More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3827 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  100 
 
 
253 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  43.33 
 
 
256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  46.34 
 
 
272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  42.51 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  46.34 
 
 
273 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  40.24 
 
 
263 aa  199  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  40.24 
 
 
263 aa  192  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  47.37 
 
 
262 aa  191  9e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  43.15 
 
 
311 aa  188  9e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  39.43 
 
 
263 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  39.02 
 
 
263 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  38.62 
 
 
263 aa  186  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  38.62 
 
 
263 aa  186  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  38.62 
 
 
263 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  43.15 
 
 
320 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  38.62 
 
 
263 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  38.62 
 
 
263 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  38.62 
 
 
263 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  43.15 
 
 
320 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  38.62 
 
 
263 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  43.09 
 
 
280 aa  185  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  42.74 
 
 
333 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  34.25 
 
 
310 aa  168  8e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  36.33 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  38.08 
 
 
323 aa  163  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  35.89 
 
 
311 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  36.59 
 
 
728 aa  161  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  35.71 
 
 
275 aa  160  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  37.82 
 
 
707 aa  160  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  35.08 
 
 
316 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  39.57 
 
 
320 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  34.41 
 
 
727 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  36.59 
 
 
330 aa  156  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  34.42 
 
 
767 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  37.3 
 
 
252 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  35.32 
 
 
275 aa  156  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  34.52 
 
 
275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  34.23 
 
 
323 aa  155  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  36.14 
 
 
324 aa  155  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  34.25 
 
 
259 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  35.16 
 
 
302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  33.56 
 
 
323 aa  152  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  34.05 
 
 
728 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  34.05 
 
 
728 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  35.71 
 
 
750 aa  151  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  34.05 
 
 
751 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2711  hypothetical protein  34.13 
 
 
301 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  hitchhiker  0.000234517 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  34.57 
 
 
318 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  35.92 
 
 
308 aa  149  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  34.57 
 
 
318 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  33.87 
 
 
301 aa  149  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  36.1 
 
 
319 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  34.16 
 
 
733 aa  149  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  35.48 
 
 
751 aa  148  8e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  35 
 
 
287 aa  148  9e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  37.96 
 
 
777 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  35.59 
 
 
738 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  35.37 
 
 
346 aa  146  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  34.46 
 
 
920 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  32.66 
 
 
315 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  33.45 
 
 
735 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  34.46 
 
 
930 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  35.14 
 
 
728 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  32.66 
 
 
317 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  34.08 
 
 
852 aa  145  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  35.25 
 
 
798 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  32.98 
 
 
741 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  34.21 
 
 
728 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  35.25 
 
 
796 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  34.76 
 
 
358 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  35.25 
 
 
803 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  35.25 
 
 
803 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  32.73 
 
 
300 aa  145  9e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0958  patatin family protein  38.39 
 
 
303 aa  144  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  34.21 
 
 
933 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  32.52 
 
 
300 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  34.21 
 
 
945 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  35.25 
 
 
803 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  34.72 
 
 
813 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  34.48 
 
 
804 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  34.03 
 
 
298 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  36.18 
 
 
345 aa  143  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  35.14 
 
 
728 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  32.07 
 
 
301 aa  143  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  36.88 
 
 
327 aa  143  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  31.18 
 
 
740 aa  143  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  35.94 
 
 
790 aa  143  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  33.8 
 
 
720 aa  142  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  33.47 
 
 
346 aa  142  4e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  33.47 
 
 
346 aa  142  4e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  32.27 
 
 
349 aa  142  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  31.87 
 
 
306 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  31.87 
 
 
305 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0062  hypothetical protein  32.96 
 
 
286 aa  142  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.968802  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  31.87 
 
 
305 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  32.07 
 
 
304 aa  142  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  32.27 
 
 
302 aa  141  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  35.79 
 
 
748 aa  141  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2444  patatin  33.11 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  32.86 
 
 
734 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>