More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4740 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  100 
 
 
252 aa  512  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4239  Patatin  49.79 
 
 
259 aa  240  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  36.86 
 
 
256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  36.03 
 
 
250 aa  172  5.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  36.59 
 
 
256 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  37.4 
 
 
251 aa  162  6e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  32.52 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  32.79 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1162  Patatin  32.94 
 
 
254 aa  136  4e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.02065  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  38.4 
 
 
247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  36.55 
 
 
241 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  29.82 
 
 
728 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  30.85 
 
 
728 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  30.85 
 
 
728 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1881  Patatin  31.3 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00591765  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  31.02 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  32.65 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  32.24 
 
 
263 aa  126  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  31.67 
 
 
263 aa  125  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  32.77 
 
 
324 aa  125  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  31.84 
 
 
263 aa  123  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  31.84 
 
 
263 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  31.82 
 
 
263 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  30.93 
 
 
293 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  31.84 
 
 
263 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  31.84 
 
 
263 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  31.84 
 
 
263 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  31.84 
 
 
263 aa  123  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  31.43 
 
 
263 aa  123  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  31.36 
 
 
707 aa  123  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  32.02 
 
 
265 aa  122  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  30.5 
 
 
727 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  30.1 
 
 
728 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  30.14 
 
 
751 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  30.14 
 
 
728 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  29.63 
 
 
760 aa  120  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  31.6 
 
 
259 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0301  hypothetical protein  31.82 
 
 
259 aa  119  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714292  unclonable  0.000000738191 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1917  Patatin  31.8 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  30.12 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  30.77 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  30.92 
 
 
253 aa  116  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  31.73 
 
 
250 aa  116  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  29.2 
 
 
316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  29.08 
 
 
733 aa  115  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  29.52 
 
 
740 aa  114  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1321  patatin  27.9 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3040  patatin  31.3 
 
 
291 aa  111  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0931939  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  37.75 
 
 
317 aa  111  9e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  30.08 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  28.11 
 
 
311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  30.94 
 
 
276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  30.89 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  30.64 
 
 
320 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  32.04 
 
 
767 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  40.85 
 
 
327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  34.02 
 
 
315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  30.26 
 
 
318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  31.22 
 
 
319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  38.51 
 
 
323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  30.77 
 
 
275 aa  110  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  29.91 
 
 
323 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  29.17 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  29.86 
 
 
740 aa  108  8.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  28.96 
 
 
318 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  28.96 
 
 
318 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3310  patatin-like phospholipase  33.46 
 
 
267 aa  108  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12585  hypothetical protein  31.25 
 
 
583 aa  107  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274213  normal  0.619754 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  30.14 
 
 
310 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  30.43 
 
 
275 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15960  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  29.96 
 
 
276 aa  106  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2309  hypothetical protein  35.8 
 
 
300 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  38.22 
 
 
287 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  30.97 
 
 
312 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11081  hypothetical protein  36.72 
 
 
360 aa  105  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000132492  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  31.39 
 
 
330 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  29.91 
 
 
327 aa  104  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  32.71 
 
 
777 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  27.73 
 
 
311 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  37.11 
 
 
322 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  34.95 
 
 
323 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  31.54 
 
 
273 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  28.92 
 
 
323 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  30.47 
 
 
950 aa  103  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0479  Patatin  30.68 
 
 
293 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.382119  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  29.29 
 
 
741 aa  102  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  36.13 
 
 
341 aa  102  8e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  35.26 
 
 
308 aa  102  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  29.44 
 
 
280 aa  101  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  37.35 
 
 
306 aa  102  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  30.6 
 
 
738 aa  101  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  37.7 
 
 
314 aa  101  9e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  28.26 
 
 
751 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  27.18 
 
 
323 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  34.57 
 
 
349 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1383  hypothetical protein  33.74 
 
 
301 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.117761  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1719  hypothetical protein  33.74 
 
 
314 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00963629  normal  0.824632 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1881  hypothetical protein  34.97 
 
 
301 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.256375  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1342  hypothetical protein  33.74 
 
 
301 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00416031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  34.38 
 
 
305 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>