More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1917 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1917  Patatin  100 
 
 
267 aa  540  9.999999999999999e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  68.48 
 
 
265 aa  360  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0301  hypothetical protein  62.5 
 
 
259 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714292  unclonable  0.000000738191 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  61.94 
 
 
262 aa  324  9e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  61.32 
 
 
257 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  59.51 
 
 
250 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1321  patatin  41.96 
 
 
253 aa  203  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  36.33 
 
 
324 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  34.16 
 
 
728 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  32.74 
 
 
728 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  29.25 
 
 
260 aa  139  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  35.29 
 
 
311 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  36.43 
 
 
316 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  34.15 
 
 
348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  31.67 
 
 
728 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  36.28 
 
 
323 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  32.95 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  32.04 
 
 
727 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  35.5 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  32.58 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  32 
 
 
311 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  32.38 
 
 
728 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  32.38 
 
 
728 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  32.38 
 
 
751 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  34.2 
 
 
320 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  31.23 
 
 
330 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  35.93 
 
 
327 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  35.08 
 
 
302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  32.42 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  34.12 
 
 
319 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  35.74 
 
 
308 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  35.18 
 
 
302 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  35.06 
 
 
305 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  35.06 
 
 
305 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  35.06 
 
 
306 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  34.27 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  32.54 
 
 
346 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  36.33 
 
 
306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  36.33 
 
 
347 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  36.33 
 
 
347 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  36.33 
 
 
474 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  36.33 
 
 
347 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  32.67 
 
 
345 aa  125  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  31.87 
 
 
320 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  29.66 
 
 
733 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  34.09 
 
 
273 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  31.37 
 
 
333 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  35.04 
 
 
349 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1047  patatin  33.94 
 
 
321 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  37.02 
 
 
358 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  31.37 
 
 
320 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  33.6 
 
 
308 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  33.09 
 
 
314 aa  122  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  31.4 
 
 
346 aa  122  8e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  31.4 
 
 
346 aa  122  8e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  30.6 
 
 
707 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  33.75 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  31.01 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  31.74 
 
 
315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  31.73 
 
 
315 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  31.73 
 
 
315 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  31.76 
 
 
323 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  32.05 
 
 
293 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  33.1 
 
 
327 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  30 
 
 
275 aa  118  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  31.79 
 
 
748 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  31.58 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  33.76 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  41.01 
 
 
335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  29.68 
 
 
354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  31.8 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  30.53 
 
 
334 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  30.15 
 
 
275 aa  116  5e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  27.92 
 
 
760 aa  115  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  28.2 
 
 
263 aa  116  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  31.08 
 
 
323 aa  116  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  32.67 
 
 
263 aa  115  6e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  34.55 
 
 
317 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  34.41 
 
 
315 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  30.04 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  30.94 
 
 
326 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  30 
 
 
751 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1162  Patatin  29.25 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.02065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  29.39 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  33.21 
 
 
312 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  34.06 
 
 
358 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  30.26 
 
 
738 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  31.83 
 
 
771 aa  112  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  30.2 
 
 
263 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  30.2 
 
 
263 aa  112  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1920  patatin  41.18 
 
 
277 aa  112  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  28.98 
 
 
263 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  28.98 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  29.39 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  39.25 
 
 
323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  29.12 
 
 
735 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  29.39 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  29.39 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  29.39 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0334  patatin  30.83 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>