More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1321 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1321  patatin  100 
 
 
253 aa  502  1e-141  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  47.76 
 
 
262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  45.9 
 
 
250 aa  236  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  45.9 
 
 
257 aa  236  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  43.5 
 
 
265 aa  235  7e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1917  Patatin  44.9 
 
 
267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0301  hypothetical protein  44.26 
 
 
259 aa  228  7e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714292  unclonable  0.000000738191 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  32.07 
 
 
298 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  30.8 
 
 
260 aa  159  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  33.87 
 
 
273 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  29.44 
 
 
311 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  31.9 
 
 
727 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  31.9 
 
 
751 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  34.09 
 
 
275 aa  152  5e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  31.9 
 
 
728 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  35.06 
 
 
259 aa  152  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  37.4 
 
 
250 aa  151  8e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  31.54 
 
 
728 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  30.16 
 
 
263 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  30 
 
 
263 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  30.16 
 
 
263 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  33.61 
 
 
262 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  30.8 
 
 
280 aa  149  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  28.74 
 
 
333 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  33.47 
 
 
311 aa  148  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  29.76 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  29.76 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  29.37 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  29.37 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  29.37 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  29.76 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  29.37 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  31.67 
 
 
733 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  31.22 
 
 
327 aa  146  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  28.97 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  32.18 
 
 
275 aa  145  6e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  28.4 
 
 
320 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  27.95 
 
 
320 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  33.45 
 
 
728 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  32.67 
 
 
302 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  29.11 
 
 
728 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  31.3 
 
 
320 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  33.33 
 
 
275 aa  143  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  32.13 
 
 
358 aa  143  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  31.14 
 
 
308 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  32.13 
 
 
308 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  32.27 
 
 
302 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  32.13 
 
 
306 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  32.13 
 
 
305 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  29.64 
 
 
728 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  32.13 
 
 
305 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  31.76 
 
 
315 aa  142  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  33.2 
 
 
347 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  32.13 
 
 
349 aa  141  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  31.58 
 
 
293 aa  141  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  32.13 
 
 
347 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  32.13 
 
 
347 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  32.13 
 
 
306 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  32.13 
 
 
474 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  31.2 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  31.87 
 
 
316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  31.2 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  31.85 
 
 
256 aa  139  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  29 
 
 
323 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  32.67 
 
 
317 aa  138  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  30.08 
 
 
263 aa  137  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  32.67 
 
 
315 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  29.03 
 
 
324 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  31.78 
 
 
319 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  30.89 
 
 
348 aa  134  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  31.95 
 
 
335 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  28.05 
 
 
330 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  32.19 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  36.42 
 
 
317 aa  132  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  29.22 
 
 
272 aa  132  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  29.67 
 
 
301 aa  131  9e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  28 
 
 
323 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  31.62 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  29.64 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  31.22 
 
 
358 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4239  Patatin  32.51 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  31.2 
 
 
347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  31.2 
 
 
347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  28.38 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  26.83 
 
 
345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  29.29 
 
 
346 aa  126  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  31.85 
 
 
740 aa  126  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  27.64 
 
 
346 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  29.15 
 
 
252 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  29.29 
 
 
346 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  28.87 
 
 
734 aa  125  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  32.6 
 
 
760 aa  125  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  31.21 
 
 
741 aa  124  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  31.6 
 
 
335 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  28.88 
 
 
733 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  28.99 
 
 
735 aa  123  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  38.71 
 
 
335 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11081  hypothetical protein  35.33 
 
 
360 aa  122  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000132492  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  29.39 
 
 
302 aa  122  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  28.16 
 
 
323 aa  121  9e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>