More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_2087 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  672    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  79.1 
 
 		 335 aa  528  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2248  patatin  55.56 
 
 		 346 aa  294  1e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000483093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  38.1 
 
 		 293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  39.86 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  41.07 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  40.22 
 
 		 346 aa  189  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  37.46 
 
 		 302 aa  189  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  37.1 
 
 		 311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  40.29 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  36.75 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  37.37 
 
 		 346 aa  184  3e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  38.08 
 
 		 346 aa  183  3e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  37.9 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  38.44 
 
 		 316 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  38.78 
 
 		 317 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  40.36 
 
 		 474 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  40.36 
 
 		 347 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  40.36 
 
 		 347 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  40.36 
 
 		 347 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  39.12 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  40.36 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  36.16 
 
 		 348 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  39.03 
 
 		 349 aa  175  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  38.52 
 
 		 302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  38.52 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  35.83 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  38.52 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  38.52 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  38.15 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  37.41 
 
 		 358 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  37.41 
 
 		 333 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  34.85 
 
 		 320 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  36.86 
 
 		 327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  37.07 
 
 		 320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  37.2 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  38.75 
 
 		 298 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  39.44 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  39.44 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  35.21 
 
 		 311 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1250  Patatin  37.41 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  35.92 
 
 		 273 aa  155  7e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  33.09 
 
 		 308 aa  155  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  34.14 
 
 		 318 aa  155  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  34.05 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  46.59 
 
 		 223 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  33.68 
 
 		 263 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  36.49 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  33.7 
 
 		 319 aa  150  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  33.33 
 
 		 263 aa  149  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  33.33 
 
 		 263 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  33.33 
 
 		 263 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  33.33 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  33.33 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  33.33 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  32.98 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  32.98 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  32.98 
 
 		 263 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  32.28 
 
 		 263 aa  142  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  32.25 
 
 		 256 aa  139  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  31.89 
 
 		 323 aa  139  7.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  33.33 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  30.96 
 
 		 260 aa  135  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  32.26 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  33 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  31.46 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  30.41 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  31.61 
 
 		 345 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  29.18 
 
 		 259 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  31.12 
 
 		 933 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  31.94 
 
 		 348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  31.12 
 
 		 945 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  29.95 
 
 		 751 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  35.81 
 
 		 728 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  31.12 
 
 		 920 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  35.81 
 
 		 930 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  39.67 
 
 		 354 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  31.43 
 
 		 280 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  30.97 
 
 		 390 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1715  patatin  30.55 
 
 		 310 aa  125  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000010772 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1418  patatin  30.9 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.84629  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  30.35 
 
 		 727 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  30.41 
 
 		 728 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  30.28 
 
 		 272 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  32.46 
 
 		 753 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  30.67 
 
 		 728 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  30.56 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  34.67 
 
 		 852 aa  124  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2444  patatin  30.79 
 
 		 312 aa  123  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  30.25 
 
 		 322 aa  122  6e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  30.22 
 
 		 803 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  30.22 
 
 		 803 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  30.22 
 
 		 803 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  29.85 
 
 		 253 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  31.17 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1647  patatin  40 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1683  patatin  32.44 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1661  patatin  32.44 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2697  Patatin  32.44 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00646422  hitchhiker  0.0000697088 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1646  patatin  32.44 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>