More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002569 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  100 
 
 
776 aa  1584    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  63.78 
 
 
764 aa  979    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  80.26 
 
 
771 aa  1282    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  37.57 
 
 
738 aa  499  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  38.53 
 
 
737 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  37.39 
 
 
738 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  38.75 
 
 
737 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  37.69 
 
 
738 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  38.42 
 
 
738 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  37.82 
 
 
738 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  39.24 
 
 
738 aa  483  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  37.99 
 
 
738 aa  485  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  38.5 
 
 
736 aa  482  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  37.45 
 
 
735 aa  478  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  38.39 
 
 
739 aa  478  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  36.83 
 
 
751 aa  476  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  38.45 
 
 
734 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  37.21 
 
 
754 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  36.46 
 
 
737 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  34.74 
 
 
735 aa  434  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1334  patatin-like protein of phospholipase family protein  35.29 
 
 
745 aa  422  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425162  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  34.39 
 
 
745 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  33.16 
 
 
741 aa  387  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  34.06 
 
 
750 aa  362  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  32.82 
 
 
748 aa  356  1e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  31.54 
 
 
727 aa  347  6e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  32.89 
 
 
777 aa  343  8e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  32.26 
 
 
728 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  32.26 
 
 
728 aa  336  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  31.28 
 
 
728 aa  333  9e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  31.01 
 
 
728 aa  332  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  30.83 
 
 
751 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  30.81 
 
 
733 aa  327  6e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  30.7 
 
 
728 aa  327  6e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  31.08 
 
 
753 aa  292  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  28.92 
 
 
790 aa  283  6.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  31.53 
 
 
667 aa  281  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  28.99 
 
 
767 aa  280  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  29.17 
 
 
796 aa  276  9e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  29.34 
 
 
798 aa  272  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  28.61 
 
 
813 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  28.5 
 
 
803 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  29.33 
 
 
930 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  29.33 
 
 
920 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  28.76 
 
 
803 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  28.76 
 
 
803 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  28.99 
 
 
933 aa  260  6e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  28.99 
 
 
945 aa  260  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  28.85 
 
 
728 aa  260  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  28.76 
 
 
714 aa  255  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  27.96 
 
 
804 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  28.16 
 
 
852 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0465  patatin  28.93 
 
 
729 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  28.74 
 
 
733 aa  214  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  30.96 
 
 
740 aa  201  3e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  27.51 
 
 
760 aa  201  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  26.87 
 
 
740 aa  191  4e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  24.97 
 
 
720 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  30.98 
 
 
746 aa  181  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  37.16 
 
 
981 aa  160  7e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1840  Patatin  34.35 
 
 
900 aa  153  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  32.98 
 
 
256 aa  152  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  31.27 
 
 
923 aa  150  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  31.64 
 
 
950 aa  147  9e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  31.7 
 
 
909 aa  146  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  33.1 
 
 
311 aa  144  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  34.68 
 
 
707 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  32.53 
 
 
894 aa  142  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  31.17 
 
 
315 aa  141  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  34.03 
 
 
272 aa  140  8.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  33 
 
 
875 aa  140  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  35.61 
 
 
320 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18298  predicted protein  28.88 
 
 
1275 aa  139  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0958  patatin family protein  39.63 
 
 
303 aa  139  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  31.86 
 
 
775 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  30.54 
 
 
260 aa  136  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  38.97 
 
 
323 aa  136  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  31.79 
 
 
263 aa  134  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  29.91 
 
 
323 aa  134  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  31.62 
 
 
275 aa  134  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  32.38 
 
 
333 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  32.38 
 
 
320 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  31.87 
 
 
275 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  32.38 
 
 
320 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  31.68 
 
 
327 aa  132  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  31.09 
 
 
474 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  31.09 
 
 
306 aa  131  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  31.09 
 
 
347 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  31.09 
 
 
347 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  31.02 
 
 
259 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  31.09 
 
 
347 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  32.25 
 
 
253 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  33.95 
 
 
327 aa  129  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  31.25 
 
 
275 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  33.56 
 
 
330 aa  128  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  30.45 
 
 
358 aa  127  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  35.34 
 
 
323 aa  127  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  31.91 
 
 
311 aa  126  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  31.53 
 
 
315 aa  126  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  32.44 
 
 
317 aa  126  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>