		 728 aa  341  4e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  31.89 
 
 		 728 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  31.79 
 
 		 738 aa  336  1e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  31.79 
 
 		 738 aa  336  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  31.79 
 
 		 737 aa  336  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  31.76 
 
 		 751 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  31.87 
 
 		 738 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  31.95 
 
 		 737 aa  331  3e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  31.63 
 
 		 736 aa  330  6e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  31.32 
 
 		 738 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  31.32 
 
 		 738 aa  328  3e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  30.91 
 
 		 741 aa  325  2e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  31.43 
 
 		 739 aa  323  8e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  31.22 
 
 		 748 aa  323  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  30.96 
 
 		 738 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  31.49 
 
 		 734 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  31.79 
 
 		 728 aa  313  9e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  31.51 
 
 		 728 aa  310  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  30.89 
 
 		 737 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  31.03 
 
 		 738 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  29.13 
 
 		 735 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  30.59 
 
 		 754 aa  301  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  29.34 
 
 		 751 aa  297  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0465  patatin  28.67 
 
 		 729 aa  293  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  29.5 
 
 		 735 aa  290  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  30.89 
 
 		 764 aa  288  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1334  patatin-like protein of phospholipase family protein  29.75 
 
 		 745 aa  283  7.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  29 
 
 		 776 aa  266  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  29.2 
 
 		 771 aa  266  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  29.12 
 
 		 733 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  26.27 
 
 		 760 aa  213  7.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  26.6 
 
 		 740 aa  209  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  31.59 
 
 		 740 aa  201  3.9999999999999996e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  25.17 
 
 		 720 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  36.08 
 
 		 707 aa  185  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  37.54 
 
 		 311 aa  180  8e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  29.72 
 
 		 746 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  38.41 
 
 		 320 aa  174  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  38.41 
 
 		 320 aa  174  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  38.25 
 
 		 333 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  36.49 
 
 		 256 aa  170  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  36.1 
 
 		 259 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  37.93 
 
 		 302 aa  165  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  39.16 
 
 		 349 aa  164  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  38.81 
 
 		 306 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  38.11 
 
 		 308 aa  163  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  38.81 
 
 		 305 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  38.81 
 
 		 305 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  36.09 
 
 		 317 aa  162  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  34.34 
 
 		 923 aa  162  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  38.81 
 
 		 347 aa  161  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  37.5 
 
 		 894 aa  161  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  37.76 
 
 		 302 aa  161  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  37.36 
 
 		 320 aa  161  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  35.49 
 
 		 981 aa  160  7e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  36.63 
 
 		 315 aa  160  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  37.37 
 
 		 347 aa  160  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  38.06 
 
 		 306 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  37.37 
 
 		 474 aa  160  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  37.37 
 
 		 347 aa  160  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  37.15 
 
 		 330 aa  159  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  37.06 
 
 		 273 aa  159  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  37.41 
 
 		 302 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1840  Patatin  36.28 
 
 		 900 aa  158  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  37.99 
 
 		 950 aa  158  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  35.21 
 
 		 253 aa  157  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  37.37 
 
 		 358 aa  157  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  36.94 
 
 		 875 aa  156  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  35.83 
 
 		 345 aa  155  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  32.86 
 
 		 263 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  36.1 
 
 		 323 aa  155  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  32.65 
 
 		 260 aa  154  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  33.43 
 
 		 318 aa  154  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  33.15 
 
 		 318 aa  154  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  35.35 
 
 		 358 aa  153  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  36.9 
 
 		 293 aa  152  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>