More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3685 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  100 
 
 		 720 aa  1446    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  31.53 
 
 		 760 aa  251  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  28.44 
 
 		 740 aa  236  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  27.34 
 
 		 751 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  28.2 
 
 		 728 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  27.31 
 
 		 728 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  28.42 
 
 		 727 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  29.22 
 
 		 740 aa  222  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  27.93 
 
 		 728 aa  221  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  28.57 
 
 		 735 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  31.38 
 
 		 748 aa  218  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  28.4 
 
 		 751 aa  213  9e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  27.09 
 
 		 738 aa  212  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  30.51 
 
 		 737 aa  211  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  26.95 
 
 		 750 aa  211  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  29.11 
 
 		 734 aa  210  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  32.44 
 
 		 790 aa  209  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  31.54 
 
 		 753 aa  207  7e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  28.19 
 
 		 777 aa  206  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  29.32 
 
 		 745 aa  205  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  27.02 
 
 		 733 aa  204  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  30.45 
 
 		 754 aa  201  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  37.81 
 
 		 746 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  33.08 
 
 		 737 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  29.24 
 
 		 738 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  29.07 
 
 		 738 aa  198  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  25.49 
 
 		 738 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  27.35 
 
 		 735 aa  197  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  28.74 
 
 		 736 aa  196  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  25.56 
 
 		 737 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  25.49 
 
 		 738 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  25.49 
 
 		 738 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  29.39 
 
 		 739 aa  195  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  28.52 
 
 		 738 aa  192  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  26.89 
 
 		 741 aa  191  4e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  26.68 
 
 		 813 aa  189  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  25.23 
 
 		 796 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  33.33 
 
 		 728 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  26.16 
 
 		 804 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  31.41 
 
 		 767 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  33.5 
 
 		 728 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  25.2 
 
 		 798 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  27.15 
 
 		 764 aa  184  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  25.99 
 
 		 803 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  26.16 
 
 		 803 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  26.16 
 
 		 803 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  31.81 
 
 		 667 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  26.46 
 
 		 852 aa  179  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  25.1 
 
 		 771 aa  177  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  37.01 
 
 		 945 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  37.01 
 
 		 933 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  37.01 
 
 		 920 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  37.55 
 
 		 728 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  37.01 
 
 		 930 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  34.95 
 
 		 909 aa  172  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  24.97 
 
 		 776 aa  170  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  35.14 
 
 		 875 aa  169  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  33.01 
 
 		 950 aa  169  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1334  patatin-like protein of phospholipase family protein  26.65 
 
 		 745 aa  168  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  36.47 
 
 		 714 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1840  Patatin  36 
 
 		 900 aa  165  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  27.34 
 
 		 775 aa  164  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  32.81 
 
 		 923 aa  163  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  32.54 
 
 		 981 aa  162  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  36.91 
 
 		 707 aa  158  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  28.89 
 
 		 733 aa  156  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  31.94 
 
 		 894 aa  155  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  32.52 
 
 		 275 aa  150  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  35.92 
 
 		 260 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  32.17 
 
 		 275 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  34.27 
 
 		 272 aa  147  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  35.56 
 
 		 256 aa  146  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  31.12 
 
 		 275 aa  144  6e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  34.47 
 
 		 320 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  33.8 
 
 		 253 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  34.4 
 
 		 273 aa  140  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  31.12 
 
 		 302 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  31.85 
 
 		 311 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0465  patatin  27.61 
 
 		 729 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  32.06 
 
 		 347 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  32.06 
 
 		 306 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  32.06 
 
 		 474 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  30.77 
 
 		 302 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  31.6 
 
 		 346 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  32.06 
 
 		 347 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  32.06 
 
 		 347 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  34.21 
 
 		 263 aa  135  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  34.21 
 
 		 263 aa  135  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  34.21 
 
 		 263 aa  135  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  34.21 
 
 		 263 aa  135  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  30.72 
 
 		 330 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  33.88 
 
 		 263 aa  134  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  30.07 
 
 		 306 aa  134  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  30.07 
 
 		 305 aa  134  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  30.07 
 
 		 305 aa  134  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  31.27 
 
 		 346 aa  134  6.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  33.88 
 
 		 263 aa  134  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  33.8 
 
 		 263 aa  134  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  30.42 
 
 		 308 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  33.88 
 
 		 263 aa  134  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>