More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2157 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  100 
 
 		 257 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  68.95 
 
 		 262 aa  357  9e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  66.27 
 
 		 250 aa  335  3.9999999999999995e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0301  hypothetical protein  60.32 
 
 		 259 aa  316  2e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714292  unclonable  0.000000738191 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1917  Patatin  61.32 
 
 		 267 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  59.27 
 
 		 265 aa  310  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1321  patatin  43.75 
 
 		 253 aa  208  6e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  36.22 
 
 		 324 aa  164  9e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  35.8 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  35.36 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  35.36 
 
 		 320 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  35.36 
 
 		 320 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  34.87 
 
 		 311 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  40.79 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  37.98 
 
 		 316 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  38.94 
 
 		 327 aa  142  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  37.17 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  35.22 
 
 		 275 aa  139  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  39.66 
 
 		 308 aa  139  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  35.23 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  34.13 
 
 		 256 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  36.52 
 
 		 320 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  37.61 
 
 		 319 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  36.4 
 
 		 348 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  36.29 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  37.5 
 
 		 327 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  41.97 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  35.19 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0981  hypothetical protein  40.82 
 
 		 292 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  35.54 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  35.84 
 
 		 318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  35.84 
 
 		 318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  41.4 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  34.57 
 
 		 253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  36.11 
 
 		 302 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  34.58 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  31.02 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  30.72 
 
 		 727 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  35.56 
 
 		 345 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  34.52 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  35.71 
 
 		 302 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  33.89 
 
 		 330 aa  125  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  43.02 
 
 		 335 aa  125  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  30.85 
 
 		 728 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  43.09 
 
 		 323 aa  125  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  36.61 
 
 		 308 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  42.54 
 
 		 315 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  31.43 
 
 		 728 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  36.09 
 
 		 358 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  35.62 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  35.83 
 
 		 349 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  34.92 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  34.92 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  37.89 
 
 		 346 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  34.87 
 
 		 751 aa  123  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  37.89 
 
 		 346 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  34.92 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  32.67 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  44.02 
 
 		 354 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  32.67 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  31.56 
 
 		 728 aa  122  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  30.95 
 
 		 751 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  32.27 
 
 		 263 aa  121  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  32.27 
 
 		 263 aa  121  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  32.27 
 
 		 263 aa  121  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  31.87 
 
 		 263 aa  121  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  32.27 
 
 		 263 aa  121  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  31.87 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  32.73 
 
 		 733 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  32.85 
 
 		 728 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  29.55 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  40.88 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  41.4 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  41.38 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  33.21 
 
 		 728 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  40.82 
 
 		 322 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  40.11 
 
 		 300 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  34.65 
 
 		 358 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  36.21 
 
 		 272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  29.32 
 
 		 263 aa  119  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  30.72 
 
 		 735 aa  119  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  31.03 
 
 		 300 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  34.31 
 
 		 346 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  33.73 
 
 		 306 aa  118  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  35.91 
 
 		 301 aa  118  9e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  34.65 
 
 		 474 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  40.44 
 
 		 323 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  34.65 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  34.65 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  31.47 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  34.65 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  38.12 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  34.17 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  40.74 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  38.19 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  39.51 
 
 		 317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  33.89 
 
 		 738 aa  115  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  41.24 
 
 		 335 aa  115  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0353  Patatin  40.32 
 
 		 321 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016762 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0334  patatin  37.8 
 
 		 279 aa  115  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>