More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2385 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1840  Patatin  48.4 
 
 		 900 aa  858    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  60.02 
 
 		 875 aa  1104    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  50.48 
 
 		 981 aa  926    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  49.94 
 
 		 909 aa  902    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  60.51 
 
 		 950 aa  1115    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  100 
 
 		 894 aa  1843    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  59.33 
 
 		 923 aa  1112    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  37.65 
 
 		 728 aa  183  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  37.8 
 
 		 751 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  37.54 
 
 		 727 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  37.5 
 
 		 728 aa  180  9e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  37.33 
 
 		 728 aa  174  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  35.11 
 
 		 740 aa  171  5e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  35.95 
 
 		 728 aa  171  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  35.37 
 
 		 728 aa  171  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  37.37 
 
 		 733 aa  169  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  37.5 
 
 		 767 aa  169  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  35.42 
 
 		 751 aa  157  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  31.16 
 
 		 740 aa  157  9e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  31.91 
 
 		 775 aa  156  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  34.27 
 
 		 741 aa  157  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  36.4 
 
 		 790 aa  155  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  31.94 
 
 		 720 aa  155  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  35.64 
 
 		 738 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  38.55 
 
 		 798 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  38.55 
 
 		 796 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  37.82 
 
 		 803 aa  153  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  35.9 
 
 		 738 aa  153  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  35.9 
 
 		 738 aa  153  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  37.82 
 
 		 803 aa  153  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  37.82 
 
 		 804 aa  152  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  38.13 
 
 		 852 aa  153  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  34.74 
 
 		 754 aa  152  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  37.45 
 
 		 803 aa  152  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  32.11 
 
 		 748 aa  152  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  35.93 
 
 		 735 aa  152  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  34.64 
 
 		 734 aa  151  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  37.55 
 
 		 930 aa  150  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  37.55 
 
 		 920 aa  150  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  35.06 
 
 		 737 aa  150  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  37.55 
 
 		 728 aa  150  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  34.88 
 
 		 739 aa  150  9e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  37.55 
 
 		 933 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  37.55 
 
 		 945 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1334  patatin-like protein of phospholipase family protein  36.4 
 
 		 745 aa  148  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  33.7 
 
 		 737 aa  148  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  33.7 
 
 		 738 aa  148  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  33.7 
 
 		 738 aa  148  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  33.7 
 
 		 736 aa  147  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  29.01 
 
 		 733 aa  146  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  33.33 
 
 		 738 aa  146  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  31.4 
 
 		 735 aa  145  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  36.63 
 
 		 813 aa  145  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  34.71 
 
 		 777 aa  145  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  35.49 
 
 		 750 aa  144  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  33.91 
 
 		 753 aa  144  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  34.69 
 
 		 667 aa  143  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  37.41 
 
 		 714 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  32.87 
 
 		 737 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  32.36 
 
 		 738 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  30.79 
 
 		 746 aa  141  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  28.26 
 
 		 760 aa  136  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  32.57 
 
 		 771 aa  134  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  30.99 
 
 		 745 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  35.21 
 
 		 707 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  32.53 
 
 		 776 aa  130  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  28.32 
 
 		 275 aa  119  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  35.32 
 
 		 315 aa  118  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  28.46 
 
 		 275 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  29.14 
 
 		 764 aa  117  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  29.79 
 
 		 310 aa  117  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  30.69 
 
 		 256 aa  117  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  27.72 
 
 		 275 aa  117  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  30 
 
 		 311 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  35.53 
 
 		 323 aa  115  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  28.62 
 
 		 320 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  28.97 
 
 		 320 aa  114  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  28.06 
 
 		 272 aa  114  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  29.41 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  29.41 
 
 		 346 aa  114  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  31.84 
 
 		 319 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  30.23 
 
 		 310 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  29.41 
 
 		 346 aa  113  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  32.36 
 
 		 302 aa  112  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  34.12 
 
 		 335 aa  112  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  28.28 
 
 		 333 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  29.79 
 
 		 250 aa  111  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  28.48 
 
 		 318 aa  111  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  32 
 
 		 308 aa  111  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  27.92 
 
 		 345 aa  110  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  25.86 
 
 		 260 aa  110  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  28.17 
 
 		 311 aa  110  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  31.96 
 
 		 358 aa  110  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  28.87 
 
 		 318 aa  109  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  31.27 
 
 		 306 aa  110  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  31.64 
 
 		 474 aa  110  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  30.88 
 
 		 323 aa  109  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  29.07 
 
 		 302 aa  110  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  32 
 
 		 302 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  32.02 
 
 		 323 aa  109  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>