More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03596 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  100 
 
 
345 aa  687    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  68.44 
 
 
346 aa  475  1e-133  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  69.32 
 
 
346 aa  477  1e-133  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  76.71 
 
 
346 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  71.34 
 
 
330 aa  440  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  66.86 
 
 
348 aa  438  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  63.02 
 
 
302 aa  332  6e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  53.58 
 
 
311 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  53.47 
 
 
316 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  51.76 
 
 
358 aa  272  7e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  52.92 
 
 
293 aa  270  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  51.64 
 
 
474 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  51.64 
 
 
306 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  52.36 
 
 
347 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  54.47 
 
 
308 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  51.64 
 
 
347 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  51.64 
 
 
347 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  53.79 
 
 
306 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  53.79 
 
 
305 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  53.79 
 
 
305 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  54.47 
 
 
349 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  53.05 
 
 
302 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  49.46 
 
 
315 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  49.31 
 
 
323 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  52.67 
 
 
302 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  48.34 
 
 
319 aa  256  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  49.65 
 
 
358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  48.65 
 
 
318 aa  252  6e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  48.65 
 
 
318 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  47.57 
 
 
317 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  51.64 
 
 
347 aa  238  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  51.64 
 
 
347 aa  238  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  48.4 
 
 
308 aa  235  8e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  48.25 
 
 
301 aa  229  7e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  48.79 
 
 
298 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  45.07 
 
 
327 aa  219  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  43.24 
 
 
311 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  44.19 
 
 
320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  44.19 
 
 
320 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  43.82 
 
 
333 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  36.19 
 
 
335 aa  191  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  36.83 
 
 
334 aa  189  5e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  41.14 
 
 
320 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2248  patatin  41.55 
 
 
346 aa  176  7e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000483093  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  35.26 
 
 
323 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1250  Patatin  42.11 
 
 
315 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  35.38 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  36.4 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  34.78 
 
 
275 aa  162  9e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  36.44 
 
 
256 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  35.18 
 
 
260 aa  160  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  47.67 
 
 
223 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  36.48 
 
 
751 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  36.91 
 
 
343 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  36.16 
 
 
728 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  36.74 
 
 
343 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1099  Patatin  43.23 
 
 
216 aa  156  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  36.33 
 
 
727 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  36.57 
 
 
345 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  36.74 
 
 
728 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  38.4 
 
 
273 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  36.13 
 
 
390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  35.79 
 
 
276 aa  153  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1418  patatin  33.96 
 
 
333 aa  153  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.84629  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  35 
 
 
300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  35.02 
 
 
263 aa  152  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  35.38 
 
 
348 aa  152  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  36.02 
 
 
263 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  35.57 
 
 
311 aa  151  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  36.02 
 
 
263 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  36.02 
 
 
263 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  36.02 
 
 
263 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  35.63 
 
 
263 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  36.02 
 
 
263 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  36.02 
 
 
263 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  36.02 
 
 
263 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  34.37 
 
 
347 aa  151  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  37.5 
 
 
262 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  35.63 
 
 
263 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  34.94 
 
 
324 aa  149  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  32.79 
 
 
310 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  45.41 
 
 
322 aa  147  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  35.25 
 
 
263 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  38.19 
 
 
803 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  37.54 
 
 
327 aa  146  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  34.82 
 
 
252 aa  145  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  46.37 
 
 
327 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  37.85 
 
 
803 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  37.85 
 
 
803 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  33.97 
 
 
733 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  37.85 
 
 
804 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  33.43 
 
 
790 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  33.45 
 
 
299 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2444  patatin  34.8 
 
 
312 aa  144  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  36.18 
 
 
253 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2928  putative patatin-like phospholipase  34.2 
 
 
317 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793052  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1851  Patatin  32.16 
 
 
320 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  normal  0.0299677 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  31.4 
 
 
310 aa  142  7e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1553  Patatin  34.2 
 
 
317 aa  142  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  42.63 
 
 
304 aa  142  9e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>