More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1250 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1250  Patatin  100 
 
 		 315 aa  627  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  41.22 
 
 		 293 aa  188  9e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  42.11 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  40.56 
 
 		 335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  43.72 
 
 		 327 aa  182  9.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  43.27 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  36.74 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  41.37 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  41.11 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  38.49 
 
 		 334 aa  179  7e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  39.7 
 
 		 318 aa  178  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  39.7 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  40.89 
 
 		 302 aa  175  9e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  38.98 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  43.55 
 
 		 308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  38.24 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2248  patatin  40.07 
 
 		 346 aa  170  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000483093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  37.87 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  37.16 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  36.69 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  38.15 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  37 
 
 		 305 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  37 
 
 		 305 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  37 
 
 		 306 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  35.55 
 
 		 346 aa  165  8e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  38.83 
 
 		 358 aa  165  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  39.7 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  39.7 
 
 		 474 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  37.5 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  39.69 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  38.1 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  39.7 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  37.78 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  42.18 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  38.72 
 
 		 347 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  41.46 
 
 		 346 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  35.97 
 
 		 358 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  37.78 
 
 		 317 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  39.44 
 
 		 320 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  39.44 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  38.71 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  39.44 
 
 		 333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  35.04 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  49.08 
 
 		 223 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  31.47 
 
 		 260 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  38.49 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  38.49 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  47.15 
 
 		 323 aa  142  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  32.11 
 
 		 263 aa  142  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  33.73 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  45.6 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  36.51 
 
 		 273 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  46.37 
 
 		 335 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  31.1 
 
 		 263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  44.17 
 
 		 354 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  45.36 
 
 		 335 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  44.13 
 
 		 300 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  31.1 
 
 		 263 aa  135  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0353  Patatin  44.89 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016762 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  47.73 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  32.1 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  32.1 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  32.1 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  32.1 
 
 		 263 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  43.62 
 
 		 323 aa  132  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  42 
 
 		 390 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  32.44 
 
 		 272 aa  133  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  34.07 
 
 		 275 aa  132  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  31.69 
 
 		 263 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  31.69 
 
 		 263 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  31.69 
 
 		 263 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  38.02 
 
 		 262 aa  132  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  46.2 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  46.2 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  31.28 
 
 		 263 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1944  hypothetical protein  43.58 
 
 		 301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1647  patatin  42.2 
 
 		 373 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  42.36 
 
 		 345 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  34.38 
 
 		 324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01210  hypothetical protein  42.46 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.287845  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2415  Patatin  42.46 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1391  hypothetical protein  43.02 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.4061  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1719  hypothetical protein  42.46 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00963629  normal  0.824632 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1342  hypothetical protein  42.46 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00416031  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2393  hypothetical protein  42.46 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000191972 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1907  hypothetical protein  42.46 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163252  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1881  hypothetical protein  43.02 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.256375  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01220  hypothetical protein  42.46 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.237609  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1383  hypothetical protein  42.46 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.117761  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1399  hypothetical protein  42.46 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1574  hypothetical protein  43.02 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1887  hypothetical protein  43.02 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.261271  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  38.81 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  34.68 
 
 		 253 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  46.86 
 
 		 327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  42.46 
 
 		 315 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  39.81 
 
 		 315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  44.63 
 
 		 322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  41.38 
 
 		 347 aa  129  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2711  hypothetical protein  43.58 
 
 		 301 aa  129  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  hitchhiker  0.000234517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>