More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2248 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2248  patatin  100 
 
 		 346 aa  697    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000483093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  55.56 
 
 		 334 aa  305  9.000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  54.63 
 
 		 335 aa  298  8e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  41.16 
 
 		 323 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  41.7 
 
 		 346 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  38.2 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  41.4 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  41.55 
 
 		 345 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  38.02 
 
 		 330 aa  182  9.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  39.6 
 
 		 348 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  36.79 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  38.21 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  35.31 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  36.48 
 
 		 346 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  36.46 
 
 		 317 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  36.49 
 
 		 315 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  36.97 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  37.14 
 
 		 474 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  37.14 
 
 		 306 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  37.14 
 
 		 347 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  37.14 
 
 		 347 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  37.14 
 
 		 347 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  36.59 
 
 		 349 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  34.95 
 
 		 358 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  36.63 
 
 		 327 aa  159  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  36.68 
 
 		 358 aa  159  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  38.06 
 
 		 298 aa  159  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  37.14 
 
 		 302 aa  159  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1250  Patatin  38.87 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  36.36 
 
 		 308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  36.79 
 
 		 302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  35.89 
 
 		 333 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  36.43 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  36.43 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  36.43 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  35.54 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  35.89 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  34.06 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  35.54 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  33.75 
 
 		 318 aa  153  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  36.62 
 
 		 311 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  35.2 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  35.56 
 
 		 320 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  36.09 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  36.09 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  33.45 
 
 		 273 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  46.24 
 
 		 223 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  33.33 
 
 		 263 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  33.33 
 
 		 263 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  33.33 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  33.33 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  33.33 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  32.98 
 
 		 263 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  32.98 
 
 		 263 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  32.98 
 
 		 263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  31.58 
 
 		 263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  35.09 
 
 		 262 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  32.28 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  32.28 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  30.75 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  34.22 
 
 		 327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  29.93 
 
 		 260 aa  129  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  31.6 
 
 		 256 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  39.11 
 
 		 347 aa  126  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1715  patatin  31.96 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000010772 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  37.37 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  39.79 
 
 		 310 aa  123  6e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  35.02 
 
 		 933 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  35.02 
 
 		 945 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  35.02 
 
 		 920 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  35.02 
 
 		 930 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  35.02 
 
 		 728 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  33.19 
 
 		 804 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  37.13 
 
 		 348 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  29.52 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  33.64 
 
 		 852 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  30.79 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  34.56 
 
 		 813 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  30.03 
 
 		 276 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  34.55 
 
 		 796 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  31.25 
 
 		 300 aa  119  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  31.27 
 
 		 335 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  38.62 
 
 		 354 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  38.86 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  38.86 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  39.67 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  34.42 
 
 		 798 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  29.35 
 
 		 253 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  28.97 
 
 		 259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  29.86 
 
 		 767 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  33.96 
 
 		 714 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  39.04 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  31.27 
 
 		 803 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  39.46 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  31.27 
 
 		 803 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  31.27 
 
 		 803 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  38.12 
 
 		 343 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  37.04 
 
 		 335 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  38.25 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  37.23 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>